More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1762 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1762  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 478 aa  961    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000778911  normal  0.308446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  35.34 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 225 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1666  OmpA/MotB  37.62 
 
 		 214 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.69899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.78 
 
 		 542 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.78 
 
 		 543 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  39.81 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  34.65 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  37.89 
 
 		 670 aa  68.2  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1898  OmpA/MotB  33.56 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  31.58 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  38.38 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  39.6 
 
 		 648 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  33.66 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  38.61 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0388  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 459 aa  64.3  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134908  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  35.64 
 
 		 510 aa  64.3  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0382  OmpA/MotB domain protein  35.85 
 
 		 459 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  29.61 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  35.05 
 
 		 658 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5154  OmpA/MotB domain protein  26.8 
 
 		 219 aa  62.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.97 
 
 		 607 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  33.98 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  33.02 
 
 		 638 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  37.37 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.578444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4198  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.48 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1655  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4014  OmpA/MotB domain-containing protein  26.45 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3364  OmpA/MotB domain protein  26.45 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.823034  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  33.96 
 
 		 468 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  33.66 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  33.98 
 
 		 454 aa  61.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  35.24 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3522  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 537 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  31.68 
 
 		 641 aa  60.8  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2385  OmpA/MotB domain protein  36.63 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  32.32 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  34.34 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  29.92 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0737  OmpA/MotB domain-containing protein  42.71 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.552847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  32.35 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  34.34 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0206  OmpA/MotB  30.69 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  33 
 
 		 669 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  32.32 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  33.01 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  35.58 
 
 		 445 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  33 
 
 		 294 aa  60.1  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2493  OmpA/MotB domain-containing protein  36.36 
 
 		 245 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00791352  normal  0.694387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0563  OmpA domain-containing protein  35.19 
 
 		 182 aa  59.7  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 263 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  34.65 
 
 		 227 aa  59.7  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  33.66 
 
 		 220 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.19452  normal  0.568242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0633  OmpA/MotB domain protein  32.67 
 
 		 198 aa  59.7  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000132054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 		 263 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  38.55 
 
 		 671 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1999  OmpA/MotB  35.35 
 
 		 271 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.411511  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2321  OmpA domain-containing protein  35.19 
 
 		 182 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.149229  normal  0.659387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0668  OmpA/MotB family protein  35.19 
 
 		 182 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.942269  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  32.99 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  32.67 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  42.35 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3473  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.773207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1022  OmpA/MotB domain protein  36.28 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3854  surface antigen protein  32.67 
 
 		 221 aa  58.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.415864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  40.85 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  31.48 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  31.48 
 
 		 261 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 262 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  31.58 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1911  OmpA domain-containing protein  29.6 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  39.58 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.24127  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0919  OmpA/MotB domain-containing protein  39.58 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0176783 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4652  OmpA/MotB domain-containing protein  26.83 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2727  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  33.04 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0327  OmpA/MotB  39.81 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.927231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  30.5 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2265  OmpA/MotB domain-containing protein  39.58 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1156  OmpA/MotB domain protein  34.18 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  26.47 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.66 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  33.72 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  31.31 
 
 		 456 aa  57  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  32.08 
 
 		 466 aa  57  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 		 263 aa  57  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  35.29 
 
 		 640 aa  57  0.0000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  37.61 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  34.65 
 
 		 890 aa  56.6  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  30.36 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  32.67 
 
 		 694 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  34.34 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 631 aa  55.8  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>