131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1590 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  662    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  60.94 
 
 		 565 aa  423  1e-117  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  64.15 
 
 		 331 aa  419  1e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  61.32 
 
 		 329 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  59.43 
 
 		 327 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  52.2 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  50.63 
 
 		 325 aa  332  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  48.42 
 
 		 351 aa  292  4e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  47.44 
 
 		 380 aa  293  4e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  48.23 
 
 		 352 aa  292  6e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  47.47 
 
 		 352 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  47.15 
 
 		 352 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  47.28 
 
 		 326 aa  287  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.84 
 
 		 393 aa  271  9e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  43.88 
 
 		 856 aa  270  2e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  43.88 
 
 		 859 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  43.88 
 
 		 859 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  44.28 
 
 		 881 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  42.3 
 
 		 867 aa  268  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  43.58 
 
 		 859 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.79 
 
 		 863 aa  268  8.999999999999999e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  45.82 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  43.63 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  42.39 
 
 		 859 aa  265  7e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  42.69 
 
 		 859 aa  265  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  44.41 
 
 		 372 aa  263  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  42.47 
 
 		 838 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.94 
 
 		 871 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  42.69 
 
 		 859 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.25 
 
 		 875 aa  259  3e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.52 
 
 		 389 aa  259  4e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  43.2 
 
 		 852 aa  258  8e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  39.7 
 
 		 392 aa  256  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  41.32 
 
 		 836 aa  257  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  41.62 
 
 		 860 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  42.55 
 
 		 380 aa  255  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  41.28 
 
 		 842 aa  255  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  41.69 
 
 		 857 aa  252  5.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  43.48 
 
 		 800 aa  249  5e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.81 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  41.54 
 
 		 416 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  43.17 
 
 		 792 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  40.53 
 
 		 841 aa  246  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  42.9 
 
 		 779 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  44.3 
 
 		 826 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  41.36 
 
 		 811 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  41.99 
 
 		 884 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  39.94 
 
 		 820 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  38.67 
 
 		 390 aa  242  7e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  43.81 
 
 		 386 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.77 
 
 		 872 aa  241  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  43.81 
 
 		 899 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  42.6 
 
 		 944 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  40 
 
 		 430 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.53 
 
 		 741 aa  223  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  44.16 
 
 		 841 aa  221  9.999999999999999e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  40.2 
 
 		 757 aa  209  5e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  37.61 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.72 
 
 		 737 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  38.03 
 
 		 321 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  36.23 
 
 		 737 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  37.46 
 
 		 340 aa  187  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  38.87 
 
 		 318 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  38.56 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  36.22 
 
 		 307 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  38.39 
 
 		 325 aa  175  8e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  35.83 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  27.57 
 
 		 360 aa  70.1  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  26.62 
 
 		 419 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  25.36 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  25.87 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  26.9 
 
 		 515 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1738  biotin synthase  26.42 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  23.38 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 		 404 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  28.02 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 362 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  27.05 
 
 		 376 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1552  biotin synthase  26.36 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  26.07 
 
 		 358 aa  53.9  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0826  biotin synthase  25.97 
 
 		 341 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.247996  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 355 aa  52.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  24.41 
 
 		 362 aa  52.4  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  25.35 
 
 		 453 aa  52.4  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 364 aa  52.4  0.000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  23.53 
 
 		 384 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  26.7 
 
 		 368 aa  52  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  23.03 
 
 		 365 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  24.17 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  23.94 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  23.33 
 
 		 352 aa  50.1  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  24.54 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  23.99 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 355 aa  48.5  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1026  biotin synthase  27.81 
 
 		 344 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>