112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1998 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1998  helicase  100 
 
 		 993 aa  1920    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  49.45 
 
 		 991 aa  786    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  43.74 
 
 		 991 aa  622  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  34.99 
 
 		 1001 aa  424  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  35.6 
 
 		 1018 aa  412  1e-113  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  32.45 
 
 		 1049 aa  361  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  32.4 
 
 		 999 aa  353  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  32.69 
 
 		 1053 aa  343  5.999999999999999e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  32.76 
 
 		 1049 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.06 
 
 		 1048 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  32.77 
 
 		 1048 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  31.89 
 
 		 1042 aa  335  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4439  double-strand break repair protein AddB  32.43 
 
 		 1047 aa  330  8e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.522195  normal  0.331635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4903  double-strand break repair protein AddB  32.59 
 
 		 1047 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  31.55 
 
 		 1049 aa  328  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  33.33 
 
 		 1000 aa  325  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3580  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  32.56 
 
 		 1042 aa  323  8e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412943  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  30.25 
 
 		 1052 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  30.31 
 
 		 1052 aa  322  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1052 aa  321  6e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4953  double-strand break repair protein AddB  32.28 
 
 		 1045 aa  320  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28213  normal  0.220152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  31.62 
 
 		 1059 aa  318  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1454  hypothetical protein  34.87 
 
 		 959 aa  316  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  33.81 
 
 		 1040 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  28.49 
 
 		 1047 aa  311  4e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  31.96 
 
 		 1014 aa  303  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  29.34 
 
 		 1016 aa  302  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  32.13 
 
 		 997 aa  302  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  29.87 
 
 		 1064 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  31.89 
 
 		 997 aa  300  6e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4065  hypothetical protein  30.78 
 
 		 986 aa  296  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.633062  normal  0.255669 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  30.66 
 
 		 988 aa  296  2e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  32.76 
 
 		 1037 aa  293  2e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  30.62 
 
 		 1043 aa  287  7e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  28.82 
 
 		 977 aa  284  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  29.52 
 
 		 1064 aa  283  1e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  32.81 
 
 		 1054 aa  282  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  33.72 
 
 		 1015 aa  272  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2174  double-strand break repair protein AddB  29.06 
 
 		 1076 aa  261  3e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  29.61 
 
 		 1062 aa  260  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2795  putative helicase/exonuclease  31.95 
 
 		 980 aa  252  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  21.98 
 
 		 914 aa  177  7e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  20.38 
 
 		 911 aa  173  1e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.37 
 
 		 890 aa  117  1.0000000000000001e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.34 
 
 		 836 aa  103  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  27.49 
 
 		 962 aa  87  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  28.29 
 
 		 958 aa  86.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  29.66 
 
 		 976 aa  85.5  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  26.56 
 
 		 947 aa  82.8  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  29.55 
 
 		 957 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2324  exonuclease-like protein  27.61 
 
 		 864 aa  77.4  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.884454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  25.39 
 
 		 951 aa  71.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  23.12 
 
 		 781 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1284  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  27.88 
 
 		 915 aa  69.7  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.155997 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0524  hypothetical protein  24.71 
 
 		 779 aa  68.2  0.0000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1000 aa  67.8  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1977  putative DNA repair protein  27.59 
 
 		 913 aa  65.5  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.286475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0467  hypothetical protein  27.47 
 
 		 912 aa  65.1  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  24.32 
 
 		 922 aa  63.5  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2194  exonuclease-like protein  26.98 
 
 		 855 aa  63.2  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.759403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  31.44 
 
 		 1100 aa  61.6  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2264  exonuclease-like  26.39 
 
 		 856 aa  60.1  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  24.03 
 
 		 994 aa  60.1  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0722  hypothetical protein  27.78 
 
 		 930 aa  59.7  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.851206  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.32 
 
 		 781 aa  58.9  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  20.68 
 
 		 788 aa  57.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  20.68 
 
 		 788 aa  57.8  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.18 
 
 		 803 aa  57  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  19.45 
 
 		 911 aa  56.2  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1752  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  26.63 
 
 		 940 aa  56.2  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.894533 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  20.68 
 
 		 788 aa  56.2  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0593  exonuclease-like protein  27.17 
 
 		 379 aa  55.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0865179  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  22.63 
 
 		 991 aa  55.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  28.25 
 
 		 989 aa  55.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  25.4 
 
 		 984 aa  54.7  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0873  exonuclease RexB  25.54 
 
 		 1077 aa  54.7  0.000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.458095  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2897  hypothetical protein  29.3 
 
 		 846 aa  54.7  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  23.87 
 
 		 911 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  24.15 
 
 		 1039 aa  52.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  21.64 
 
 		 786 aa  52.4  0.00005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0620  hypothetical protein  40.98 
 
 		 379 aa  52  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0550  ATP-dependent nuclease subunit B-like  22.85 
 
 		 1140 aa  51.6  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.49 
 
 		 957 aa  51.6  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.27 
 
 		 916 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  26.25 
 
 		 1016 aa  50.8  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  32.03 
 
 		 1019 aa  50.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0965  hypothetical protein  29.22 
 
 		 387 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_558  hypothetical protein  24.73 
 
 		 379 aa  49.7  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.92 
 
 		 780 aa  49.3  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1482  RecB family exonuclease-like protein  29.14 
 
 		 302 aa  48.5  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  24.86 
 
 		 997 aa  48.5  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  24.92 
 
 		 896 aa  48.1  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1682  ATP-dependent exonuclease, subunit B  23.38 
 
 		 1106 aa  48.1  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  27.98 
 
 		 1049 aa  47.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1314  ATP-dependent nuclease subunit B  21.94 
 
 		 872 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00191673  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1374  hypothetical protein  21.94 
 
 		 862 aa  47.4  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000886385  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  21.25 
 
 		 951 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  31.33 
 
 		 351 aa  47.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3621  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.68 
 
 		 906 aa  46.6  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.221768  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.12 
 
 		 1228 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>