More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25000 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 		 263 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0264  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.31 
 
 		 284 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2241  helix-turn-helix domain-containing protein  34.66 
 
 		 277 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4454  helix-turn-helix domain-containing protein  35.46 
 
 		 280 aa  119  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3952  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3966  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0381394 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4026  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546725  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4529  Helix-turn-helix, AraC domain protein  34.36 
 
 		 303 aa  109  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.453495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4393  transcriptional regulator, AraC family  35.18 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.287242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0145  Helix-turn-helix, AraC domain protein  33.46 
 
 		 276 aa  95.1  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0118  transcriptional regulator, AraC family  34.73 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5692  transcriptional regulator, AraC family  32.28 
 
 		 271 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0876527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5221  AraC family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.343965  normal  0.936054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3383  AraC family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 271 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0958  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  57.5 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0644351  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6191  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 282 aa  83.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.343343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0106  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.61 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0383824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4510  transcriptional regulator, AraC family  34.8 
 
 		 268 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4039  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0024992  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2942  AraC family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2463  transcriptional regulator, AraC family  31.45 
 
 		 248 aa  73.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2970  transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 276 aa  72  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3117 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2409  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 285 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2289  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4242  AraC family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0462  helix-turn-helix domain-containing protein  34.58 
 
 		 277 aa  69.7  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3571  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0312904  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1550  transcriptional regulator, AraC family  37.36 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17370  hypothetical protein  33.07 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.457096  normal  0.0989396 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3379  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  25.97 
 
 		 285 aa  65.9  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1287  helix-turn-helix domain-containing protein  22.77 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2569  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1649  transcriptional regulator, AraC family  27.14 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1384  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.976076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3242  transcriptional regulator, AraC family  28.96 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1425  AraC family transcriptional regulator  25 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333229  normal  0.212879 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1097  AraC family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0312  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00105398  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1657  AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.441347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2585  AraC family transcription regulator  33.96 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.429451  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2449  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1298  AraC family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00392823  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  37.65 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2329  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 310 aa  58.9  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0973  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 131 aa  58.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3491  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  35.36 
 
 		 248 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.873447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1310  transcriptional regulator, AraC family  24.19 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.497978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  38.2 
 
 		 284 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0886  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 316 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7915  transcriptional regulator, AraC family  40.86 
 
 		 330 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0435476  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1190  AraC family transcriptional regulator  20.78 
 
 		 271 aa  57.4  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000541539 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8583  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 331 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.486206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1012  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2330  helix-turn-helix domain-containing protein  30 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  26.27 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0099  transcriptional regulator, AraC family  23.98 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7339  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 278 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.725809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 279 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02106  transcriptional regulator AraC/xylS family  34.51 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0678  AraC family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7200  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  35.56 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 348 aa  56.2  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2378  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 322 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163707 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  40 
 
 		 294 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  35.09 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2622  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3159  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0609208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5120  transcriptional regulator, AraC family  30.34 
 
 		 275 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.282168 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1835  helix-turn-helix domain-containing protein  30.26 
 
 		 277 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.140482  normal  0.818318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3003  transcriptional regulator, AraC family  38.67 
 
 		 240 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723875 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2795  AraC family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  42.03 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1669  PAS fold-4 domain protein  35.63 
 
 		 261 aa  54.3  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0279  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.431722  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4803  transcriptional regulator, AraC family  27.47 
 
 		 299 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.413232 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3502  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 355 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  30.12 
 
 		 188 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 341 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3152  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 257 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0294751  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 		 332 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2715  putative regulatory protein  26.94 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.241271  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1460  AraC family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2143  transcriptional regulator, AraC family  26.25 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 281 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1224  Helix-turn-helix, AraC domain protein  32.96 
 
 		 289 aa  53.9  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276562  normal  0.797309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>