More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2355 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  100 
 
 
628 aa  1296  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  65.48 
 
 
640 aa  684  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  67.59 
 
 
549 aa  761  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  51.9 
 
 
549 aa  543  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  48.08 
 
 
542 aa  508  1e-142  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  47.83 
 
 
558 aa  505  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  48.71 
 
 
556 aa  498  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  47.8 
 
 
797 aa  483  1e-135  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  48.84 
 
 
770 aa  480  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  47.5 
 
 
551 aa  475  1e-132  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  48.22 
 
 
591 aa  469  1e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  47.06 
 
 
682 aa  459  1e-128  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  47.26 
 
 
749 aa  460  1e-128  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  44.94 
 
 
609 aa  454  1e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  45.21 
 
 
791 aa  451  1e-125  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  45.12 
 
 
654 aa  447  1e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  43.6 
 
 
547 aa  442  1e-122  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  39.51 
 
 
583 aa  386  1e-106  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  42.42 
 
 
545 aa  380  1e-104  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  45.39 
 
 
1255 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  43.56 
 
 
692 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  37.94 
 
 
831 aa  372  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  38.88 
 
 
1319 aa  370  1e-101  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
1335 aa  366  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  42.7 
 
 
991 aa  362  9e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  36.79 
 
 
847 aa  362  1e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  39.72 
 
 
722 aa  356  7e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  39.87 
 
 
510 aa  330  4e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  41.4 
 
 
612 aa  315  2e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  36.85 
 
 
671 aa  313  8e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  37.5 
 
 
519 aa  305  2e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  35.16 
 
 
512 aa  298  2e-79  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  40.32 
 
 
604 aa  290  5e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  39.45 
 
 
617 aa  285  2e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  38.99 
 
 
513 aa  283  5e-75  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  37.39 
 
 
547 aa  283  5e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  39.11 
 
 
622 aa  283  9e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  39.14 
 
 
620 aa  283  9e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  38.61 
 
 
618 aa  281  3e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  38.89 
 
 
610 aa  279  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  38.64 
 
 
549 aa  275  2e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  35.5 
 
 
492 aa  271  3e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.85 
 
 
491 aa  271  4e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  34.87 
 
 
492 aa  266  8e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  34.7 
 
 
546 aa  264  3e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  37.24 
 
 
546 aa  262  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  34.67 
 
 
546 aa  261  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  32.77 
 
 
489 aa  260  5e-68  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  37.35 
 
 
546 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  37.08 
 
 
543 aa  255  2e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  32.77 
 
 
557 aa  246  1e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  34.99 
 
 
557 aa  245  2e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  30.95 
 
 
557 aa  244  2e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  29.89 
 
 
557 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  33.85 
 
 
559 aa  242  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  32.81 
 
 
548 aa  239  8e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
577 aa  239  1e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
552 aa  235  2e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  32.25 
 
 
572 aa  232  1e-59  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  33.2 
 
 
552 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  36.91 
 
 
553 aa  216  1e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  36.91 
 
 
553 aa  216  1e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  36.91 
 
 
553 aa  216  1e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  36.91 
 
 
553 aa  216  1e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  34.37 
 
 
544 aa  212  2e-53  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  37.46 
 
 
311 aa  209  2e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  33.55 
 
 
515 aa  190  7e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  33.85 
 
 
473 aa  184  3e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  32 
 
 
440 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  30.93 
 
 
521 aa  173  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  31.04 
 
 
476 aa  171  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  31.55 
 
 
498 aa  171  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  34.48 
 
 
412 aa  167  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  30.07 
 
 
442 aa  165  2e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  33.51 
 
 
677 aa  164  4e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  34.23 
 
 
417 aa  164  4e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  30.64 
 
 
634 aa  164  4e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  34.09 
 
 
504 aa  164  5e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
445 aa  163  7e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  30.52 
 
 
467 aa  163  8e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  29.76 
 
 
463 aa  163  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  27.41 
 
 
639 aa  163  9e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  31.01 
 
 
563 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  33.14 
 
 
451 aa  162  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  32.94 
 
 
447 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  32.65 
 
 
446 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  31.03 
 
 
594 aa  161  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  31.56 
 
 
438 aa  161  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  32.94 
 
 
447 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  32.94 
 
 
447 aa  161  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  32.59 
 
 
440 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  30.41 
 
 
463 aa  161  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  30.61 
 
 
445 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  31.99 
 
 
428 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  31.99 
 
 
428 aa  160  5e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.62566e-05  hitchhiker  7.63288e-08 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  31.99 
 
 
428 aa  160  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  32.49 
 
 
454 aa  160  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  32.59 
 
 
447 aa  160  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  34.2 
 
 
521 aa  160  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  34.2 
 
 
523 aa  160  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>