More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0297 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0297  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  396  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0512572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5773  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 212 aa  147  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3581  TetR family transcriptional regulator  45.55 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.919672  normal  0.194712 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 200 aa  104  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 191 aa  85.1  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4918  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0982  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  38.05 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  33.17 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4395  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2588  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2506  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.368527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 209 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  38.84 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2776  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376535  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2249  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1085  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.973817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1058  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1074  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  0.111345 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  60.78 
 
 		 185 aa  58.9  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1562  putative transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.196181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3404  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.64747  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11701  hypothetical protein  31.07 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.107847 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5487  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0873  TetR family transcriptional regulator  56.36 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1232  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0252  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 246 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0253  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.920099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3080  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0935243  normal  0.29502 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0641  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.109704  normal  0.126118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0125  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.493759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0260  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 258 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0576  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 231 aa  52  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3330  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.648103  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 221 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2723  regulatory protein TetR  38.81 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.769324  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 186 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0744  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  50 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3411  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  0.0722688 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4343  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0349599  decreased coverage  0.000000750918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1298  transcriptional regulator TetR family  42.37 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 184 aa  50.1  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0590  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  23.03 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  42.42 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  49.06 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 248 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 233 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6679  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.874837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10145  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 280 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0851  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>