More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1930 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  79.11 
 
 
627 aa  978    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  66.61 
 
 
621 aa  837    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
625 aa  1258    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  42.72 
 
 
633 aa  461  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  32.23 
 
 
626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  36.48 
 
 
656 aa  281  2e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  39.58 
 
 
563 aa  276  6e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 
713 aa  276  8e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
650 aa  271  2e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  43.9 
 
 
708 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  35.99 
 
 
656 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  43.49 
 
 
566 aa  250  5e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
563 aa  250  6e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.3 
 
 
632 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1932  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 
682 aa  238  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.67 
 
 
630 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
652 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
628 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.08 
 
 
628 aa  231  4e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  26.77 
 
 
643 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0316  methyl-accepting chemotaxis protein  32 
 
 
652 aa  228  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  29.82 
 
 
639 aa  226  7e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  27.61 
 
 
629 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  27.46 
 
 
629 aa  224  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  27.93 
 
 
622 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  28.41 
 
 
623 aa  224  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  31.45 
 
 
627 aa  223  7e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.89 
 
 
626 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.17 
 
 
632 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001423  methyl-accepting chemotaxis protein  27.07 
 
 
623 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.896179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.37 
 
 
626 aa  221  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 
636 aa  221  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0962  methyl-accepting chemotaxis protein  26.8 
 
 
643 aa  219  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000917898  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  30.36 
 
 
627 aa  218  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.79 
 
 
625 aa  217  4e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1741  methyl-accepting chemotaxis protein  30.86 
 
 
623 aa  217  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.59 
 
 
630 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  31.34 
 
 
624 aa  216  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.06 
 
 
609 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 
546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  27.2 
 
 
629 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  29.73 
 
 
653 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  26.92 
 
 
632 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  30.45 
 
 
663 aa  213  1e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.61 
 
 
622 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  28.16 
 
 
629 aa  213  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.47 
 
 
608 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 
633 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  27.26 
 
 
632 aa  211  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  26.85 
 
 
629 aa  211  5e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0908  methyl-accepting chemotaxis protein  29.77 
 
 
633 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000172893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  27.78 
 
 
629 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.5 
 
 
629 aa  208  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3307  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  26.58 
 
 
646 aa  207  4e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154231  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4216  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.8 
 
 
647 aa  207  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  26.6 
 
 
617 aa  207  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  27.2 
 
 
626 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.2 
 
 
630 aa  205  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.12 
 
 
630 aa  205  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3307  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.28 
 
 
596 aa  204  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.298951  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1452  methyl-accepting chemotaxis protein  28.42 
 
 
595 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.19796  normal  0.220045 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2833  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.42 
 
 
595 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.5 
 
 
630 aa  204  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2753  methyl-accepting chemotaxis protein  28.52 
 
 
595 aa  204  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0257893  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  26.83 
 
 
629 aa  203  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  29.42 
 
 
657 aa  203  8e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  26.99 
 
 
658 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.35 
 
 
630 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.5 
 
 
631 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  27.93 
 
 
660 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.11 
 
 
600 aa  202  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.112529 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.05 
 
 
630 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  28.59 
 
 
660 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  28.59 
 
 
660 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  28.59 
 
 
660 aa  201  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  28.59 
 
 
660 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  28.59 
 
 
660 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.62 
 
 
627 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  28.44 
 
 
660 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  32.14 
 
 
596 aa  200  7e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.29 
 
 
660 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2011  methyl-accepting chemotaxis protein  27.41 
 
 
660 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3839  methyl-accepting chemotaxis protein  31.47 
 
 
636 aa  198  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.406017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.54 
 
 
658 aa  198  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.83 
 
 
596 aa  198  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.54 
 
 
658 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  26.69 
 
 
658 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
660 aa  197  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  27.59 
 
 
626 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  26.54 
 
 
658 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1003  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.67 
 
 
596 aa  196  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  26.39 
 
 
658 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  26.54 
 
 
658 aa  196  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.08 
 
 
630 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2121  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 
622 aa  196  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  25.08 
 
 
630 aa  195  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3111  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.99 
 
 
596 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.27 
 
 
599 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2718  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.64 
 
 
599 aa  194  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>