84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4374 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4374  polymorphic outer membrane protein  100 
 
 
459 aa  894  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  5.85185e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3990  hypothetical protein  69.57 
 
 
439 aa  566  1e-160  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1610  polymorphic outer membrane protein  62.85 
 
 
433 aa  461  1e-128  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1045  polymorphic outer membrane protein  62.82 
 
 
476 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4376  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.53 
 
 
464 aa  391  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.632591  decreased coverage  5.19323e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3415  hypothetical protein  55.72 
 
 
455 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253351  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4391  hypothetical protein  55.58 
 
 
464 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1605  polymorphic outer membrane protein  59.31 
 
 
448 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.7904  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3407  hypothetical protein  51.28 
 
 
454 aa  379  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2925  parallel beta-helix repeat-containing protein  54.14 
 
 
462 aa  378  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4375  parallel beta-helix repeat-containing protein  53.07 
 
 
465 aa  372  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  6.65337e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4920  hypothetical protein  53.08 
 
 
468 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0390615  normal  0.0715167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1297  hypothetical protein  53.02 
 
 
432 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.442891  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3043  hypothetical protein  51.28 
 
 
464 aa  368  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4430  polymorphic outer membrane protein  52.12 
 
 
465 aa  360  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1619  hypothetical protein  50.32 
 
 
454 aa  360  4e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.892418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1617  polymorphic membrane protein  46.39 
 
 
505 aa  358  1e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.926452  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3011  polymorphic membrane protein  49.68 
 
 
466 aa  357  2e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.802976  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1127  hypothetical protein  52.92 
 
 
461 aa  357  3e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.5274  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3987  hypothetical protein  52.18 
 
 
467 aa  355  7e-97  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4370  polymorphic outer membrane protein  54.91 
 
 
450 aa  354  2e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3408  polymorphic outer membrane protein  52.33 
 
 
461 aa  353  4e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3654  polymorphic outer membrane protein  52.24 
 
 
462 aa  352  9e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00892124  hitchhiker  0.00240143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3075  polymorphic outer membrane protein  53 
 
 
462 aa  349  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.56618e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0210  hypothetical protein  48.48 
 
 
460 aa  348  9e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3406  parallel beta-helix repeat-containing protein  51.24 
 
 
479 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525217  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4397  hypothetical protein  49.89 
 
 
454 aa  348  1e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.792915  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2897  polymorphic outer membrane protein  48.83 
 
 
459 aa  344  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.966498  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1020  hypothetical protein  51.79 
 
 
435 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1623  hypothetical protein  50.83 
 
 
557 aa  330  2e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1615  hypothetical protein  50.96 
 
 
452 aa  329  5e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0681298 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4599  parallel beta-helix repeat-containing protein  49.69 
 
 
478 aa  329  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.119679 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3647  hypothetical protein  48.33 
 
 
464 aa  324  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279677  hitchhiker  0.00645734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0321  hypothetical protein  52.48 
 
 
457 aa  324  2e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.584072  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3982  polymorphic outer membrane protein  50.52 
 
 
496 aa  322  9e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.401558  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3992  hypothetical protein  49.26 
 
 
457 aa  320  4e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688493  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0383  hypothetical protein  47.6 
 
 
493 aa  318  1e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0788229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1120  polymorphic outer membrane protein  50.67 
 
 
441 aa  317  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00052776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4332  hypothetical protein  49.28 
 
 
477 aa  316  5e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252215  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4219  hypothetical protein  48.18 
 
 
466 aa  314  3e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.958199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1626  hypothetical protein  47.84 
 
 
489 aa  312  7e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.38383  normal  0.636637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1609  hypothetical protein  49.43 
 
 
435 aa  310  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.44696  normal  0.0279779 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4912  polymorphic outer membrane protein  49.79 
 
 
446 aa  295  9e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0139202 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0320  polymorphic membrane protein  52.97 
 
 
361 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.960666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1620  polymorphic membrane protein  50.67 
 
 
415 aa  281  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.890418  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4774  hypothetical protein  44.36 
 
 
473 aa  275  9e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0272932  decreased coverage  3.56618e-05 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3399  polymorphic outer membrane protein  39.25 
 
 
483 aa  188  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3646  polymorphic outer membrane protein  37.96 
 
 
509 aa  187  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.749989  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2509  hypothetical protein  38.38 
 
 
476 aa  175  1e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16291  normal  0.0412393 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1229  hypothetical protein  35.88 
 
 
481 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0257494  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2358  hypothetical protein  36.83 
 
 
477 aa  165  1e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.640506  normal  0.200266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3059  hypothetical protein  32.53 
 
 
523 aa  154  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.938529  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3285  hypothetical protein  33.1 
 
 
532 aa  150  7e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.37025  hitchhiker  0.00171312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2695  polymorphic membrane protein  30.29 
 
 
483 aa  128  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0661586  hitchhiker  0.000503026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2511  polymorphic membrane protein  31.83 
 
 
477 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.238754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3668  hypothetical protein  33.26 
 
 
501 aa  113  6e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3060  hypothetical protein  33.45 
 
 
673 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.103594 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3286  hypothetical protein  43.02 
 
 
840 aa  97.4  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.577779  hitchhiker  0.00794489 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2314  polymorphic outer membrane protein  31.72 
 
 
541 aa  81.3  3e-14  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1227  hypothetical protein  37.41 
 
 
168 aa  66.2  1e-09  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0203008  normal  0.739603 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2283  polymorphic outer membrane protein  30 
 
 
575 aa  61.2  3e-08  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2258  hypothetical protein  27.58 
 
 
530 aa  58.9  2e-07  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10338  probable extracellular nuclease  34.15 
 
 
2160 aa  57.4  5e-07  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2803  polymorphic outer membrane protein  27.99 
 
 
527 aa  57  6e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.850053  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1640  polymorphic outer membrane protein  29.75 
 
 
767 aa  56.6  9e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2401  polymorphic outer membrane protein  35.71 
 
 
362 aa  54.7  3e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0859  OmpA/MotB domain protein  30.41 
 
 
913 aa  53.5  8e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2726  polymorphic outer membrane protein  28.75 
 
 
593 aa  52.8  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479266  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0201  carbohydrate-binding and sugar hydrolysis  30.69 
 
 
884 aa  53.1  1e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1704  polymorphic outer membrane protein  24.7 
 
 
1755 aa  51.2  4e-05  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.041755  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1468  hypothetical protein  40.71 
 
 
523 aa  50.8  4e-05  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.92132  hitchhiker  0.00194181 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2873  polymorphic outer membrane protein  33.75 
 
 
717 aa  50.4  6e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.406525  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2246  hypothetical protein  26.59 
 
 
591 aa  50.1  9e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.105015  normal  0.0180285 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2988  polymorphic outer membrane protein  29.59 
 
 
575 aa  50.1  9e-05  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0583035  hitchhiker  0.000382857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0540  hypothetical protein  32.67 
 
 
1061 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1983  hypothetical protein  37.21 
 
 
987 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  36.04 
 
 
1037 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0694  polymorphic membrane protein B/C family protein  34.26 
 
 
1672 aa  47.8  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3329  polymorphic outer membrane protein  28.28 
 
 
558 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  3.00518e-08 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0033  hypothetical protein  27.57 
 
 
591 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1362  hypothetical protein  29.44 
 
 
1023 aa  47  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2841  polymorphic outer membrane protein  25.97 
 
 
759 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2618  polymorphic outer membrane protein  30.05 
 
 
863 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0765  hypothetical protein  44.74 
 
 
294 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>