More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1543 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  42.18 
 
 
274 aa  245  6e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  42.03 
 
 
273 aa  237  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  41.97 
 
 
272 aa  221  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  36.4 
 
 
275 aa  216  4e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  36.13 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  38.41 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  37.77 
 
 
274 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  41.52 
 
 
272 aa  199  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  38.04 
 
 
273 aa  191  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  34.91 
 
 
277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  36.13 
 
 
273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  38.63 
 
 
282 aa  175  8e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  38.03 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  35.66 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  35.04 
 
 
275 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  34.06 
 
 
265 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  35.82 
 
 
263 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  32.73 
 
 
274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  33.94 
 
 
274 aa  165  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  33.21 
 
 
275 aa  165  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  34.67 
 
 
271 aa  161  9e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  33.94 
 
 
262 aa  159  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  34.53 
 
 
295 aa  155  4e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  32.71 
 
 
279 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  30.63 
 
 
277 aa  141  9e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  32.85 
 
 
273 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  32.26 
 
 
274 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  30.86 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  32.12 
 
 
271 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  28.26 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  30.47 
 
 
278 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
272 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  30.6 
 
 
272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  26.5 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  26.27 
 
 
345 aa  99.4  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  27.37 
 
 
263 aa  95.9  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28.97 
 
 
334 aa  95.5  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  25.52 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  25.17 
 
 
303 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  25.09 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  27.37 
 
 
295 aa  92.4  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  28 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.75 
 
 
188 aa  83.2  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.57 
 
 
191 aa  79.7  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  27.64 
 
 
202 aa  78.2  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.61 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  25 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  28.79 
 
 
194 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  27.89 
 
 
196 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  27.11 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1055  nitroreductase  27.65 
 
 
192 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  28.57 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  28.57 
 
 
191 aa  70.9  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  26.51 
 
 
194 aa  70.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  30.27 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  28.28 
 
 
194 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.96 
 
 
163 aa  68.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2980  nitroreductase  27.17 
 
 
189 aa  68.2  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.800922  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  30.34 
 
 
168 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  27.54 
 
 
189 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  25.41 
 
 
186 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  29 
 
 
190 aa  67  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  28.65 
 
 
178 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  30.36 
 
 
174 aa  67.4  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4759  nitroreductase  26.27 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000691202  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  25.14 
 
 
183 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  27.12 
 
 
189 aa  65.1  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  26.53 
 
 
178 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4554  nitroreductase  28.29 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.644271  normal  0.2444 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0586  hypothetical protein  27.66 
 
 
188 aa  63.5  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0626117  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  24.14 
 
 
184 aa  63.9  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.87 
 
 
245 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  27.12 
 
 
189 aa  63.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0547  nitroreductase  23.49 
 
 
185 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000441926  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0660  nitroreductase  27.84 
 
 
189 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  29.34 
 
 
165 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1475  nitroreductase  27.91 
 
 
175 aa  62  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.254449  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  30.68 
 
 
170 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  29.38 
 
 
166 aa  61.6  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  27.37 
 
 
178 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1469  nitroreductase  28.11 
 
 
188 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.76 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.76 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.76 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0690  nitroreductase  24.59 
 
 
246 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0134674  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.76 
 
 
215 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_002950  PG0734  nitroreductase family protein  25.71 
 
 
183 aa  60.1  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  23.84 
 
 
171 aa  60.1  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0509  nitroreductase  27.87 
 
 
181 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  25.77 
 
 
176 aa  60.1  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  27.71 
 
 
184 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3446  nitroreductase  26.63 
 
 
184 aa  59.3  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.89 
 
 
176 aa  59.3  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  28.8 
 
 
185 aa  58.9  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  28.57 
 
 
184 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  28.57 
 
 
184 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0081  nitroreductase  31.07 
 
 
181 aa  58.2  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0146906  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  26.09 
 
 
173 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  30.5 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>