More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4490 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  100 
 
 
220 aa  454  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  71.64 
 
 
214 aa  289  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6308  hypothetical protein  67.48 
 
 
217 aa  285  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.542442  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  66.99 
 
 
217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5346  isochorismatase hydrolase  48.1 
 
 
217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708564  normal  0.524133 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  42.47 
 
 
243 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0028  isochorismatase hydrolase  44.07 
 
 
247 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.123472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0181  isochorismatase hydrolase  41.24 
 
 
247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5340  isochorismatase hydrolase  35.94 
 
 
222 aa  122  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3011  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.679092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  31.1 
 
 
228 aa  92.8  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
222 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  34.22 
 
 
227 aa  86.3  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  31.69 
 
 
222 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4193  isochorismatase hydrolase  30.26 
 
 
226 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.35687  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  30.93 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  29.25 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  31.51 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  30.41 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  29.91 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  29.72 
 
 
223 aa  79.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  29.63 
 
 
230 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  28.93 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  31.36 
 
 
226 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  29.1 
 
 
230 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  40 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  29.63 
 
 
240 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  31.48 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  29.84 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  29.81 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  30.59 
 
 
230 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  34.07 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  29.41 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  40 
 
 
231 aa  73.2  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  37.78 
 
 
228 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  28.04 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  28.19 
 
 
232 aa  71.6  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  35.56 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  31.71 
 
 
227 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  37.36 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  34.44 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  27.96 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1826  isochorismatase superfamily hydrolase  37.6 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.436754  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3885  isochorismatase hydrolase  37.6 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3479  isochorismatase hydrolase  28.96 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  29.51 
 
 
231 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  29.89 
 
 
389 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  27.65 
 
 
240 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1404  isochorismatase hydrolase  37.6 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00231254  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  28.79 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1828  isochorismatase hydrolase  27.78 
 
 
228 aa  68.9  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0120591  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5128  isochorismatase hydrolase  33.9 
 
 
220 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1859  isochorismatase family protein  30.38 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.188481  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  29.51 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  33.09 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  30.49 
 
 
212 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6622  isochorismatase hydrolase  28.64 
 
 
215 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105038  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  29.57 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1434  isochorismatase hydrolase  36.8 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0935045  normal  0.33777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0173  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 
209 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  39.74 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0283  isochorismatase family protein family  32.28 
 
 
216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  30.71 
 
 
213 aa  67.4  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04773  isochorismatase  28.5 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0105  isochorismatase hydrolase  26.58 
 
 
188 aa  66.6  0.0000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.463699  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1846  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 
187 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255835  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0201  isochorismatase hydrolase  32.79 
 
 
198 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2011  isochorismatase hydrolase  32.09 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.177964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3007  isochorismatase family protein  30.08 
 
 
359 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0889682  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  29.03 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1230  isochorismatase hydrolase  30.07 
 
 
174 aa  65.1  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  39.51 
 
 
229 aa  64.3  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2126  isochorismatase hydrolase  27.53 
 
 
182 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.996682  normal  0.575884 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  27.67 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  27.67 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2754  isochorismatase hydrolase  37.93 
 
 
174 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.609473  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1787  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  36.07 
 
 
196 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1834  isochorismatase hydrolase  28.83 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3440  isochorismatase hydrolase  29.27 
 
 
182 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.410792 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  27.67 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.83 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  29.07 
 
 
197 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1155  hypothetical protein  29.88 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0863147  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2752  isochorismatase family protein  35.56 
 
 
176 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140427  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3072  isochorismatase family protein  28.77 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132185  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2960  isochorismatase family protein  35.56 
 
 
176 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000216154 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  38.78 
 
 
189 aa  63.5  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2963  isochorismatase family protein  35.56 
 
 
176 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.123696  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3315  isochorismatase family protein  28.77 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.83 
 
 
230 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  30.83 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>