More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0023 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0023  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 1041 aa  2165    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0028  Rhs element Vgr protein  85.51 
 
 		 1207 aa  1005    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.645983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2130  Rhs element Vgr protein  31.04 
 
 		 1007 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0737  Rhs element Vgr protein  31.23 
 
 		 1007 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0611  Rhs element Vgr protein  31.23 
 
 		 1007 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0583244  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0722  Rhs element Vgr protein  31.23 
 
 		 1007 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1680  Rhs element Vgr protein  31.23 
 
 		 1007 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2032  Rhs element Vgr protein  31.04 
 
 		 1007 aa  285  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0541  Rhs element Vgr protein  31.04 
 
 		 1007 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0863  Rhs element Vgr protein  30.3 
 
 		 1012 aa  265  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201208  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2821  Rhs element protein VgrE  33.65 
 
 		 690 aa  258  5e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3651  Rhs element Vgr protein  27.45 
 
 		 779 aa  222  3e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.982905 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  26.92 
 
 		 702 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  28.74 
 
 		 680 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0286  Rhs element Vgr protein:Gp5-like  29.04 
 
 		 709 aa  195  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.856224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  27.01 
 
 		 693 aa  194  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3177  Rhs family protein  29.98 
 
 		 697 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  28.12 
 
 		 684 aa  188  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  26.89 
 
 		 694 aa  187  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3035  type VI secretion system Vgr family protein  27.58 
 
 		 683 aa  185  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0785  Rhs element Vgr protein  27.94 
 
 		 832 aa  185  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1790  Rhs element Vgr protein  29.16 
 
 		 792 aa  185  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  26.49 
 
 		 808 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  28.51 
 
 		 680 aa  183  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1216  type VI secretion system Vgr family protein  25.07 
 
 		 683 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0454  Rhs element Vgr protein  25.98 
 
 		 671 aa  183  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  27.65 
 
 		 790 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  28.32 
 
 		 680 aa  182  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0733  type VI secretion system family protein  27.54 
 
 		 782 aa  181  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0788  Rhs element Vgr protein  27.57 
 
 		 900 aa  181  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  26.24 
 
 		 688 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0169  hypothetical protein  27.42 
 
 		 782 aa  180  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000232253 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4385  Rhs element Vgr protein  27.24 
 
 		 763 aa  179  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2888  hypothetical protein  26.96 
 
 		 668 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.882104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3479  Rhs element Vgr protein  28.45 
 
 		 897 aa  177  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.477057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2504  Rhs element Vgr protein  27.49 
 
 		 782 aa  176  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  27.54 
 
 		 680 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 		 741 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5415  Rhs element Vgr protein  27.04 
 
 		 678 aa  174  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  26.05 
 
 		 851 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  26.33 
 
 		 643 aa  173  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33960  hypothetical protein  24.9 
 
 		 668 aa  172  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000148732  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2865  type VI secretion system Vgr family protein  26.12 
 
 		 780 aa  172  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4080  type VI secretion system Vgr family protein  27.68 
 
 		 771 aa  171  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000279673 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3130  type VI secretion system Vgr family protein  27.53 
 
 		 835 aa  170  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50870  Rhs element Vgr protein  26.61 
 
 		 668 aa  170  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  26.02 
 
 		 777 aa  170  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  27.61 
 
 		 680 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  26.37 
 
 		 796 aa  169  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  25.98 
 
 		 646 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3415  Rhs element Vgr protein  25.71 
 
 		 669 aa  168  5e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.960838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0626  Rhs element Vgr protein  25.93 
 
 		 889 aa  168  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.160391 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1155  type VI secretion system Vgr family protein  25.1 
 
 		 706 aa  167  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0542625  normal  0.843476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2983  Rhs element Vgr protein  27.27 
 
 		 782 aa  167  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.389792  hitchhiker  0.000144528 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  25.66 
 
 		 853 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5985  type VI secretion system Vgr family protein  24.82 
 
 		 641 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  26.07 
 
 		 703 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4796  Rhs element Vgr protein  26.16 
 
 		 911 aa  163  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  26.72 
 
 		 741 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  27.55 
 
 		 613 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00256  Rhs-family protein  26.03 
 
 		 645 aa  163  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0764  type VI secretion system Vgr family protein  25.2 
 
 		 741 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05870  hypothetical protein  24.01 
 
 		 692 aa  163  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0696  putative VgrG protein  25.2 
 
 		 741 aa  162  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0805  type VI secretion system Vgr family protein  27.26 
 
 		 782 aa  162  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.637165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  25.98 
 
 		 616 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  26.57 
 
 		 741 aa  162  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  26.1 
 
 		 689 aa  162  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  24.63 
 
 		 968 aa  162  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  27.15 
 
 		 618 aa  161  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000448  VgrG protein  24.01 
 
 		 692 aa  161  6e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000107078  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  24.31 
 
 		 886 aa  161  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  24.81 
 
 		 661 aa  161  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 661 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 661 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 661 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 661 aa  160  8e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  24.27 
 
 		 661 aa  160  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3849  Rhs element Vgr protein  25.2 
 
 		 675 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  26.49 
 
 		 614 aa  160  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  26.52 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  24.08 
 
 		 661 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  24.36 
 
 		 901 aa  159  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  24.9 
 
 		 661 aa  158  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  25.76 
 
 		 689 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  23.62 
 
 		 975 aa  158  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_36  VgrG protein, VgrG-2  25.5 
 
 		 754 aa  158  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1358  VgrG preotein, VgrG-2  25.83 
 
 		 754 aa  158  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5267  Rhs element Vgr protein  26.59 
 
 		 822 aa  158  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3254  type VI secretion system Vgr family protein  25.68 
 
 		 787 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0013  Rhs element Vgr protein  24.96 
 
 		 771 aa  157  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4483  type VI secretion system Vgr family protein  25.39 
 
 		 778 aa  156  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  25.92 
 
 		 767 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  25.29 
 
 		 618 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1183  Rhs element Vgr protein  24.62 
 
 		 694 aa  155  4e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01965  hypothetical protein  24.46 
 
 		 771 aa  155  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3868  type VI secretion system Vgr family protein  26.63 
 
 		 730 aa  154  5.9999999999999996e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0373872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0179  Rhs element Vgr protein  24.81 
 
 		 783 aa  154  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.109522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1194  Rhs element Vgr protein  24.62 
 
 		 655 aa  154  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6319  Rhs element Vgr protein  26.37 
 
 		 1197 aa  154  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0965231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>