More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf023 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  100 
 
 		 457 aa  940    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  38.48 
 
 		 449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  37.53 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  33.18 
 
 		 444 aa  236  9e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  33.69 
 
 		 465 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  32.75 
 
 		 464 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  31.03 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  32.25 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  31.03 
 
 		 468 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  31.03 
 
 		 468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  31.12 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  30.8 
 
 		 468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  30.8 
 
 		 468 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  30.8 
 
 		 468 aa  196  6e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  30.11 
 
 		 468 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  30.95 
 
 		 467 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  29.12 
 
 		 469 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  29.31 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  30.79 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  30.79 
 
 		 465 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  28.73 
 
 		 464 aa  186  6e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  29.46 
 
 		 473 aa  183  5.0000000000000004e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  28.78 
 
 		 463 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  29.79 
 
 		 467 aa  172  9e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  28.99 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  28.99 
 
 		 469 aa  172  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  30.7 
 
 		 469 aa  170  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  28.54 
 
 		 464 aa  169  7e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  28.01 
 
 		 484 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  29.24 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  28.48 
 
 		 481 aa  158  2e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  29.51 
 
 		 468 aa  152  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  29.66 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  25.97 
 
 		 481 aa  145  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  25.95 
 
 		 473 aa  144  5e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.39 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  26.62 
 
 		 438 aa  139  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  26.43 
 
 		 470 aa  136  7.000000000000001e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  25.95 
 
 		 471 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  26.22 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  27.1 
 
 		 504 aa  128  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  24.03 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  27.52 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  26.43 
 
 		 508 aa  114  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.16 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  25.61 
 
 		 575 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  27.03 
 
 		 525 aa  111  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  24.22 
 
 		 576 aa  106  8e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  24.43 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  24.71 
 
 		 533 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  24.47 
 
 		 533 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  23.11 
 
 		 592 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  25.25 
 
 		 534 aa  103  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  24.71 
 
 		 533 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  25.25 
 
 		 579 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  22.77 
 
 		 591 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  24.18 
 
 		 547 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  28.09 
 
 		 579 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  27.51 
 
 		 407 aa  92  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  23.71 
 
 		 547 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  26.26 
 
 		 579 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  23.24 
 
 		 547 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  24.08 
 
 		 585 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  25.43 
 
 		 579 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  24.08 
 
 		 576 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  23.8 
 
 		 576 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  23.23 
 
 		 576 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  25.42 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  24.82 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  26.96 
 
 		 421 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  24.18 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  26.15 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.55 
 
 		 395 aa  67  0.0000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7333  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.54 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.05 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  31.45 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  29.13 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  24.56 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.14 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.14 
 
 		 382 aa  63.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  28.83 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.99 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  23.35 
 
 		 423 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0641  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  21.99 
 
 		 411 aa  59.7  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.26 
 
 		 405 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.67 
 
 		 375 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  40.28 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0549  peptidase M20  29.92 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1195  peptidase dimerisation domain protein  25.99 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.944845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3697  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.51 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.891893  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.78 
 
 		 442 aa  58.2  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  25.16 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.82 
 
 		 375 aa  57.8  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.56 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1360  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.83 
 
 		 463 aa  57  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489554  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3926  hypothetical protein  26.95 
 
 		 453 aa  57  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0560355  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.86 
 
 		 375 aa  57  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.86 
 
 		 375 aa  57  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.86 
 
 		 375 aa  57  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02325  hypothetical protein  31.86 
 
 		 375 aa  57  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>