More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0461 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  50.41 
 
 		 953 aa  818    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  55.94 
 
 		 968 aa  1014    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1236  helicase domain-containing protein  44.41 
 
 		 940 aa  635    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  44.33 
 
 		 950 aa  693    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  46.45 
 
 		 969 aa  753    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  45.18 
 
 		 949 aa  716    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  46.11 
 
 		 933 aa  688    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  45.35 
 
 		 957 aa  707    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  43.46 
 
 		 948 aa  703    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  40.54 
 
 		 958 aa  695    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  40.72 
 
 		 958 aa  696    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4771  helicase domain-containing protein  45.03 
 
 		 953 aa  656    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.360251 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 986 aa  1946    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0273  helicase domain-containing protein  42.73 
 
 		 919 aa  611  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  42.47 
 
 		 945 aa  612  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  41.52 
 
 		 941 aa  608  9.999999999999999e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1526  helicase domain-containing protein  41.05 
 
 		 923 aa  600  1e-170  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.796043  normal  0.0729049 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3297  helicase domain protein  41.9 
 
 		 946 aa  596  1e-169  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0725  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  40.85 
 
 		 949 aa  536  1e-151  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0353  helicase-like  39.46 
 
 		 933 aa  538  1e-151  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  29.78 
 
 		 952 aa  333  1e-89  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  33.7 
 
 		 919 aa  315  2.9999999999999996e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0832  DEAD-like helicases-like  56.14 
 
 		 313 aa  273  8.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.76445 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  29.37 
 
 		 1049 aa  205  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  30.13 
 
 		 1057 aa  187  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1325  SNF2-related helicase  29.56 
 
 		 1082 aa  182  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  28.36 
 
 		 1058 aa  182  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  28.99 
 
 		 1169 aa  180  9e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  29.37 
 
 		 1169 aa  178  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  29.15 
 
 		 962 aa  178  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  28.33 
 
 		 971 aa  177  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  29.81 
 
 		 1028 aa  176  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  27.81 
 
 		 1038 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  30.24 
 
 		 969 aa  173  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  29.75 
 
 		 1201 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.87 
 
 		 933 aa  172  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3680  SNF2-related:helicase, C-terminal  30.5 
 
 		 1045 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  29.75 
 
 		 1201 aa  172  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  29.77 
 
 		 1062 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 1145 aa  171  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  30.89 
 
 		 1031 aa  167  5.9999999999999996e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  30.73 
 
 		 1165 aa  167  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  26.88 
 
 		 1170 aa  167  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1314  helicase domain-containing protein  27.37 
 
 		 982 aa  167  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  30.04 
 
 		 1167 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.27 
 
 		 1046 aa  166  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  28.75 
 
 		 969 aa  164  6e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0826  helicase domain-containing protein  28.76 
 
 		 1136 aa  164  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  30.39 
 
 		 1160 aa  162  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  29.38 
 
 		 1095 aa  162  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  27.76 
 
 		 1194 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2189  type III restriction enzyme, res subunit  28.93 
 
 		 1172 aa  163  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  27.42 
 
 		 877 aa  163  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  29.26 
 
 		 835 aa  163  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  28.79 
 
 		 1147 aa  162  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1144 aa  162  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  31.64 
 
 		 1044 aa  162  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  29.04 
 
 		 1138 aa  161  5e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0745  helicase domain protein  29.36 
 
 		 1094 aa  161  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.9 
 
 		 941 aa  161  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.9 
 
 		 941 aa  161  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  29.56 
 
 		 1167 aa  160  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  31.27 
 
 		 1160 aa  160  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  29.86 
 
 		 801 aa  160  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  29.86 
 
 		 805 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  28.55 
 
 		 1116 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  26.31 
 
 		 1170 aa  159  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  27.71 
 
 		 945 aa  158  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  26.47 
 
 		 952 aa  158  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  28.67 
 
 		 1129 aa  157  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  26.5 
 
 		 952 aa  157  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  26.5 
 
 		 952 aa  157  8e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  27.1 
 
 		 1170 aa  157  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.09 
 
 		 988 aa  156  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1086  helicase-like  29.48 
 
 		 829 aa  155  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  30.58 
 
 		 1168 aa  155  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1596  helicase domain-containing protein  28.62 
 
 		 1137 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 1167 aa  154  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  26.17 
 
 		 952 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  28.87 
 
 		 1170 aa  150  9e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35220  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  28.14 
 
 		 960 aa  149  2.0000000000000003e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.608461 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  28.35 
 
 		 1172 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  28.42 
 
 		 937 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  27.85 
 
 		 966 aa  146  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3743  helicase domain protein  26.77 
 
 		 973 aa  145  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3088  helicase domain-containing protein  27.75 
 
 		 956 aa  144  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01898 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  27.61 
 
 		 964 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  25.9 
 
 		 900 aa  138  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  28.2 
 
 		 1046 aa  134  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  25.18 
 
 		 1013 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  24.59 
 
 		 560 aa  127  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  24.05 
 
 		 560 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  26.05 
 
 		 963 aa  122  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  23.55 
 
 		 560 aa  121  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  26.19 
 
 		 894 aa  121  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  23.55 
 
 		 560 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  26.19 
 
 		 951 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  25.78 
 
 		 961 aa  120  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0592  helicase domain-containing protein  27.72 
 
 		 955 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  25.29 
 
 		 966 aa  115  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>