More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5239 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 		 488 aa  966    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  94.47 
 
 		 497 aa  890    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  94.46 
 
 		 488 aa  888    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  68.88 
 
 		 518 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  69.48 
 
 		 463 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  70.22 
 
 		 553 aa  523  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  52.64 
 
 		 480 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  52.98 
 
 		 463 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  50.83 
 
 		 478 aa  451  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  52.95 
 
 		 461 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  52.64 
 
 		 464 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  52.25 
 
 		 487 aa  448  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  52.57 
 
 		 489 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  50.78 
 
 		 490 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  50.98 
 
 		 522 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  50.33 
 
 		 460 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  50.11 
 
 		 483 aa  395  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  49.34 
 
 		 463 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  44.71 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  42.92 
 
 		 472 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  44.55 
 
 		 438 aa  336  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  43.26 
 
 		 472 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3004  putative outer TolC membrane protein  43.81 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.833992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.95 
 
 		 472 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.4 
 
 		 461 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.43 
 
 		 472 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  40.48 
 
 		 455 aa  306  6e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  42.36 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  42.14 
 
 		 452 aa  296  5e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  41.12 
 
 		 464 aa  292  7e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  37.11 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1781  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.78 
 
 		 517 aa  253  6e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0863506  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.1 
 
 		 497 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2098  putative outer membrane protein tolC  37.39 
 
 		 456 aa  226  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.29 
 
 		 428 aa  223  8e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1003  TolC family type I secretion outer membrane protein  38.33 
 
 		 462 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.09 
 
 		 494 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.43 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0685  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.14 
 
 		 405 aa  193  6e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000118649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3257  Type I secretion outer membrane protein, TolC  35.63 
 
 		 462 aa  191  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.30122  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0186  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.77 
 
 		 485 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1894  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.01 
 
 		 466 aa  187  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.170185  normal  0.445756 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0251  Outer membrane efflux protein  35.2 
 
 		 466 aa  186  6e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608595  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2024  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.71 
 
 		 465 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3542  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.25 
 
 		 477 aa  177  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1991  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.26 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.533391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2262  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.71 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148702  normal  0.873765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4008  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.98 
 
 		 562 aa  166  8e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1445  type I secretion outer membrane protein, TolC family  33.8 
 
 		 460 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.40462 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1020  putative outer membrane protein TolC  28.11 
 
 		 423 aa  150  5e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.808388  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2597  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.59 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2727  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.73 
 
 		 464 aa  149  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  29.29 
 
 		 432 aa  142  9.999999999999999e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  27.75 
 
 		 445 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  26.67 
 
 		 436 aa  136  8e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.42 
 
 		 470 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  27.08 
 
 		 436 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.15 
 
 		 449 aa  134  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.66 
 
 		 470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.55 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.2 
 
 		 475 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.79 
 
 		 472 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.36 
 
 		 501 aa  123  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  26.16 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  25.24 
 
 		 440 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  25.73 
 
 		 425 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  25.43 
 
 		 423 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  25.61 
 
 		 469 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  25.06 
 
 		 471 aa  118  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.67 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.94 
 
 		 471 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  23.29 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.05 
 
 		 471 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.05 
 
 		 471 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.72 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4823  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.54 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.72 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1345  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.34 
 
 		 455 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1598  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.9 
 
 		 459 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.538573  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.37 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.23 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.71 
 
 		 456 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0573  outer membrane channel protein  28.03 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0654  outer membrane channel protein  28.03 
 
 		 464 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.945309  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.48 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.33 
 
 		 450 aa  110  5e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.49 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.49 
 
 		 472 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.98 
 
 		 636 aa  108  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0246  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.7 
 
 		 538 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.08 
 
 		 468 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.81 
 
 		 456 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.55 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.6 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0284  outer membrane channel protein  27.82 
 
 		 465 aa  106  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0729  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.26 
 
 		 444 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000668163 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0575  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.26 
 
 		 444 aa  105  3e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.79 
 
 		 450 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.11 
 
 		 441 aa  103  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>