More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0761 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0761  general secretion pathway protein D  100 
 
 		 833 aa  1676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000306489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1309  general secretion pathway protein D  36.83 
 
 		 819 aa  435  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0418049  normal  0.0430257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4150  general secretion pathway protein D  36.14 
 
 		 829 aa  422  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0456168  hitchhiker  0.0000162446 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0678  general secretion pathway protein D  37.82 
 
 		 720 aa  415  1e-114  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00783707  decreased coverage  0.00018208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  35.29 
 
 		 745 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3307  general secretion pathway protein D  34.29 
 
 		 763 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.335208  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0779  general secretion pathway protein D  34.64 
 
 		 775 aa  376  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.00261901  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0866  general secretory pathway protein D precursor  34.64 
 
 		 775 aa  375  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00112703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2098  general secretion pathway protein D  35.14 
 
 		 681 aa  362  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103091  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2609  putative general secretion pathway protein D  32.77 
 
 		 780 aa  343  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0742  type II and III secretion system protein  33.69 
 
 		 773 aa  343  7e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1277  general secretion pathway protein D  33.57 
 
 		 751 aa  332  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3010  type II and III secretion system protein  32.68 
 
 		 774 aa  325  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1518  general secretion pathway protein D  32.09 
 
 		 772 aa  290  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22323  normal  0.534897 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3141  type II and III secretion system protein:NolW-like  38.52 
 
 		 776 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.529282  normal  0.96586 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1123  general secretion pathway protein D  42.23 
 
 		 751 aa  228  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0556  general secretion pathway protein D  41.22 
 
 		 733 aa  219  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.234016  normal  0.128846 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0031  general secretion pathway protein D  37.69 
 
 		 794 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.412275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3658  general secretion pathway protein D  39.51 
 
 		 793 aa  202  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0885  general secretion pathway protein D  38.49 
 
 		 756 aa  194  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.741173  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3067  general secretion pathway protein D  36.71 
 
 		 803 aa  188  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0574712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2106  general secretion pathway protein D  37.22 
 
 		 767 aa  184  8.000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.832393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2771  general secretion pathway protein D  34.58 
 
 		 686 aa  180  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.662007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1791  general secretion pathway protein D  36.19 
 
 		 784 aa  179  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  25.65 
 
 		 789 aa  176  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02686  general secretion pathway protein D  35.35 
 
 		 766 aa  173  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.91159  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0909  general secretion pathway protein D  37.55 
 
 		 805 aa  172  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.793401 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3020  Type II secretory pathway component PulD-like protein  34.77 
 
 		 696 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000150174  decreased coverage  0.00000000799268 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  24.52 
 
 		 750 aa  162  2e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  25.82 
 
 		 804 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  26.1 
 
 		 728 aa  154  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4251  general secretion pathway protein D  32.25 
 
 		 660 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0106048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  29.45 
 
 		 696 aa  145  4e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  31.68 
 
 		 654 aa  144  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  31.68 
 
 		 650 aa  144  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  31.96 
 
 		 654 aa  143  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  31.45 
 
 		 744 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  32.15 
 
 		 641 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  28.21 
 
 		 635 aa  142  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  24.63 
 
 		 783 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3236  type II and III secretion system protein  32.34 
 
 		 711 aa  141  6e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.284362  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3688  type II and III secretion system protein  29.73 
 
 		 1469 aa  140  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  28.78 
 
 		 750 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1587  general secretion pathway protein D  30.04 
 
 		 801 aa  137  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.089404 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  28.78 
 
 		 757 aa  137  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0595  general secretion pathway protein D  28.21 
 
 		 630 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.788546  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  28.78 
 
 		 757 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  28.32 
 
 		 757 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  28.78 
 
 		 757 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  28.78 
 
 		 757 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  28.78 
 
 		 757 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  28.92 
 
 		 781 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  30.46 
 
 		 781 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1175  general secretion pathway protein D  34.14 
 
 		 797 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  30.18 
 
 		 787 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  28.61 
 
 		 740 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16070  general secretion pathway protein D  31.21 
 
 		 752 aa  134  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  29.67 
 
 		 716 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  30.27 
 
 		 777 aa  134  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  30.59 
 
 		 771 aa  134  6e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  31.29 
 
 		 793 aa  134  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  28.06 
 
 		 805 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1470  general secretion pathway protein D  30.39 
 
 		 714 aa  132  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  31.67 
 
 		 662 aa  130  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  30.36 
 
 		 780 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1412  general secretion pathway protein D  28.31 
 
 		 640 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  29.91 
 
 		 787 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  31.38 
 
 		 803 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2024  general secretion pathway protein D  28.67 
 
 		 779 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0993324 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  28.61 
 
 		 717 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  29.91 
 
 		 774 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  28.41 
 
 		 702 aa  127  8.000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  29.91 
 
 		 774 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  29.82 
 
 		 791 aa  126  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  29.79 
 
 		 714 aa  127  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  28.97 
 
 		 655 aa  127  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  28.2 
 
 		 775 aa  127  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  29.22 
 
 		 705 aa  126  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  31.2 
 
 		 689 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  29.73 
 
 		 803 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  29.6 
 
 		 753 aa  125  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  30.06 
 
 		 810 aa  125  3e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  29.88 
 
 		 724 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  29.28 
 
 		 781 aa  125  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2860  general secretion pathway protein D  28.62 
 
 		 640 aa  125  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  28.33 
 
 		 807 aa  125  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  30.23 
 
 		 703 aa  124  7e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  30.23 
 
 		 632 aa  124  9e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  29.27 
 
 		 705 aa  124  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2639  type II and III secretion system protein  31.83 
 
 		 733 aa  123  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0449107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0975  type II and III secretion system secretin  29.21 
 
 		 870 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.338671 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  28.01 
 
 		 803 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  28.65 
 
 		 686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  28.65 
 
 		 686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  27.96 
 
 		 704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  27.3 
 
 		 703 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  28.65 
 
 		 686 aa  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  30.89 
 
 		 710 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  29.7 
 
 		 705 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  28.65 
 
 		 686 aa  123  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>