205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_00541 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_00521  hypothetical protein  47.37 
 
 		 1341 aa  781    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00371  hypothetical protein  42.54 
 
 		 977 aa  704    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00541  hypothetical protein  100 
 
 		 921 aa  1860    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0602  helicase, putative  33.96 
 
 		 1004 aa  498  1e-139  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4323  type III restriction enzyme, res subunit  32.05 
 
 		 1613 aa  302  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14100  predicted helicase  31.56 
 
 		 1847 aa  298  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.605074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3143  helicase domain-containing protein  31.95 
 
 		 1063 aa  290  7e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0380  DEAD/DEAH box helicase-like  32.41 
 
 		 1301 aa  288  2.9999999999999996e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2642  type III restriction protein res subunit  31.21 
 
 		 1632 aa  288  4e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0037  helicase domain protein  31.48 
 
 		 1636 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.527167  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0102  adenine specific DNA methyltransferase, putative  31.67 
 
 		 1615 aa  275  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675246  hitchhiker  0.0000128241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0578  type III restriction enzyme, res subunit  30.4 
 
 		 1609 aa  274  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E6  superfamily II DNA/RNA helicase  31.25 
 
 		 1560 aa  262  2e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5505  helicase-associated  25.51 
 
 		 871 aa  207  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000739697 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5507  type III restriction enzyme, res subunit  33.83 
 
 		 301 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000769547 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1604  helicase-associated  21.39 
 
 		 1256 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108041 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42568  predicted protein  31.68 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46291  predicted protein  33.33 
 
 		 501 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42569  predicted protein  32.05 
 
 		 427 aa  73.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00119  Type III restriction enzyme, res subunit  25.86 
 
 		 744 aa  73.2  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.431054  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45516  predicted protein  28.48 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49663  predicted protein  30.32 
 
 		 567 aa  72.8  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0810  DEAD/DEAH box helicase-like  21.96 
 
 		 797 aa  69.7  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3086  Type I site-specific deoxyribonuclease  24.18 
 
 		 813 aa  68.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.461628  normal  0.442211 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36794  predicted protein  28.9 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  24.51 
 
 		 489 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20230  EcoEI R domain protein  25.58 
 
 		 770 aa  66.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.601124  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  23.78 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44572  predicted protein  25.51 
 
 		 335 aa  66.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.709299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  24.51 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4882  type I restriction enzyme EcoEI R protein  22.78 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3028  hypothetical protein  24.29 
 
 		 796 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.194288  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  22 
 
 		 440 aa  62.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2499  DEAD/DEAH box helicase-like  23.65 
 
 		 793 aa  62.4  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0539678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  22.53 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38634  predicted protein  30.77 
 
 		 146 aa  62  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.644785  normal  0.402408 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_15859  predicted protein  27.75 
 
 		 200 aa  61.6  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.575833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0357  type III restriction protein res subunit  22.94 
 
 		 1053 aa  61.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  21.46 
 
 		 494 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13230  predicted protein  29.19 
 
 		 152 aa  60.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00796928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17070  DNA/RNA helicase, superfamily II  22.74 
 
 		 1031 aa  58.9  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  24.36 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6300  predicted protein  24.06 
 
 		 195 aa  58.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  22.2 
 
 		 517 aa  58.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5861  type III restriction enzyme domain protein  22.04 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4050  type III restriction protein res subunit  29.82 
 
 		 453 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0396258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1895  EcoEI R domain-containing protein  22.72 
 
 		 780 aa  57.4  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0749811  hitchhiker  0.00699891 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1283  EcoEI R domain-containing protein  21.46 
 
 		 765 aa  57.4  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0503  EcoEI R domain-containing protein  21.85 
 
 		 824 aa  57.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000156579  normal  0.0688429 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02656  hypothetical protein  23.1 
 
 		 583 aa  57.4  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2959  type III restriction enzyme, res subunit  21.55 
 
 		 585 aa  55.5  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1475  type I restriction-modification system, R subunit  24.5 
 
 		 761 aa  55.5  0.000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_6725  predicted protein  28.12 
 
