More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35150 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_35150  predicted protein  100 
 
 
381 aa  786    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.397673  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4694  TatD-related deoxyribonuclease  39.2 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4741  TatD-related deoxyribonuclease  32.86 
 
 
265 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4217  TatD-related deoxyribonuclease  35.11 
 
 
262 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00564  Mg-dependent DNase  32.55 
 
 
258 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1579  Sec-independent protein translocase TatD  28.66 
 
 
266 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.175187  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03776  deoxyribonuclease TatD  31.25 
 
 
270 aa  103  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3885  TatD-related deoxyribonuclease  31.4 
 
 
267 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.708999  normal  0.5428 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0277  DNase TatD  35.71 
 
 
260 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2211  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 
258 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.392507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0167  deoxyribonuclease TatD  28.4 
 
 
270 aa  100  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3939  DNase TatD  35.2 
 
 
260 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0254  DNase TatD  32.64 
 
 
260 aa  98.2  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.316946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3558  Sec-independent protein translocase TatD  30.3 
 
 
267 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0317  TatD-related deoxyribonuclease  34.18 
 
 
265 aa  98.6  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.87 
 
 
256 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3380  TatD-related deoxyribonuclease  30.92 
 
 
269 aa  97.4  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0398  Sec-independent protein translocase TatD  30.15 
 
 
267 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0932  TatD-related deoxyribonuclease  29.58 
 
 
268 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0520  TatD-related deoxyribonuclease  29.69 
 
 
262 aa  97.1  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2443  Sec-independent protein translocase TatD  30.51 
 
 
275 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0190314  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1052  type V secretory pathway protein  29.58 
 
 
268 aa  97.1  5e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.61196  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3209  TatD family hydrolase  30.65 
 
 
267 aa  97.1  5e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4303  DNase TatD  35.57 
 
 
264 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4256  DNase TatD  35.57 
 
 
260 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4184  DNase TatD  35.57 
 
 
264 aa  96.3  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.264811  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  30 
 
 
255 aa  95.5  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4363  DNase TatD  35.57 
 
 
264 aa  95.9  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975487  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  28.5 
 
 
256 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  32.52 
 
 
265 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3732  Sec-independent protein translocase TatD  31.19 
 
 
267 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.960927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4207  DNase TatD  35.05 
 
 
260 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2311  TatD family hydrolase  31.79 
 
 
265 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0122564  hitchhiker  0.000269668 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3458  TatD-related deoxyribonuclease  31.79 
 
 
289 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0499  TatD-related deoxyribonuclease  29.8 
 
 
267 aa  93.6  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4206  TatD family hydrolase  31.19 
 
 
267 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4312  DNase TatD  32.99 
 
 
264 aa  93.2  6e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3954  DNase TatD  32.99 
 
 
264 aa  93.2  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0821499 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4361  DNase TatD  32.99 
 
 
260 aa  93.2  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0424  TatD-related deoxyribonuclease  31.31 
 
 
267 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000499504 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0412  TatD-related deoxyribonuclease  31.31 
 
 
267 aa  92.8  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  32.13 
 
 
261 aa  92.4  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3757  DNase TatD  30.77 
 
 
264 aa  92.4  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.984732  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  34.57 
 
 
255 aa  92.4  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0438  TatD-related deoxyribonuclease  30.2 
 
 
267 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.081647 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4223  DNase TatD  32.31 
 
 
260 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00421208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0891  Sec-independent protein translocase TatD  23.72 
 
 
250 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  27.54 
 
 
256 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0308  hydrolase, TatD family  35.93 
 
 
254 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2060  TatD-related deoxyribonuclease  33.15 
 
 
273 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.50088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  34.15 
 
 
255 aa  91.7  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  36.25 
 
 
258 aa  91.3  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3902  TatD-related deoxyribonuclease  31.31 
 
 
267 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2255  hydrolase, TatD family  33.96 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481598  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  32.43 
 
 
265 aa  90.9  4e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3799  TatD-related deoxyribonuclease  29.15 
 
 
264 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2288  secretion protein MttC  34.97 
 
 
267 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343356  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  31.42 
 
 
256 aa  90.1  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2399  Sec-independent protein translocase TatD  29.41 
 
 
287 aa  89.7  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1913  TatD-related deoxyribonuclease  30.77 
 
 
264 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701497  hitchhiker  0.0000000200441 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0315  TatD family hydrolase  29.36 
 
 
260 aa  89.7  8e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3909  DNase TatD  31.47 
 
 
264 aa  89.7  8e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4021  Sec-independent protein translocase TatD  26.77 
 
 
268 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0468  TatD-related deoxyribonuclease  27.13 
 
 
271 aa  89.4  9e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03732  DNase, magnesium-dependent  31.63 
 
 
260 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4140  TatD-related deoxyribonuclease  31.63 
 
 
260 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5281  DNase TatD  31.96 
 
 
264 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.313749  normal  0.0903265 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4169  DNase TatD  31.63 
 
 
260 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045087 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4063  DNase TatD  31.63 
 
 
260 aa  89  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03681  hypothetical protein  31.63 
 
 
260 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4241  DNase TatD  31.12 
 
 
260 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  30.67 
 
 
265 aa  87.8  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4103  TatD-related deoxyribonuclease  30.43 
 
 
264 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.68948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  31.44 
 
 
258 aa  87.4  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  31.6 
 
 
244 aa  87  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  34.36 
 
 
264 aa  86.3  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.48 
 
 
260 aa  85.5  0.000000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0528  hydrolase, TatD family  29.38 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0657  TatD-related deoxyribonuclease  32.52 
 
 
257 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.707092 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  31.84 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4050  DNase TatD  31.66 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0316  TatD family hydrolase  34.57 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  0.040307 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0454  TatD-related deoxyribonuclease  29.56 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  26.69 
 
 
464 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  30.64 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27020  secretion protein MttC  32.93 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  30.08 
 
 
258 aa  84.3  0.000000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  26.72 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2473  TatD-related deoxyribonuclease  34.76 
 
 
263 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.243942  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64467  predicted protein  28.68 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.956921 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0538  TatD-related deoxyribonuclease  31.18 
 
 
260 aa  83.2  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  hitchhiker  0.00736337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  31.76 
 
 
258 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  30.21 
 
 
257 aa  82.4  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  31.76 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  31.76 
 
 
258 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02901  deoxyribonuclease  31.9 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  32.3 
 
 
256 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  30.18 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  30.18 
 
 
458 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3055  putative deoxyribonuclease  29.45 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00078525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>