More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0993 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0993  major facilitator transporter  100 
 
 		 497 aa  971    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000427964  normal  0.0333525 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1772  major facilitator transporter  63.14 
 
 		 489 aa  583  1.0000000000000001e-165  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0605301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1080  major facilitator transporter  51.73 
 
 		 475 aa  432  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.235758  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0335  major facilitator superfamily MFS_1  50.21 
 
 		 476 aa  384  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0313  major facilitator superfamily MFS_1  33.06 
 
 		 489 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  30.52 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0323  major facilitator superfamily MFS_1  31.6 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1759  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 472 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1222  major facilitator transporter  31.67 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4860  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0839463 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1483  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3193  major facilitator transporter  27.6 
 
 		 472 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.9008 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6611  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1668  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 487 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1604  major facilitator transporter  27.72 
 
 		 485 aa  136  8e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  26.53 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1696  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.4496  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1217  major facilitator transporter  26.12 
 
 		 487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.207678  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1551  major facilitator transporter  26.46 
 
 		 485 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal  0.0914413 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0285  major facilitator superfamily sugar transporter  25.96 
 
 		 464 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 463 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1626  major facilitator transporter  26.25 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.408436  normal  0.668079 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4015  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  27.63 
 
 		 461 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5178  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6205  major facilitator superfamily MFS_1  27.04 
 
 		 471 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00188  MFS transporter  27.36 
 
 		 471 aa  127  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.103216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3580  hypothetical protein  25.85 
 
 		 478 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.024372  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1660  MFS family transporter  26.46 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 459 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  25.81 
 
 		 451 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  26.63 
 
 		 455 aa  124  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5716  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 482 aa  124  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4090  major facilitator superfamily metabolite(sugar)/H(+) symporter  27.18 
 
 		 471 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.94274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7070  major facilitator superfamily MFS_1  26.44 
 
 		 467 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.710966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  27.7 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2088  major facilitator superfamily MFS_1  30.98 
 
 		 456 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.565943 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1318  major facilitator family transporter  27.38 
 
 		 468 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0186  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8056  major facilitator superfamily MFS_1  27 
 
 		 451 aa  120  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1717  major facilitator transporter  27.79 
 
 		 488 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2505  major facilitator family transporter  27.33 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4244  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  26.84 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2063  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0914  major facilitator transporter  29.64 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00481205  normal  0.205021 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0308  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0584  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.789618  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1325  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.68992  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0983  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.387482  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1245  major facilitator family transporter  27.18 
 
 		 468 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  27 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2231  major facilitator family transporter  24.95 
 
 		 482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4340  general substrate transporter  24.65 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6599  major facilitator superfamily MFS_1  27.55 
 
 		 459 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.332731  normal  0.158495 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.61 
 
 		 460 aa  114  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1269  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 466 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4087  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  28.64 
 
 		 468 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6959  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 479 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 446 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3624  major facilitator superfamily MFS_1  31.2 
 
 		 597 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3311  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.799238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0668  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 474 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00169534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4638  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 		 451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000178504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0856  major facilitator superfamily protein  27 
 
 		 483 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0609243 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 492 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0547  major facilitator superfamily transporter  24.6 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.392915  normal  0.285749 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1268  MFS transporter  24.75 
 
 		 487 aa  111  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1490  major facilitator family transporter  25.95 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0670  general substrate transporter  27.04 
 
 		 459 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3036  major facilitator transporter  24.95 
 
 		 487 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  24.7 
 
 		 480 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0808  major facilitator superfamily MFS_1  25.55 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02027  metabolite transporter  27.14 
 
 		 476 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0613  major facilitator superfamily MFS_1  28.3 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0274336 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0897  major facilitator superfamily MFS_1  27.73 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0894914  normal  0.147269 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4651  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2550  major facilitator transporter  25.95 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.325766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4810  MFS superfamily transporter permease  25.44 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1576  major facilitator superfamily MFS_1  25.91 
 
 		 483 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3358  major facilitator superfamily MFS_1  26.96 
 
 		 459 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  25.16 
 
 		 480 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1523  major facilitator transporter  26.79 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.295641  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1412  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1414  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.34 
 
 		 468 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000198546  normal  0.095851 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5972  major facilitator transporter  24.55 
 
 		 462 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5053  major facilitator superfamily MFS_1  26.34 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.122247 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1431  major facilitator family transporter  26.5 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.475934  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5172  major facilitator transporter  25.17 
 
 		 474 aa  105  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0809503 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0471  major facilitator family transporter  26.5 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0177  major facilitator family transporter  26.5 
 
 		 478 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5109  major facilitator transporter  24.88 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1595  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  26.61 
 
 		 472 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0792  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 458 aa  105  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.753449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>