More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4964 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2775  OmpA/MotB domain-containing protein  78.82 
 
 		 831 aa  1351    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.414663  normal  0.366632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3090  OmpA domain-containing protein  78.46 
 
 		 831 aa  1330    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4964  OmpA/MotB  100 
 
 		 830 aa  1712    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2499  OmpA/MotB domain-containing protein  78.1 
 
 		 831 aa  1338    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.306062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2633  OmpA/MotB domain-containing protein  78.22 
 
 		 831 aa  1329    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  56.12 
 
 		 830 aa  942    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04696  ImcF-related family  32.71 
 
 		 1230 aa  321  3e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00810675  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2188  hypothetical protein  29.94 
 
 		 1270 aa  307  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4923  type VI secretion protein IcmF  31.06 
 
 		 1288 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.163369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2954  ImcF-like family protein  31.17 
 
 		 1301 aa  303  1e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.858657  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01945  hypothetical protein  36.95 
 
 		 1313 aa  297  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.206649 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3625  hypothetical protein  31.09 
 
 		 1297 aa  296  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3650  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1297 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2826  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1297 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3632  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1297 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.20293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0050  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1297 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.485623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1717  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1297 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.624106  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3151  hypothetical protein  35.76 
 
 		 1297 aa  296  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0459  type VI secretion protein IcmF  34.27 
 
 		 1314 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2620  ImcF-related  34.27 
 
 		 1314 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0485  ImcF domain-containing protein  34.27 
 
 		 1314 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3575  hypothetical protein  34.07 
 
 		 1315 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0393  ImcF domain-containing protein  34.27 
 
 		 1313 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.145892  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0420  type VI secretion protein IcmF  34.07 
 
 		 1313 aa  281  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419198  normal  0.652814 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2907  type VI secretion protein IcmF  34.12 
 
 		 1315 aa  281  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.531051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2811  hypothetical protein  30.78 
 
 		 1195 aa  250  6e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0148  hypothetical protein  33.61 
 
 		 1176 aa  237  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.201488  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2631  ImcF domain-containing protein  27.11 
 
 		 1267 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00910  hypothetical protein  36.91 
 
 		 1102 aa  228  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2316  ImcF domain-containing protein  32.53 
 
 		 1171 aa  228  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00185575  hitchhiker  0.000165437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3091  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1267 aa  228  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4962  hypothetical protein  29.47 
 
 		 1310 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2501  type VI secretion protein IcmF  27.35 
 
 		 1268 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.761474 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1522  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1181 aa  223  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.29104 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2773  type VI secretion protein IcmF  30.71 
 
 		 1265 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.276817  normal  0.540963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2262  ImcF-related  29.2 
 
 		 1335 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.295752  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2352  type VI secretion protein IcmF  32.43 
 
 		 1181 aa  211  3e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0516  type VI secretion protein IcmF  31.92 
 
 		 1199 aa  211  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3000  ImcF domain-containing protein  28.74 
 
 		 1212 aa  211  4e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3846  type VI secretion protein IcmF  30.04 
 
 		 1218 aa  210  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0318709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000016  IcmF-related protein  29.37 
 
 		 1172 aa  210  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2464  type VI secretion protein IcmF  32.6 
 
 		 1207 aa  208  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26710  hypothetical protein  30.49 
 
 		 1205 aa  207  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0957907  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1204  SciS protein  29.58 
 
 		 1209 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263659  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2965  ImcF-related protein  29.58 
 
 		 1209 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449228  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2840  ImcF-related protein  29.58 
 
 		 1209 aa  204  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4057  type VI secretion protein IcmF  33.56 
 
 		 1220 aa  204  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000260588 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0399  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 1209 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196026  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0448  ImcF-related protein  29.58 
 
 		 1209 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1593  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 1209 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.736034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1778  putative lipoprotein  29.58 
 
 		 1209 aa  204  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2373  ImcF domain-containing protein  31.67 
 
 		 1182 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.720279  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00250  SciS protein  31.52 
 
 		 1152 aa  201  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1592  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1208 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.727557  normal  0.457538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0254  putative lipoprotein  29.39 
 
 		 1209 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.452905  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2881  type VI secretion protein IcmF  34.86 
 
 		 1148 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0619949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1473  ImcF domain-containing protein  29.17 
 
 		 1209 aa  197  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0274  hypothetical protein  29.71 
 
 		 1154 aa  196  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3487  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1173 aa  187  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883094  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2453  ImcF domain-containing protein  39.78 
 
 		 1176 aa  187  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.322795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3131  ImcF domain-containing protein  36.41 
 
 		 1173 aa  187  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  unclonable  0.00864499  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6041  IcmF family protein  32.29 
 
 		 1164 aa  187  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5418  hypothetical protein  30.64 
 
 		 1192 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3035  ImcF-related  32.27 
 
 		 1157 aa  184  6e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.393455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3022  type VI secretion protein IcmF  30.19 
 
 		 1302 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3048  type VI secretion protein IcmF  35.16 
 
 		 1204 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0213  type VI secretion protein IcmF  29.98 
 
 		 1211 aa  182  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5577  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1179 aa  179  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0104  ImcF domain-containing protein  31.28 
 
 		 1179 aa  178  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1610  SciS protein  29.56 
 
 		 1302 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0163  ImcF/SciS family protein  29.05 
 
 		 1302 aa  177  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.136069  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0140  ImcF/SciS family protein  29.05 
 
 		 1302 aa  177  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3166  hypothetical protein  29.72 
 
 		 1150 aa  177  8e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3603  hypothetical protein  29.79 
 
 		 1175 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.269333  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0318  type VI secretion protein IcmF  34.02 
 
 		 1289 aa  171  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.277614 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0306  SciS protein  34.02 
 
 		 1289 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.422511 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0311  type VI secretion protein IcmF  34.02 
 
 		 1289 aa  171  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685526 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1209  ImcF domain-containing protein  27.43 
 
 		 1182 aa  170  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0323  type VI secretion protein IcmF  33.76 
 
 		 1289 aa  168  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2516  type VI secretion protein IcmF  25.64 
 
 		 1187 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0127  putative lipoprotein  33.62 
 
 		 1302 aa  167  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0534605  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6679  type VI secretion protein IcmF  29.8 
 
 		 1302 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.79071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1205  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1134 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3045  hypothetical protein  28.8 
 
 		 1133 aa  158  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2554  hypothetical protein  28.33 
 
 		 1168 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.024238  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2088  ImcF domain-containing protein  32.35 
 
 		 1175 aa  155  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42900  hypothetical protein  29.56 
 
 		 1175 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.376126 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0934  type VI secretion protein IcmF  27.91 
 
 		 1329 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1083  type VI secretion protein IcmF  27.71 
 
 		 1165 aa  152  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3242  type VI secretion protein IcmF  27.27 
 
 		 1165 aa  150  6e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.748769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1937  type VI secretion protein IcmF  28.61 
 
 		 1150 aa  149  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.502152  normal  0.887242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2794  type VI secretion protein IcmF  27.71 
 
 		 1165 aa  148  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1673  type VI secretion protein IcmF  28.25 
 
 		 1268 aa  148  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0143992 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1373  hypothetical protein  28.61 
 
 		 1275 aa  148  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1485  type VI secretion protein IcmF  28.61 
 
 		 1275 aa  148  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3720  Fis family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 1194 aa  145  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0399  type VI secretion protein IcmF  24.87 
 
 		 1177 aa  142  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0326  putative lipoprotein  24.87 
 
 		 1177 aa  142  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4071  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1208 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000209226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3221  type VI secretion protein IcmF  25.2 
 
 		 1194 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.79348  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>