More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1458 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1458  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  100 
 
 		 367 aa  767    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0940503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2847  WD40 domain-containing protein  55.02 
 
 		 357 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163369  normal  0.0361789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  56.25 
 
 		 944 aa  363  3e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3484  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  50.55 
 
 		 367 aa  357  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.774244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  48.2 
 
 		 379 aa  335  1e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3729  WD40 domain protein beta Propeller  34.06 
 
 		 354 aa  193  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.135548  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  31.66 
 
 		 567 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.85 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  30.04 
 
 		 419 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.08 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.64 
 
 		 572 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.32 
 
 		 429 aa  91.3  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  26.28 
 
 		 427 aa  90.5  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  26.82 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  23.93 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1912  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  27.43 
 
 		 512 aa  80.5  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.92 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  26.88 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  28.5 
 
 		 620 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  45.98 
 
 		 497 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  24.73 
 
 		 432 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  30.4 
 
 		 439 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  23.19 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.35 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  27.78 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  25.59 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  27.6 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  26.9 
 
 		 442 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  30.54 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  26.94 
 
 		 450 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  25.72 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  27 
 
 		 352 aa  73.6  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  24.83 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  23.45 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4330  WD40 domain-containing protein  27.85 
 
 		 518 aa  72.8  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  26.46 
 
 		 615 aa  72.8  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2806  WD40 domain protein beta Propeller  29.17 
 
 		 509 aa  72  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  23.62 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  24.12 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  25.91 
 
 		 442 aa  71.6  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  25.49 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.83 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.1 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.91 
 
 		 667 aa  70.5  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  27.12 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  26.55 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  28.49 
 
 		 441 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.15 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  21.84 
 
 		 445 aa  69.7  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.39 
 
 		 443 aa  69.3  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  26.55 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.37 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  25.63 
 
 		 442 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  29.49 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  24.81 
 
 		 437 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 442 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  25.32 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  25.76 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  25.76 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  26.77 
 
 		 443 aa  67  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.43 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  23.5 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  24.12 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  24.12 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  25.37 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  23.5 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  23.5 
 
 		 442 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  26.77 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  25.13 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  25.13 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  25.9 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02818  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 679 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  24.87 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  24.62 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  25 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  32.65 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  24.5 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  29.17 
 
 		 1060 aa  63.5  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  26.04 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  24.87 
 
 		 431 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  27.47 
 
 		 1167 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  26.03 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  23.05 
 
 		 446 aa  63.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  23 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.5 
 
 		 1028 aa  62.8  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  28.1 
 
 		 1042 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  25.13 
 
 		 437 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  25.13 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  26.26 
 
 		 441 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 721 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.294025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.68 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.26 
 
 		 395 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  24.87 
 
 		 431 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  25.77 
 
 		 462 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  26.01 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  29.75 
 
 		 1042 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  23.74 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>