More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5235 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6504  protease Do  72.29 
 
 		 502 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  73.8 
 
 		 504 aa  702    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5235  protease Do  100 
 
 		 501 aa  981    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5157  protease Do  93.84 
 
 		 503 aa  834    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0527663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4136  protease Do  86.97 
 
 		 496 aa  756    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5124  protease Do  89.78 
 
 		 496 aa  790    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.38057 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  82.22 
 
 		 508 aa  748    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3827  protease Do  86.97 
 
 		 496 aa  758    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4692  protease Do  93.84 
 
 		 503 aa  834    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.601387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0188  protease Do  54.62 
 
 		 524 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.463194 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3077  putative serine protease do-like precursor  53.24 
 
 		 527 aa  462  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2235  protease Do  52.37 
 
 		 529 aa  463  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1019  peptidase S1C, Do  53.32 
 
 		 525 aa  465  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  51.64 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5052  protease Do  52.46 
 
 		 520 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.610685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  50.97 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  53.11 
 
 		 523 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  56.66 
 
 		 537 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3443  peptidase S1C, Do  51.06 
 
 		 528 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203092  normal  0.0980299 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1195  peptidase S1C, Do  53.1 
 
 		 516 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1441  peptidase S1C, Do  52.14 
 
 		 523 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  48.96 
 
 		 527 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  48.01 
 
 		 527 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  49.62 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  45.59 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  50.21 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  50.21 
 
 		 513 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  46.51 
 
 		 505 aa  396  1e-109  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  47.37 
 
 		 491 aa  393  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  48.65 
 
 		 491 aa  391  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  52.14 
 
 		 509 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  47.71 
 
 		 501 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0942  protease Do  44.9 
 
 		 506 aa  355  1e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0681927  normal  0.773505 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  47.29 
 
 		 500 aa  354  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  45.07 
 
 		 511 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  42.05 
 
 		 487 aa  343  5e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  43.2 
 
 		 483 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  43.55 
 
 		 493 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  43.34 
 
 		 506 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2013  protease Do  51.62 
 
 		 524 aa  338  9.999999999999999e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.316391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  44.15 
 
 		 483 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  44.35 
 
 		 483 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  42.88 
 
 		 514 aa  338  1.9999999999999998e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  40.23 
 
 		 524 aa  335  1e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  45.4 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  45.4 
 
 		 511 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  40.15 
 
 		 520 aa  334  3e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.95 
 
 		 493 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  40.04 
 
 		 524 aa  331  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  41.36 
 
 		 523 aa  329  7e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1317  protease Do  42.28 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.278198  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  42.26 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2201  peptidase S1C, Do  41.02 
 
 		 508 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  44.56 
 
 		 498 aa  326  5e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1733  protease Do  40.95 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.613226  hitchhiker  0.00274873 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5274  protease Do  41.31 
 
 		 501 aa  320  3e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  42.18 
 
 		 528 aa  320  3e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1135  protease Do  44.54 
 
 		 535 aa  320  5e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  41.09 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  45.66 
 
 		 497 aa  317  3e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2798  protease Do  39.22 
 
 		 588 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.83064  normal  0.454962 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3911  protease Do  43.42 
 
 		 485 aa  317  4e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  43.25 
 
 		 501 aa  316  7e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2346  peptidase S1C, Do  41.03 
 
 		 496 aa  314  1.9999999999999998e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.466246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2354  protease Do  42.71 
 
 		 518 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.2 
 
 		 500 aa  312  9e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  43.13 
 
 		 516 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  42.73 
 
 		 474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  44.99 
 
 		 498 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  40.59 
 
 		 477 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  42.99 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  44.94 
 
 		 501 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  40.2 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3889  protease Do  41.36 
 
 		 524 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.42007  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40 
 
 		 479 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.91 
 
 		 477 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  41.07 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  43.52 
 
 		 497 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  40.34 
 
 		 499 aa  300  3e-80  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  41.61 
 
 		 492 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.57 
 
 		 458 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  43.98 
 
 		 498 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  41.42 
 
 		 499 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  46.11 
 
 		 578 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  44.08 
 
 		 476 aa  297  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.96 
 
 		 475 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  43.93 
 
 		 505 aa  296  5e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.81 
 
 		 476 aa  296  7e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  43.65 
 
 		 464 aa  296  8e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3331  peptidase S1C, Do  40.3 
 
 		 510 aa  295  9e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.107916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  41.22 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  44.55 
 
 		 473 aa  295  1e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  42.38 
 
 		 474 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  39.69 
 
 		 475 aa  293  4e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.76 
 
 		 481 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  40.16 
 
 		 509 aa  293  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  40.11 
 
 		 525 aa  291  2e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  39.41 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.72 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  41.49 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>