More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1224 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  100 
 
 
156 aa  308  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  60.14 
 
 
153 aa  191  3e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  61.49 
 
 
155 aa  187  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  59.73 
 
 
156 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  47.71 
 
 
180 aa  123  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  46.94 
 
 
144 aa  113  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  41.5 
 
 
290 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  43.71 
 
 
152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  40.51 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  43.54 
 
 
288 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  42.36 
 
 
164 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  43.23 
 
 
159 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  39.33 
 
 
150 aa  104  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.07 
 
 
152 aa  104  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  42.86 
 
 
149 aa  103  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  40.26 
 
 
149 aa  101  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  39.88 
 
 
305 aa  99.8  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  36.36 
 
 
147 aa  99  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  41.89 
 
 
307 aa  99.4  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  42.18 
 
 
158 aa  99.4  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  43.84 
 
 
301 aa  97.1  8e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  40.4 
 
 
145 aa  97.1  9e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  37.18 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  35.76 
 
 
145 aa  96.3  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  41.22 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.73 
 
 
286 aa  95.1  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  38.82 
 
 
297 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  36.18 
 
 
207 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.57 
 
 
145 aa  94.4  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  39.33 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  38.26 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  37.34 
 
 
147 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  40.14 
 
 
148 aa  92.4  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  40.94 
 
 
133 aa  92.8  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  38.51 
 
 
151 aa  92  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.15 
 
 
141 aa  92  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  41.22 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  39.46 
 
 
147 aa  92  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.67 
 
 
145 aa  91.7  4e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  41.06 
 
 
147 aa  91.3  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0480  UspA domain protein  40.82 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  41.29 
 
 
148 aa  90.9  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  36.42 
 
 
156 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  35.5 
 
 
169 aa  90.1  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.48 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2198  hypothetical protein  39.86 
 
 
145 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.76051  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  36.73 
 
 
208 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  38.51 
 
 
156 aa  89  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  37.93 
 
 
170 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  37.93 
 
 
170 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  36.84 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  41.5 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0592  UspA domain protein  34.27 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000217039  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.31 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 
167 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3643  UspA domain protein  40.27 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0969583  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  35.4 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  39.19 
 
 
151 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  35.62 
 
 
159 aa  87.8  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3459  hypothetical protein  38.51 
 
 
145 aa  87.4  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.450632  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  42.67 
 
 
283 aa  87  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  35.71 
 
 
142 aa  87  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.31 
 
 
300 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  37.67 
 
 
287 aa  86.7  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  36.49 
 
 
281 aa  85.9  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  33.33 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  36.88 
 
 
167 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1083  UspA domain-containing protein  35.26 
 
 
449 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000280681  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4014  UspA domain protein  38.78 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  38.36 
 
 
200 aa  85.1  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  38.67 
 
 
149 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  38.1 
 
 
153 aa  84.7  5e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4347  UspA domain protein  39.58 
 
 
140 aa  84.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.103556  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2779  UspA domain protein  34.87 
 
 
142 aa  84.3  6e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.53 
 
 
148 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  37.24 
 
 
169 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2278  UspA domain protein  39.33 
 
 
143 aa  84  8e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
145 aa  84  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  39.86 
 
 
280 aa  83.6  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
128 aa  83.6  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  36.49 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3082  UspA domain protein  36.49 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  38.16 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 
163 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  38.93 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  38.12 
 
 
304 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  36.42 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  35.48 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  37.41 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  34.23 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  35.29 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  34.9 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1541  hypothetical protein  35.86 
 
 
181 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.44 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0959  UspA domain protein  37.18 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.260464  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  34 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0081  UspA domain protein  39.46 
 
 
137 aa  80.9  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>