 		 168 aa  55.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2052  helicase, putative  22.72 
 
 		 952 aa  55.5  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0832  EcoEI R domain protein  22.54 
 
 		 784 aa  55.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.916446  normal  0.633032 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6521  type III restriction protein res subunit  22.96 
 
 		 462 aa  55.1  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0683  type I restriction-modification system, R subunit  22.54 
 
 		 784 aa  55.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2125  Type III restriction enzyme, res subunit  25.17 
 
 		 842 aa  55.1  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0352  EcoEI R domain-containing protein  22.17 
 
 		 791 aa  55.1  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02114  predicted ATP-dependet helicase  22.6 
 
 		 586 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1473  type III restriction protein res subunit  22.6 
 
 		 586 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000087246  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2482  putative helicase  22.36 
 
 		 586 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00182337  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1463  type III restriction protein res subunit  22.6 
 
 		 586 aa  54.3  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000557084  normal  0.860353 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0821  type III restriction protein res subunit  24.9 
 
 		 1042 aa  53.9  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0473136 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2726  type III restriction protein res subunit  25.8 
 
 		 580 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.219655  hitchhiker  0.000185767 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003782  helicase-related protein  22.41 
 
 		 583 aa  53.9  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000188444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0731  type III restriction enzyme, res subunit  23.32 
 
 		 899 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6047  type I restriction-modification system subunit R  21.88 
 
 		 788 aa  53.9  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.494965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3418  helicase domain-containing protein  20.99 
 
 		 550 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.326076 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1976  EcoEI R domain-containing protein  21.23 
 
 		 825 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.411939  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2322  putative helicase  22.6 
 
 		 586 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0410169  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  23.06 
 
 		 444 aa  53.5  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2460  putative helicase  21.99 
 
 		 586 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000666895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2463  putative helicase  21.99 
 
 		 586 aa  53.5  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.863309 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0516  type I restriction-modification system R subunit (endonuclease)  23.82 
 
 		 1115 aa  53.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  22.25 
 
 		 499 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0774  putative helicase  22.36 
 
 		 586 aa  53.5  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0469791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3322  putative helicase  22.36 
 
 		 586 aa  53.1  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0433993  normal  0.803545 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2574  putative helicase  21.99 
 
 		 586 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.452066  hitchhiker  0.00320977 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2417  putative helicase  21.99 
 
 		 586 aa  52.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.011156  normal  0.197081 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2372  putative helicase  21.99 
 
 		 586 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.010081  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04062  type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit  21.43 
 
 		 796 aa  52.4  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0174  type III restriction protein, res subunit  21.14 
 
 		 949 aa  52.4  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.927728  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3020  type III restriction protein res subunit  29.75 
 
 		 581 aa  52  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0824  EcoEI R domain-containing protein  22.61 
 
 		 783 aa  52  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48597  predicted protein  28.36 
 
 		 548 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.100939  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43489  predicted protein  24.77 
 
 		 425 aa  52  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0573784  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1920  type III restriction enzyme, res subunit  22.22 
 
 		 946 aa  52  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49763  predicted protein  25.3 
 
 		 594 aa  51.6  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2867  EcoEI R domain-containing protein  19.91 
 
 		 821 aa  51.6  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2683  type III restriction enzyme, res subunit  20.62 
 
 		 1149 aa  51.6  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0219186  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88383  ATP-dependent DNA helicase  26.06 
 
 		 385 aa  51.6  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1406  type III restriction protein res subunit  22.87 
 
 		 848 aa  51.6  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4740  type I restriction-modification system, R subunit  22.41 
 
 		 787 aa  51.6  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141278 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3273  hypothetical protein  21.93 
 
 		 776 aa  51.6  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.246841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2333  putative helicase  22.12 
 
 		 586 aa  51.6  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00564696  normal  0.0326725 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1234  type III restriction enzyme, res subunit  20.52 
 
 		 829 aa  50.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  21.36 
 
 		 590 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2821  helicase domain-containing protein  23.37 
 
 		 545 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127614  normal  0.294322 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0813  Hef nuclease  30.51 
 
 		 745 aa  50.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0382801  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>