More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03750 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_03750  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  100 
 
 
228 aa  464  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0915981 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  62.38 
 
 
210 aa  266  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0409  beta-lactamase domain protein  55.83 
 
 
208 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1330  beta-lactamase domain-containing protein  57.84 
 
 
205 aa  246  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.422414 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  56.02 
 
 
218 aa  243  3e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  58.05 
 
 
208 aa  239  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0093  beta-lactamase domain protein  52.2 
 
 
210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  57.97 
 
 
207 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0909  beta-lactamase domain protein  55.71 
 
 
213 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324643  normal  0.0194681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3768  beta-lactamase domain protein  55.83 
 
 
209 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0366381  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3381  beta-lactamase-like protein  53.81 
 
 
210 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.302529  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3443  beta-lactamase domain-containing protein  53.81 
 
 
210 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3392  beta-lactamase domain-containing protein  53.81 
 
 
210 aa  231  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.302908  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12288  hypothetical protein  54.33 
 
 
211 aa  229  2e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3768  beta-lactamase domain-containing protein  52.63 
 
 
209 aa  227  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.905496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2903  beta-lactamase domain protein  56.78 
 
 
202 aa  227  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18790  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  51.71 
 
 
208 aa  225  5.0000000000000005e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.659057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2765  beta-lactamase domain-containing protein  51.2 
 
 
209 aa  223  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.268698  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1402  beta-lactamase domain-containing protein  56.86 
 
 
204 aa  224  1e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147744  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1448  beta-lactamase-like  54.5 
 
 
216 aa  219  3e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65636  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  53.57 
 
 
206 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4760  beta-lactamase domain protein  55.67 
 
 
202 aa  218  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  54.36 
 
 
206 aa  218  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  53.33 
 
 
215 aa  207  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15320  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  55.38 
 
 
204 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3650  beta-lactamase domain-containing protein  53.61 
 
 
207 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335819  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4164  beta-lactamase domain protein  52.45 
 
 
205 aa  201  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420537  normal  0.04389 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2886  beta-lactamase domain protein  51.27 
 
 
220 aa  201  9e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3936  putative hydrolase  50 
 
 
211 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21860  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  51.72 
 
 
574 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2999  beta-lactamase domain-containing protein  41.58 
 
 
235 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.658581 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1196  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 
235 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.269825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8397  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  41.58 
 
 
238 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  43.32 
 
 
195 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2551  putative hydrolase  43.09 
 
 
209 aa  142  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.505017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0512  Zn-dependent hydrolase  36.45 
 
 
275 aa  141  8e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.146741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3834  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase  36.95 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.537571 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.31 
 
 
211 aa  125  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  36.65 
 
 
212 aa  123  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  36.84 
 
 
208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  35.6 
 
 
209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 
209 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 
209 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  36.31 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  35.6 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  35.75 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  36.9 
 
 
213 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  34.55 
 
 
209 aa  115  6e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  34.55 
 
 
209 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  36.84 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  34.87 
 
 
212 aa  111  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  37.17 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  37.04 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
209 aa  109  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.2 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 
231 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  38.74 
 
 
213 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  34.57 
 
 
214 aa  106  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 
209 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  36.7 
 
 
198 aa  106  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  36.81 
 
 
206 aa  106  3e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  36.45 
 
 
231 aa  106  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0705  beta-lactamase domain protein  36.02 
 
 
201 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  36.87 
 
 
205 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 
210 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  33.03 
 
 
225 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  36.36 
 
 
209 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
217 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  36.36 
 
 
210 aa  103  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  35.38 
 
 
204 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.22 
 
 
251 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  37.82 
 
 
229 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  36.41 
 
 
225 aa  102  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  34.72 
 
 
201 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  34.39 
 
 
214 aa  101  9e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  34.34 
 
 
209 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  34.74 
 
 
219 aa  101  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  37.17 
 
 
203 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12601  glyoxalase II (hydroxyacylglutathione hydrolase)  36.18 
 
 
246 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0111807  normal  0.957918 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  33.68 
 
 
221 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  36.41 
 
 
225 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.33 
 
 
229 aa  99.8  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  34.83 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3340  beta-lactamase domain-containing protein  34.36 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154999  normal  0.696965 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  33.15 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.11 
 
 
215 aa  99.4  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  37.13 
 
 
229 aa  99  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4688  hypothetical protein  36.17 
 
 
207 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0539  beta-lactamase domain-containing protein  35.16 
 
 
205 aa  99  5e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  30.81 
 
 
212 aa  99  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  35.64 
 
 
207 aa  99  6e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 
218 aa  98.6  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 
207 aa  98.2  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3357  beta-lactamase domain protein  36.14 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0111217  normal  0.160448 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  35.64 
 
 
217 aa  97.8  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53510  hypothetical protein  36.17 
 
 
213 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000645977 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>