More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2285 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2285  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 417 aa  846    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0314  extracellular ligand-binding receptor  32.03 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.568066  normal  0.496718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  31.41 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0645  extracellular ligand-binding receptor  32.07 
 
 		 386 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  29.09 
 
 		 416 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4089  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  28.9 
 
 		 428 aa  123  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120438  normal  0.0681352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1620  extracellular ligand-binding receptor  30.67 
 
 		 408 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.294267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  27.02 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1580  Extracellular ligand-binding receptor  30.89 
 
 		 394 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.18 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  27.74 
 
 		 424 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  28.01 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0317  extracellular ligand-binding receptor  30.03 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00438106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5696  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.668558  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  30.1 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5833  extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 382 aa  116  6e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  30.34 
 
 		 415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 413 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  30.91 
 
 		 415 aa  111  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2965  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 413 aa  111  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.820015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 383 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 383 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 		 378 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  27.3 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 		 384 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  28.61 
 
 		 396 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1830  Extracellular ligand-binding receptor  29.38 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0219  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.4 
 
 		 376 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00187981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  30.4 
 
 		 432 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.52 
 
 		 383 aa  107  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  29.18 
 
 		 419 aa  106  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  30.29 
 
 		 445 aa  107  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  27.91 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0004  extracellular ligand-binding receptor  29.79 
 
 		 417 aa  106  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000538672 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  27.2 
 
 		 387 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 374 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  28.31 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 412 aa  104  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0834  extracellular ligand-binding receptor  28.99 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0460  Extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  30.5 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1706  extracellular ligand-binding receptor  28.66 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0138275 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  29.22 
 
 		 396 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 409 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 		 415 aa  103  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2954  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  26.15 
 
 		 412 aa  102  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.281102  normal  0.041771 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1164  Extracellular ligand-binding receptor  29.15 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1798  extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1847  twin-arginine translocation pathway signal  24.87 
 
 		 416 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.477463  normal  0.553437 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0404  extracellular ligand-binding receptor  27.47 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0168747  normal  0.259327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1948  Extracellular ligand-binding receptor  25.84 
 
 		 415 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.61677  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1665  extracellular ligand-binding receptor  27.94 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.910877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  28.1 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  27.68 
 
 		 402 aa  100  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1838  extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000495341  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3620  twin-arginine translocation pathway signal  26.97 
 
 		 416 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.963637  normal  0.598514 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  29.29 
 
 		 398 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 378 aa  99.8  7e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  29.08 
 
 		 394 aa  99.8  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2884  putative branched-chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.77 
 
 		 414 aa  99.4  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144097 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  31.8 
 
 		 421 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  28.44 
 
 		 404 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6002  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, periplasmic component  27.65 
 
 		 389 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.544878  normal  0.0284097 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  28.13 
 
 		 404 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  28.23 
 
 		 397 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  27.53 
 
 		 370 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0392  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.26 
 
 		 403 aa  98.2  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.224611  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  28.62 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  26.92 
 
 		 413 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  27.96 
 
 		 369 aa  97.1  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0350  extracellular ligand-binding receptor  28.93 
 
 		 376 aa  97.1  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000281139  normal  0.291499 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1098  Extracellular ligand-binding receptor  24.5 
 
 		 416 aa  97.1  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0210365  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 399 aa  97.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4053  extracellular ligand-binding receptor  27.65 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  28.53 
 
 		 390 aa  96.7  7e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0067  Extracellular ligand-binding receptor  28.96 
 
 		 376 aa  96.3  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188079 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  26.44 
 
 		 391 aa  96.7  8e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3521  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8566  Extracellular ligand-binding receptor  28.7 
 
 		 411 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3366  extracellular ligand-binding receptor  28.65 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.453868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3767  Extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 397 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.43 
 
 		 376 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2165  extracellular ligand-binding receptor  25.35 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0915  Extracellular ligand-binding receptor  28.66 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  29.43 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3230  extracellular ligand-binding receptor  32.14 
 
 		 400 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.293864  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  28.98 
 
 		 339 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  27.09 
 
 		 453 aa  95.1  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  28.78 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  28.73 
 
 		 375 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.43 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.43 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  28.83 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  29.43 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>