More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2342 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 795 aa  1611    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  54.29 
 
 		 811 aa  806    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  55.87 
 
 		 811 aa  838    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  41.4 
 
 		 800 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  40.87 
 
 		 795 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  40.9 
 
 		 784 aa  507  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  41.66 
 
 		 800 aa  505  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  38.89 
 
 		 793 aa  483  1e-135  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  39.01 
 
 		 793 aa  484  1e-135  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  38.43 
 
 		 788 aa  479  1e-134  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  38.19 
 
 		 788 aa  477  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  37.07 
 
 		 843 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  38.31 
 
 		 795 aa  456  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  38.91 
 
 		 803 aa  447  1.0000000000000001e-124  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  38.72 
 
 		 811 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  35.64 
 
 		 853 aa  441  9.999999999999999e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  37.1 
 
 		 817 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  36.62 
 
 		 815 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  36.2 
 
 		 803 aa  435  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  37.03 
 
 		 797 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 847 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  35.43 
 
 		 848 aa  426  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 797 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  36.47 
 
 		 797 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  36.59 
 
 		 797 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  35.84 
 
 		 821 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 812 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 812 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  36.07 
 
 		 812 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  34.24 
 
 		 874 aa  414  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  36.89 
 
 		 842 aa  409  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 948 aa  404  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  34.8 
 
 		 840 aa  406  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  36.11 
 
 		 797 aa  399  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  34.26 
 
 		 887 aa  396  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.71 
 
 		 799 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.46 
 
 		 832 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  35.13 
 
 		 918 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  37.01 
 
 		 804 aa  389  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  33.58 
 
 		 961 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  35.83 
 
 		 883 aa  382  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 817 aa  375  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  32.95 
 
 		 853 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  33.45 
 
 		 835 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  32.78 
 
 		 933 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  33.72 
 
 		 884 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  34.5 
 
 		 815 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  35.7 
 
 		 924 aa  367  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  31.79 
 
 		 870 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  33.65 
 
 		 871 aa  365  1e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 868 aa  365  2e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  32.51 
 
 		 947 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  32.41 
 
 		 864 aa  359  9.999999999999999e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  33.58 
 
 		 924 aa  352  2e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.97 
 
 		 867 aa  348  3e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  33.25 
 
 		 833 aa  347  7e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  35.76 
 
 		 847 aa  346  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.84 
 
 		 849 aa  342  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 850 aa  340  5e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.78 
 
 		 800 aa  340  7e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  33.7 
 
 		 818 aa  340  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  33.16 
 
 		 816 aa  333  9e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  33.21 
 
 		 823 aa  327  6e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  31.86 
 
 		 842 aa  324  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  30.66 
 
 		 857 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  32.47 
 
 		 885 aa  321  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 867 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 851 aa  318  2e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  31.52 
 
 		 858 aa  316  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  31.11 
 
 		 861 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 867 aa  312  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 		 987 aa  311  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 872 aa  301  5e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 858 aa  293  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 813 aa  283  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 870 aa  282  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  29.59 
 
 		 869 aa  281  2e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  27.74 
 
 		 873 aa  248  3e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  29.81 
 
 		 856 aa  240  9e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  28.3 
 
 		 852 aa  239  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  33.66 
 
 		 1015 aa  226  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 879 aa  223  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  29.78 
 
 		 948 aa  197  5.000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.78 
 
 		 877 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1883  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 928 aa  146  1e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.320358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 843 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  25.92 
 
 		 663 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  26.18 
 
 		 666 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  26.18 
 
 		 666 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  26.18 
 
 		 666 aa  115  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  26.03 
 
 		 666 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0967  TonB-dependent receptor  40.61 
 
 		 869 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0133332  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  37.56 
 
 		 855 aa  108  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3411  TonB-dependent receptor  39.62 
 
 		 953 aa  108  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.961049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 855 aa  108  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  36.18 
 
 		 871 aa  106  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0906  TonB-dependent receptor  37.19 
 
 		 875 aa  105  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 838 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3630  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 861 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  38.02 
 
 		 852 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>