199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2828 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0419  endonuclease/exonuclease/phosphatase  60.36 
 
 		 1052 aa  691    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0131268  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  87.57 
 
 		 1641 aa  2779    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0270  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  69.7 
 
 		 641 aa  819    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.527105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2828  endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 1641 aa  3275    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5031  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.46 
 
 		 1075 aa  553  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0324828  normal  0.671967 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13340  extracellular nuclease  46.68 
 
 		 780 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0905495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1201  PKD domain-containing protein  46.31 
 
 		 780 aa  532  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.48 
 
 		 2346 aa  519  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1683  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.48 
 
 		 1148 aa  518  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1701  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.6 
 
 		 1148 aa  519  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.427243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1477  endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.25 
 
 		 947 aa  476  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.58 
 
 		 942 aa  463  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1568  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.79 
 
 		 942 aa  456  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.10217  normal  0.0647375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  44.08 
 
 		 1503 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  43.44 
 
 		 944 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  43.44 
 
 		 944 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1534  PKD domain-containing protein  43.09 
 
 		 948 aa  442  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.97112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1595  PKD domain-containing protein  43.41 
 
 		 948 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.4 
 
 		 944 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  43.6 
 
 		 944 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.61 
 
 		 940 aa  438  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.37 
 
 		 1266 aa  439  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1601  PKD domain-containing protein  42.02 
 
 		 948 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.156806 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.09 
 
 		 826 aa  437  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  43.13 
 
 		 944 aa  440  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  42.2 
 
 		 1310 aa  431  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.23 
 
 		 945 aa  433  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.5 
 
 		 818 aa  430  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1104  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.38 
 
 		 601 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.604194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1707  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.26 
 
 		 955 aa  427  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  42.3 
 
 		 948 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0828  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.93 
 
 		 818 aa  419  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.182782 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0259  putative extracellular nuclease  42.9 
 
 		 624 aa  414  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.05 
 
 		 848 aa  411  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1440  putative extracellular nuclease  42.9 
 
 		 624 aa  414  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1637  putative extracellular nuclease  42.9 
 
 		 624 aa  414  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2637  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.9 
 
 		 624 aa  413  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.541694  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2498  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.9 
 
 		 624 aa  413  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.209723  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0292  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  42.9 
 
 		 624 aa  414  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.262594  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.33 
 
 		 603 aa  410  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2760  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.6 
 
 		 604 aa  404  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0532  extracellular nuclease, putative  42.17 
 
 		 622 aa  400  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4098  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.27 
 
 		 604 aa  396  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.535753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4749  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.27 
 
 		 604 aa  396  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5194  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.38 
 
 		 604 aa  396  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.337928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3418  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.27 
 
 		 604 aa  396  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3357  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.22 
 
 		 604 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  40.17 
 
 		 2796 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.42 
 
 		 573 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  43.33 
 
 		 653 aa  384  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4713  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.92 
 
 		 1284 aa  384  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.55 
 
 		 2667 aa  380  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0934  extracellular nuclease  43.68 
 
 		 514 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2286  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.17 
 
 		 621 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.127089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  40.89 
 
 		 1346 aa  372  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  39.83 
 
 		 795 aa  366  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.85 
 
 		 600 aa  365  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187879  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5536  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.84 
 
 		 627 aa  362  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.8971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4553  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.5 
 
 		 620 aa  358  6.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3810  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.36 
 
 		 599 aa  357  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.193506 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3714  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.33 
 
 		 620 aa  354  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.495775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  40.59 
 
 		 2775 aa  352  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2843  extracellular nuclease-like  37.96 
 
 		 945 aa  337  2e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0894144  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0110  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.36 
 
 		 586 aa  328  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.738543  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3281  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.16 
 
 		 1123 aa  321  9e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2836  metallophosphoesterase  75.53 
 
 		 865 aa  299  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0383065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  38.74 
 
 		 868 aa  292  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  36.68 
 
 		 1577 aa  265  6.999999999999999e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3718  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.61 
 
 		 870 aa  261  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0825  5'-Nucleotidase domain protein  34.68 
 
 		 1512 aa  260  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002273  predicted extracellular nuclease  31.54 
 
 		 984 aa  259  3e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0941  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 		 870 aa  258  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.578163  normal  0.129599 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3033  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.94 
 
 		 870 aa  257  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.441038  normal  0.600162 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  32.16 
 
 		 863 aa  256  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0677  5'-nucleotidase domain-containing protein  33.81 
 
 		 1525 aa  255  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.608053  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2198  hypothetical protein  33.88 
 
 		 869 aa  254  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2322  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 		 929 aa  253  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.451149  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0904  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.74 
 
 		 870 aa  251  6e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00895191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1364  putative exported nuclease  30.81 
 
 		 890 aa  250  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.587865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1631  5'-Nucleotidase domain protein  36.24 
 
 		 1652 aa  249  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.453464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2945  extracellular nuclease  31.6 
 
 		 865 aa  249  4e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.172583 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3193  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.65 
 
 		 871 aa  248  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00309211  normal  0.0976082 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3009  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.03 
 
 		 876 aa  248  9e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00148055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00081  nuclease  30.19 
 
 		 982 aa  247  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2906  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.44 
 
 		 873 aa  245  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.435339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3886  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 		 894 aa  242  5e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000584422 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3595  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 		 870 aa  241  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0433948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.76 
 
 		 481 aa  241  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0364  5'-Nucleotidase domain protein  33.47 
 
 		 1577 aa  240  1e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.381679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0890  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.47 
 
 		 870 aa  240  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.298934  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3472  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 		 870 aa  240  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0137942  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03610  putative glutamate--cysteine ligase/putative amino acid ligase  35.94 
 
 		 902 aa  239  4e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.230337  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1737  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.71 
 
 		 570 aa  239  4e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.979917  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03816  nuclease  33.01 
 
 		 572 aa  236  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1066  extracellular nuclease  30.62 
 
 		 871 aa  236  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3944  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 		 892 aa  235  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000110843  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3397  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.12 
 
 		 870 aa  235  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00146831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33530  predicted extracellular nuclease  33.59 
 
 		 1591 aa  234  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0542188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1188  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 575 aa  234  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.219404  normal  0.0718602 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3943  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.45 
 
 		 885 aa  232  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.439448 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>