111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1899 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1899  hypothetical protein  100 
 
 		 549 aa  1138    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.571929  hitchhiker  0.00194399 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4016  hypothetical protein  45.88 
 
 		 1100 aa  486  1e-136  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1784  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.01 
 
 		 1164 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0724834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3992  hypothetical protein  43.18 
 
 		 1126 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4321  hypothetical protein  44.11 
 
 		 1126 aa  299  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1989  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.5 
 
 		 605 aa  277  3e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0620689  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00472  hypothetical protein  39.23 
 
 		 1049 aa  270  5e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0358017  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  38.77 
 
 		 1056 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1760  hypothetical protein  38.54 
 
 		 1220 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  38.54 
 
 		 1157 aa  233  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3984  DNA helicase related protein  34.07 
 
 		 1087 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  34.79 
 
 		 1092 aa  219  8.999999999999998e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  39.24 
 
 		 1094 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2785  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  35.11 
 
 		 1477 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.464639 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3443  superfamily I DNA/RNA helicase  36.02 
 
 		 1061 aa  206  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  26.69 
 
 		 958 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  25.57 
 
 		 1132 aa  85.9  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  26.13 
 
 		 975 aa  81.6  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4249  superfamily I DNA/RNA helicase  25.87 
 
 		 1185 aa  78.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3025  hypothetical protein  27.67 
 
 		 1176 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0376122  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1238  phospholipase D/transphosphatidylase  27.02 
 
 		 1178 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.927717  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2434  hypothetical protein  25.07 
 
 		 914 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000217788 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  27.62 
 
 		 1171 aa  75.5  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.39 
 
 		 1099 aa  74.7  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.27 
 
 		 1196 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1979  phospholipase D/transphosphatidylase  26.09 
 
 		 1178 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1514  phospholipase D/transphosphatidylase  27.06 
 
 		 1190 aa  70.5  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884215  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  26.69 
 
 		 1335 aa  70.1  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  23.57 
 
 		 1002 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1062 aa  69.7  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  24.83 
 
 		 932 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  23.84 
 
 		 922 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  23.79 
 
 		 925 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.39 
 
 		 464 aa  63.9  0.000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  24.65 
 
 		 632 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  25.9 
 
 		 946 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  24.5 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.26 
 
 		 1203 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  22.68 
 
 		 941 aa  57  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  25.33 
 
 		 1363 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  24.33 
 
 		 715 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  23.57 
 
 		 633 aa  56.2  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  23.21 
 
 		 633 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  21.99 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  22.5 
 
 		 633 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  23.37 
 
 		 636 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  22.55 
 
 		 1121 aa  54.7  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  24.14 
 
 		 636 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  24.84 
 
 		 1653 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  23.93 
 
 		 754 aa  53.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  25 
 
 		 619 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1018 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  21.24 
 
 		 906 aa  51.6  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  23.65 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  21.98 
 
 		 903 aa  52  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0087  superfamily I DNA/RNA helicase  21.52 
 
 		 1622 aa  52  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  25 
 
 		 622 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2544  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1888 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  26.09 
 
 		 758 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  24.91 
 
 		 622 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  22.65 
 
 		 611 aa  50.4  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2810  hypothetical protein  39.76 
 
 		 985 aa  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157063  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  24.25 
 
 		 633 aa  49.7  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  22.04 
 
 		 1038 aa  50.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.63 
 
 		 1324 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  22.54 
 
 		 916 aa  49.3  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  22.95 
 
 		 900 aa  49.3  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  24.19 
 
 		 1081 aa  49.3  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  21.86 
 
 		 1284 aa  49.3  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  22.86 
 
 		 635 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  22 
 
 		 902 aa  48.9  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  23.97 
 
 		 905 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3149  hypothetical protein  47.17 
 
 		 1722 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.65917 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.91 
 
 		 752 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  21.48 
 
 		 902 aa  48.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0591  DNA helicase, putative  24.76 
 
 		 1629 aa  48.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  29.51 
 
 		 2123 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  20.9 
 
 		 643 aa  47.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3665  putative DNA helicase  25.87 
 
 		 2005 aa  47.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18389  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3225  type III restriction protein res subunit  22.61 
 
 		 2759 aa  47.8  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  23.29 
 
 		 907 aa  47.4  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  24.26 
 
 		 908 aa  47.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  23.97 
 
 		 905 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1201  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.12 
 
 		 1959 aa  47.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725251  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  23.08 
 
 		 1077 aa  47  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  23.63 
 
 		 905 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0671  viral phosphatase  25.52 
 
 		 1367 aa  47  0.0009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  22.18 
 
 		 905 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1438  hypothetical protein  24.39 
 
 		 1572 aa  47  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.241805  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2058  putative superfamily I DNA and RNA helicase protein  42.19 
 
 		 1861 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  22.59 
 
 		 934 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  22.54 
 
 		 1090 aa  45.8  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  22.18 
 
 		 905 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  23.57 
 
 		 585 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  30.12 
 
 		 1284 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  24.39 
 
 		 466 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2061  putative DNA helicase  21.64 
 
 		 2013 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  28.05 
 
 		 1620 aa  45.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0470  hypothetical protein  42.86 
 
 		 2045 aa  45.4  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0317  superfamily I DNA/RNA helicase  22.22 
 
 		 1973 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>