More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0804 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 2885 aa  5413    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  46.78 
 
 		 2667 aa  503  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  83.33 
 
 		 1236 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  40.09 
 
 		 2775 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  68.3 
 
 		 1712 aa  353  4e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  43.93 
 
 		 2105 aa  199  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.3 
 
 		 1795 aa  194  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.67 
 
 		 980 aa  188  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  43.96 
 
 		 460 aa  186  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  41.59 
 
 		 615 aa  182  8e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  41.82 
 
 		 526 aa  175  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.22 
 
 		 2668 aa  172  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  49.04 
 
 		 686 aa  169  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 		 341 aa  164  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  48.06 
 
 		 260 aa  161  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  46.22 
 
 		 1164 aa  158  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.72 
 
 		 1016 aa  156  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  40.27 
 
 		 460 aa  154  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  41.08 
 
 		 341 aa  153  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  34.59 
 
 		 985 aa  152  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.47 
 
 		 946 aa  149  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40.94 
 
 		 1424 aa  147  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  37.47 
 
 		 994 aa  145  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  45.64 
 
 		 202 aa  144  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  45.64 
 
 		 202 aa  144  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  42.64 
 
 		 833 aa  144  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  39.7 
 
 		 1895 aa  142  7.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  40.81 
 
 		 363 aa  142  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.73 
 
 		 588 aa  142  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  40.75 
 
 		 2911 aa  141  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  44.35 
 
 		 950 aa  140  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  42.14 
 
 		 387 aa  140  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.46 
 
 		 3427 aa  140  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  40 
 
 		 437 aa  139  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  40.34 
 
 		 2954 aa  139  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  38.31 
 
 		 3619 aa  137  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  40.98 
 
 		 982 aa  137  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  39.38 
 
 		 437 aa  136  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  40.69 
 
 		 3619 aa  135  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  37.54 
 
 		 491 aa  134  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  37.02 
 
 		 757 aa  134  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.39 
 
 		 2678 aa  133  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.93 
 
 		 3209 aa  132  9.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  37.62 
 
 		 1279 aa  132  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  33.97 
 
 		 1152 aa  131  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  41.18 
 
 		 4334 aa  130  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  45.64 
 
 		 219 aa  130  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 		 1400 aa  130  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  40.91 
 
 		 813 aa  129  8.000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  36.96 
 
 		 556 aa  128  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 907 aa  127  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  40.26 
 
 		 1534 aa  128  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 475 aa  127  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  42.74 
 
 		 424 aa  127  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  52.55 
 
 		 421 aa  126  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  40.76 
 
 		 795 aa  125  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  39.11 
 
 		 2145 aa  126  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  37.15 
 
 		 475 aa  125  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  38.91 
 
 		 387 aa  125  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  40.6 
 
 		 606 aa  125  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  39.13 
 
 		 595 aa  125  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  35.16 
 
 		 1287 aa  124  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  43.88 
 
 		 219 aa  124  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.35 
 
 		 1963 aa  124  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  38.08 
 
 		 1532 aa  123  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  43.78 
 
 		 518 aa  122  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  37.13 
 
 		 589 aa  122  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  37.1 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.01 
 
 		 3954 aa  122  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  34.81 
 
 		 245 aa  121  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  40.07 
 
 		 1363 aa  120  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.78 
 
 		 1079 aa  119  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  42.11 
 
 		 1175 aa  119  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.92 
 
 		 1499 aa  118  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1895  hypothetical protein  36.58 
 
 		 850 aa  118  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0996991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  47.77 
 
 		 572 aa  118  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  40.43 
 
 		 613 aa  118  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  32.62 
 
 		 1544 aa  117  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  39.81 
 
 		 1883 aa  117  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  48.47 
 
 		 709 aa  117  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1599  hemolysin-type calcium-binding region  39.91 
 
 		 303 aa  116  7.000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0042965  normal  0.464742 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  35.57 
 
 		 1156 aa  115  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  35.22 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  35.2 
 
 		 3608 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  41.73 
 
 		 357 aa  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.84 
 
 		 1197 aa  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  33.15 
 
 		 4798 aa  115  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  36.82 
 
 		 648 aa  114  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  39.63 
 
 		 639 aa  115  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5060  hemolysin-type calcium-binding region  41.85 
 
 		 396 aa  115  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  35.29 
 
 		 4687 aa  114  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  37.16 
 
 		 243 aa  114  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  43.6 
 
 		 860 aa  113  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  38.22 
 
 		 1145 aa  112  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  40.34 
 
 		 1043 aa  112  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  36.75 
 
 		 1480 aa  111  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  35.2 
 
 		 9867 aa  111  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  33.62 
 
 		 959 aa  111  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  50 
 
 		 1112 aa  110  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2816  hemolysin-type calcium-binding region  44.02 
 
 		 351 aa  110  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>