71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_28237 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_28237  predicted protein  100 
 
 		 220 aa  456  9.999999999999999e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.359759  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10415  DNA repair protein Rad18, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05440)  44.1 
 
 		 1146 aa  135  6.0000000000000005e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0107863  hitchhiker  0.00000500177 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31021  Protein involved in recombination repair  40.62 
 
 		 1063 aa  132  3.9999999999999996e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.109982 
 
 
-
 
NC_006686  CND03960  DNA repair-related protein, putative  40.85 
 
 		 1125 aa  123  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32662  predicted protein  37.65 
 
 		 1060 aa  112  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.429677 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0484  chromosome segregation protein SMC  35.25 
 
 		 1148 aa  53.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1175 aa  52.4  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05899  Condensin subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J150]  29.45 
 
 		 1179 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.566819 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04180  nuclear condensin complex protein, putative  27.67 
 
 		 1215 aa  51.2  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.360826  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  33.33 
 
 		 1174 aa  50.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29255  predicted protein  30.13 
 
 		 1076 aa  50.1  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.170598  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  26.96 
 
 		 1189 aa  49.3  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  31.96 
 
 		 702 aa  49.7  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_19472  predicted protein  37.82 
 
 		 1186 aa  48.9  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.222049  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2057  putative ATPase  33.33 
 
 		 341 aa  48.9  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  26.23 
 
 		 1191 aa  48.5  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_30352  predicted protein  28.3 
 
 		 1213 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  29.25 
 
 		 1149 aa  47  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0781  SMC domain protein  25.48 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  45.24 
 
 		 858 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0747  chromosome segregation protein SMC  30.51 
 
 		 1146 aa  47.4  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  26.21 
 
 		 1189 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1027  DNA repair protein RecN  37.04 
 
 		 562 aa  47  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  30.17 
 
 		 1146 aa  47.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  28.68 
 
 		 1179 aa  46.2  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  31.85 
 
 		 1177 aa  46.2  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59451  Chromosome segregation and condensation  28.36 
 
 		 1171 aa  46.2  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.819288  decreased coverage  0.00000261165 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0004  DNA replication and repair protein RecF  35.59 
 
 		 372 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.370076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.52 
 
 		 1189 aa  46.2  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  27.66 
 
 		 702 aa  45.8  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  46.67 
 
 		 891 aa  45.8  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  40.82 
 
 		 702 aa  45.8  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  32.08 
 
 		 924 aa  45.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  29.52 
 
 		 895 aa  45.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  31.03 
 
 		 935 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  33.62 
 
 		 1184 aa  45.1  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  24.83 
 
 		 1189 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  27.33 
 
 		 1147 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  28.93 
 
 		 1190 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06570  DNA repair protein RecN  35.29 
 
 		 565 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000129264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1196 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  35.44 
 
 		 864 aa  43.5  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0587  DNA repair and genetic recombination protein  34.04 
 
 		 560 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  36.73 
 
 		 700 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  33.33 
 
 		 1196 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0004  recombination protein F  30 
 
 		 361 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0004  recombination protein F  30 
 
 		 361 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_641  chromosome condensation and segregation protein  28 
 
 		 1011 aa  43.5  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0042  DNA replication and repair protein RecF  30.95 
 
 		 358 aa  43.5  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  30.07 
 
 		 1193 aa  43.5  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  31.58 
 
 		 804 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  32.18 
 
 		 1196 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2750  DNA replication and repair protein RecF  40 
 
 		 387 aa  42.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.433504  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3946  hypothetical protein  26.92 
 
 		 356 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  33.33 
 
 		 1146 aa  43.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  31.11 
 
 		 1192 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3483  DNA repair protein RecN  31.37 
 
 		 555 aa  42.4  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  39.68 
 
 		 1196 aa  42.4  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_52607  predicted protein  22.64 
 
 		 1232 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  38.1 
 
 		 1188 aa  42  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  38.98 
 
 		 993 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1769  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 557 aa  42  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4149  hypothetical protein  32.93 
 
 		 250 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0347458  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  38.98 
 
 		 993 aa  42  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1084  DNA repair protein RecN  31.37 
 
 		 565 aa  41.6  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000955113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4075  hypothetical protein  32.93 
 
 		 241 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0432501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0032  SMC domain protein  36.67 
 
 		 440 aa  42  0.008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  44.68 
 
 		 890 aa  41.6  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  38.71 
 
 		 1219 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4689  condensin subunit Smc  41.27 
 
 		 1208 aa  41.6  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  38.98 
 
 		 993 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>