122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2257 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2257  phage integrase family protein  100 
 
 		 363 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0034941  normal  0.642714 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0477  hypothetical protein  76.6 
 
 		 241 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5804  integrase family protein  36.56 
 
 		 417 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  37.95 
 
 		 381 aa  197  3e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  37.27 
 
 		 368 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  35.53 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  96.7 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  34.83 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  36.05 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0203  phage integrase family protein  35.52 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  30.79 
 
 		 400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1905  integrase family protein  27.58 
 
 		 440 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  28.36 
 
 		 334 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  26.5 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  29.74 
 
 		 332 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2501  integrase family protein  25 
 
 		 348 aa  74.7  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137002  normal  0.0538174 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  29.5 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  29.46 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  29.46 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  28.45 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  28.76 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  31.84 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.59 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.99 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  28.74 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.56 
 
 		 353 aa  57.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  26.87 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.32 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.8 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  28.21 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  25.95 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  27.55 
 
 		 386 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  26.16 
 
 		 343 aa  54.7  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  20.7 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  24.44 
 
 		 372 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 367 aa  53.1  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.58 
 
 		 369 aa  53.1  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  21.03 
 
 		 296 aa  52.8  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.51 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  25.66 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  25.88 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  29.06 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3068  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 407 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  25.4 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  25.4 
 
 		 347 aa  50.1  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  20.07 
 
 		 368 aa  49.7  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  26.96 
 
 		 297 aa  49.7  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.79 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  21.43 
 
 		 295 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.63 
 
 		 275 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  30.74 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  24.2 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0017  integrase family protein  27.14 
 
 		 414 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  24.81 
 
 		 381 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  25.61 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  23.32 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0292  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  30.64 
 
 		 397 aa  47  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.26 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.23 
 
 		 319 aa  47  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0611  integrase family protein  24.21 
 
 		 337 aa  46.6  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.55 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  27.5 
 
 		 365 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  27.49 
 
 		 159 aa  46.6  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  25.23 
 
 		 412 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 		 300 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 343 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  24.13 
 
 		 351 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  22.87 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  26.72 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.89 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.36 
 
 		 301 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  25.35 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.14 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  24.07 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  26.23 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  23.38 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  24.07 
 
 		 308 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  27 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4336  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.5 
 
 		 300 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  24.43 
 
 		 330 aa  44.3  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  27.71 
 
 		 349 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1640  integrase family protein  26.72 
 
 		 486 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30299  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  21.33 
 
 		 337 aa  43.9  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  24.49 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  31.76 
 
 		 99 aa  43.5  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  25.84 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0242  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.33 
 
 		 299 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.322874  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1917  integrase  24.79 
 
 		 375 aa  43.5  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>