More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1254 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4105  major facilitator family transporter  84.35 
 
 		 479 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0010  major facilitator family transporter  83.26 
 
 		 471 aa  654    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3479  major facilitator transporter  81.11 
 
 		 450 aa  659    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1254  general substrate transporter  100 
 
 		 449 aa  899    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3192  major facilitator transporter  77.73 
 
 		 442 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  32.3 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  32.65 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2022  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1078  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.564459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1938  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 443 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.829808  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02423  major facilitator family transporter  30.5 
 
 		 440 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.796992  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  31.16 
 
 		 461 aa  169  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 430 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1729  major facilitator transporter  30.51 
 
 		 453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  34.33 
 
 		 405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  34.44 
 
 		 426 aa  163  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2934  major facilitator transporter  29.17 
 
 		 441 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14658  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  30.16 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  29.89 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61560  putative MFS transporter  31.75 
 
 		 457 aa  160  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.167083 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5303  MFS family transporter  31.75 
 
 		 457 aa  160  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  31.41 
 
 		 440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  32.06 
 
 		 448 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1562  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 450 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.384388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  32.72 
 
 		 449 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  31.56 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0918  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3439  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 424 aa  147  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.681123  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  29.18 
 
 		 413 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2470  major facilitator transporter  31.52 
 
 		 440 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.72 
 
 		 413 aa  143  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3193  major facilitator superfamily transporter  29.01 
 
 		 424 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.326975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  30.33 
 
 		 441 aa  142  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1930  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2687  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 472 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.98 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 467 aa  140  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  29.11 
 
 		 468 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  29.8 
 
 		 470 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 465 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  27.61 
 
 		 418 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  30.56 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8303  major facilitator superfamily MFS_1  29 
 
 		 478 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  29.15 
 
 		 465 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  29.37 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1728  major facilitator transporter  30.73 
 
 		 461 aa  136  8e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  30.09 
 
 		 438 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  30.75 
 
 		 442 aa  134  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.49 
 
 		 416 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  27.74 
 
 		 475 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 405 aa  132  9e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2760  major facilitator transporter  31.48 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.937042 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0710  major facilitator transporter  29.34 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0737  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.175922 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 578 aa  132  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  28.14 
 
 		 438 aa  132  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4301  major facilitator transporter  28.06 
 
 		 461 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3136  major facilitator transporter  37.97 
 
 		 530 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.797097  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0800  major facilitator transporter  35.71 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4329  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 457 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87285 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0477  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5128  major facilitator transporter  32.24 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0816  major facilitator transporter  36.92 
 
 		 536 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.973467  decreased coverage  0.000368786 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2115  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 451 aa  127  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  28.93 
 
 		 436 aa  122  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  28.54 
 
 		 464 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0609  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0802156 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1023  major facilitator transporter  29.88 
 
 		 448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0776  major facilitator transporter  26.19 
 
 		 447 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2647  major facilitator transporter  28.61 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6128  major facilitator transporter  27.25 
 
 		 461 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.328412  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5791  major facilitator transporter  27.83 
 
 		 454 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601008  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4429  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2011  major facilitator transporter  30.08 
 
 		 446 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2014  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.51 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1976  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 454 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5424  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4631  major facilitator transporter  27.96 
 
 		 460 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.14555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  25.31 
 
 		 435 aa  110  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  27.23 
 
 		 432 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  28.19 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5424  major facilitator family transporter  38.1 
 
 		 198 aa  109  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.18135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  30.31 
 
 		 439 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 440 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7588  major facilitator transporter  26.63 
 
 		 490 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 439 aa  106  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  26.27 
 
 		 423 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  26.96 
 
 		 452 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  29.62 
 
 		 439 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3565  major facilitator transporter  27.5 
 
 		 429 aa  103  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.42 
 
 		 448 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  27.13 
 
 		 427 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 405 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>