More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2876 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  100 
 
 
822 aa  1687    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  43.35 
 
 
767 aa  584  1.0000000000000001e-165  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  38.02 
 
 
1044 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  42.35 
 
 
672 aa  475  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  42.68 
 
 
680 aa  461  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  38.38 
 
 
977 aa  424  1e-117  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  34.86 
 
 
843 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  38.45 
 
 
799 aa  379  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  49.35 
 
 
1328 aa  350  7e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  47.88 
 
 
1215 aa  335  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.29 
 
 
911 aa  305  2.0000000000000002e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  29.87 
 
 
1105 aa  298  4e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
924 aa  296  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  28.62 
 
 
1039 aa  294  5e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  44.66 
 
 
568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  44.66 
 
 
568 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  40.24 
 
 
1507 aa  281  5e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  38.38 
 
 
454 aa  271  5e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  39.24 
 
 
725 aa  270  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.59 
 
 
771 aa  268  4e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.58 
 
 
1186 aa  262  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  29.02 
 
 
1128 aa  258  4e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  28.81 
 
 
1050 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.31 
 
 
787 aa  250  7e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  47.04 
 
 
919 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 
1424 aa  247  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.11 
 
 
885 aa  235  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
1185 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  27.28 
 
 
1288 aa  227  7e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.5 
 
 
825 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  31.56 
 
 
785 aa  213  1e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  38.91 
 
 
444 aa  213  1e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  25.03 
 
 
953 aa  212  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  32.29 
 
 
1262 aa  209  2e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
814 aa  207  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  32.56 
 
 
2145 aa  204  4e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  26.55 
 
 
1131 aa  204  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  31.27 
 
 
1488 aa  195  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  25.15 
 
 
828 aa  192  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.14 
 
 
991 aa  190  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  39.36 
 
 
751 aa  188  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  24.12 
 
 
1550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  44.8 
 
 
481 aa  184  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 
1125 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  36.08 
 
 
362 aa  181  7e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  26.69 
 
 
776 aa  178  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  30.75 
 
 
919 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  39.13 
 
 
284 aa  175  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  40.17 
 
 
311 aa  171  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  34.1 
 
 
493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.59 
 
 
1404 aa  166  2.0000000000000002e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.05 
 
 
857 aa  164  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  28.03 
 
 
1290 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 
443 aa  158  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.31 
 
 
1088 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  27.22 
 
 
1068 aa  156  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  36.63 
 
 
212 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 
949 aa  149  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 
837 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  28.53 
 
 
1040 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  33.98 
 
 
304 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  23.92 
 
 
1136 aa  140  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  40.98 
 
 
190 aa  140  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
669 aa  137  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.39 
 
 
732 aa  136  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  27.53 
 
 
1028 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  24.49 
 
 
694 aa  135  3.9999999999999996e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  26.22 
 
 
1475 aa  134  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  22.1 
 
 
1324 aa  134  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  24.44 
 
 
740 aa  134  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 
667 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  29.9 
 
 
469 aa  130  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.13 
 
 
1228 aa  130  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
1283 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.91 
 
 
968 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.2 
 
 
1146 aa  129  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  48.63 
 
 
162 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  27.96 
 
 
782 aa  124  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  25.76 
 
 
708 aa  124  8e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.69 
 
 
854 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  31.66 
 
 
1212 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 
966 aa  122  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1818  TPR repeat-containing protein  32.59 
 
 
229 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  24.58 
 
 
675 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  23.43 
 
 
829 aa  120  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
577 aa  119  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.13 
 
 
1180 aa  119  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  22.03 
 
 
1056 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  28.27 
 
 
1479 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 
1054 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 
937 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  25 
 
 
1106 aa  116  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  29.07 
 
 
963 aa  115  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  22.24 
 
 
1383 aa  111  6e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  26.85 
 
 
836 aa  111  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  24.27 
 
 
801 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2362  serine/threonine protein kinase  25.08 
 
 
1435 aa  108  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0458945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  23.2 
 
 
843 aa  107  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
640 aa  107  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  25.89 
 
 
1238 aa  104  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>