More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1220 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  100 
 
 
231 aa  466  1e-130  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  79.65 
 
 
230 aa  283  1e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  79.65 
 
 
230 aa  274  1e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  79.65 
 
 
230 aa  274  1e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  5.54839e-06 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  78.35 
 
 
230 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50880  hypothetical protein  57.58 
 
 
210 aa  253  2e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.07187e-05 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4338  hypothetical protein  57.58 
 
 
210 aa  253  2e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  48.96 
 
 
244 aa  174  8e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  45.31 
 
 
239 aa  165  7e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  43.8 
 
 
264 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  5.60377e-06 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  42.56 
 
 
239 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  49.08 
 
 
240 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  48.47 
 
 
210 aa  145  4e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 
237 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  45.88 
 
 
294 aa  136  3e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  49.68 
 
 
344 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  45 
 
 
440 aa  130  2e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  49.04 
 
 
350 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  4.84221e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  49.04 
 
 
350 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  45.86 
 
 
375 aa  129  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  47.13 
 
 
344 aa  127  1e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  5.17848e-08  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  47.13 
 
 
345 aa  127  1e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  2.81488e-06  decreased coverage  1.76342e-11 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  47.13 
 
 
344 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  3.49757e-05  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  47.13 
 
 
344 aa  127  2e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  47.13 
 
 
344 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  1.82424e-07  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  44.91 
 
 
429 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  47.13 
 
 
344 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  3.00566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  44.08 
 
 
376 aa  123  3e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  1.02046e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.2 
 
 
447 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.85785e-13  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  45.62 
 
 
445 aa  122  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  38.05 
 
 
351 aa  120  2e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  44.72 
 
 
333 aa  119  3e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  1.97596e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.85 
 
 
445 aa  118  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.31 
 
 
417 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  7.26931e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.43 
 
 
319 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  6.51702e-11  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  41.21 
 
 
362 aa  115  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  42.24 
 
 
337 aa  115  7e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  41.61 
 
 
337 aa  115  7e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  40.61 
 
 
365 aa  115  8e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40.76 
 
 
375 aa  114  9e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  6.87097e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.05 
 
 
420 aa  114  9e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  46.45 
 
 
335 aa  114  1e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  2.8398e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  40.24 
 
 
449 aa  114  1e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40.76 
 
 
375 aa  114  1e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  2.52189e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  38.42 
 
 
266 aa  112  6e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  49.6 
 
 
352 aa  109  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  1.95152e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1358  OmpA/MotB  35.61 
 
 
209 aa  109  4e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  5.45475e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  41.03 
 
 
388 aa  108  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  2.05838e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  53.1 
 
 
219 aa  108  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.87 
 
 
506 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  41.61 
 
 
345 aa  107  1e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  53.77 
 
 
219 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  40.88 
 
 
510 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  50.94 
 
 
219 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  39.87 
 
 
428 aa  105  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.18101e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  41.51 
 
 
543 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  51.89 
 
 
218 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  51.89 
 
 
218 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  51.89 
 
 
210 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  2.6968e-08  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  46.46 
 
 
242 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  41.36 
 
 
1755 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  37.34 
 
 
427 aa  102  4e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.51 
 
 
542 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  50.94 
 
 
214 aa  102  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  3.03101e-06 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  38.71 
 
 
348 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  3.00647e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  41.51 
 
 
392 aa  102  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  1.20544e-05  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1340  OmpA/MotB domain protein  43.2 
 
 
207 aa  102  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000111461  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  39.38 
 
 
623 aa  102  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40.88 
 
 
544 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  43.67 
 
 
402 aa  101  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  39.76 
 
 
187 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  1.42767e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  50.94 
 
 
212 aa  100  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  41.51 
 
 
394 aa  100  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  7.25554e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  41.51 
 
 
478 aa  99.8  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  36.48 
 
 
314 aa  99.4  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  34.16 
 
 
498 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.76 
 
 
440 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5108  OmpA/MotB domain-containing protein  46.56 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.889998  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  41.53 
 
 
671 aa  97.1  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3339  OmpA family protein  34.54 
 
 
196 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1207  OmpA/MotB domain-containing protein  35.83 
 
 
191 aa  96.7  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000250814  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1277  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
191 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  8.82937e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1206  OmpA/MotB domain-containing protein  35.14 
 
 
191 aa  96.3  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  8.45715e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.85 
 
 
456 aa  95.5  5e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1701  outer membrane protein, OmpA family  30.56 
 
 
355 aa  95.9  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.908317  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  45.95 
 
 
509 aa  95.9  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3958  OmpA/MotB domain protein  42.64 
 
 
499 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.330203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  40.33 
 
 
487 aa  95.5  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  51.43 
 
 
230 aa  95.1  8e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1316  OmpA/MotB domain protein  36.16 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  8.29076e-12  hitchhiker  6.79334e-27 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  50.48 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  47.17 
 
 
217 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  41.53 
 
 
367 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  47.17 
 
 
217 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2674  OmpA/MotB domain-containing protein  33.52 
 
 
196 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000176163  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  50 
 
 
224 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1344  OmpA/MotB domain-containing protein  34.39 
 
 
190 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124071  hitchhiker  2.23206e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2186  OmpA/MotB  44.54 
 
 
261 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.813055  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  40.18 
 
 
669 aa  92.8  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  36.72 
 
 
209 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.031779 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>