More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1862 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  63.71 
 
 		 620 aa  808    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  100 
 
 		 618 aa  1276    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  74.56 
 
 		 622 aa  960    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  51.95 
 
 		 610 aa  637    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  72.74 
 
 		 617 aa  931    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  51.78 
 
 		 604 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  49.1 
 
 		 512 aa  399  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  47 
 
 		 513 aa  389  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  39.75 
 
 		 547 aa  390  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  39.37 
 
 		 546 aa  385  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  37.94 
 
 		 546 aa  386  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  38.29 
 
 		 546 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  39.47 
 
 		 549 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 543 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  37.1 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  34.49 
 
 		 557 aa  343  5e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.96 
 
 		 557 aa  343  8e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  33.96 
 
 		 559 aa  338  1.9999999999999998e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 557 aa  337  5e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  40.32 
 
 		 547 aa  318  2e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  37.7 
 
 		 609 aa  296  6e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  38.21 
 
 		 654 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  38.04 
 
 		 749 aa  283  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  34.83 
 
 		 682 aa  282  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  37.96 
 
 		 831 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  39.47 
 
 		 558 aa  281  2e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  38.61 
 
 		 628 aa  281  3e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  42.02 
 
 		 847 aa  280  8e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  41.83 
 
 		 797 aa  279  9e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  39.03 
 
 		 545 aa  275  1.0000000000000001e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  38.04 
 
 		 791 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  41.57 
 
 		 1255 aa  272  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  40.35 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  42.9 
 
 		 583 aa  271  4e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  36.87 
 
 		 542 aa  270  8e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  38.87 
 
 		 671 aa  268  2e-70  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  38.13 
 
 		 556 aa  267  5e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  40.87 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  42.43 
 
 		 1335 aa  265  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  41.09 
 
 		 640 aa  264  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  38.67 
 
 		 549 aa  264  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  42.14 
 
 		 1319 aa  261  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  37.03 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  40.65 
 
 		 591 aa  256  6e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  37.28 
 
 		 770 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  38.59 
 
 		 510 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  35.59 
 
 		 519 aa  251  3e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  36.06 
 
 		 991 aa  250  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  45.02 
 
 		 612 aa  240  5.999999999999999e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  36.7 
 
 		 722 aa  237  4e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 577 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  35.96 
 
 		 572 aa  212  2e-53  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  32.21 
 
 		 491 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.41 
 
 		 492 aa  195  2e-48  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.41 
 
 		 492 aa  194  5e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  29.56 
 
 		 489 aa  181  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  34.62 
 
 		 548 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  34.34 
 
 		 552 aa  177  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 544 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  34.07 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 553 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 553 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 553 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.42 
 
 		 553 aa  164  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  32.73 
 
 		 473 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.31 
 
 		 444 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0503  type II secretion system protein E  33.66 
 
 		 411 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.731601  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  31.58 
 
 		 311 aa  153  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  29.15 
 
 		 438 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  32.93 
 
 		 452 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  31.96 
 
 		 446 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  31.62 
 
 		 478 aa  151  4e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  32.63 
 
 		 450 aa  150  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  28.65 
 
 		 476 aa  150  6e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  30.79 
 
 		 449 aa  150  8e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  32.59 
 
 		 463 aa  150  9e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  32.67 
 
 		 412 aa  150  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  32.55 
 
 		 474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  29.49 
 
 		 428 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  29.4 
 
 		 428 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 454 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  29.4 
 
 		 428 aa  149  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000662566  hitchhiker  0.0000000763288 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  33.23 
 
 		 466 aa  148  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  30.39 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 447 aa  148  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.29 
 
 		 447 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  32.32 
 
 		 445 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 450 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000031609 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  32.93 
 
 		 467 aa  147  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 450 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 450 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 455 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 468 aa  146  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  29.07 
 
 		 498 aa  146  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  32.54 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  30.64 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  32.31 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  29.61 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>