More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5798 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  96.1 
 
 		 205 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  76.85 
 
 		 204 aa  321  4e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  78.22 
 
 		 204 aa  321  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  75.25 
 
 		 206 aa  310  6.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  80.54 
 
 		 204 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  80.2 
 
 		 204 aa  304  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  80.54 
 
 		 204 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  77.23 
 
 		 204 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 209 aa  136  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 236 aa  124  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 241 aa  119  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 235 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  32.04 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 252 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 252 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 252 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 220 aa  112  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 247 aa  108  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 220 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 215 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 223 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 220 aa  94.7  9e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  29.67 
 
 		 215 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  35.95 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 217 aa  92.4  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 221 aa  91.7  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 215 aa  91.3  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 218 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  30.81 
 
 		 214 aa  87.8  9e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  30.92 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  30.69 
 
 		 211 aa  85.1  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  29.61 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 242 aa  78.2  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 227 aa  62  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 332 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
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NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
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NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
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NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
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NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 453 aa  52.4  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
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NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 198 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 291 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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