More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0147 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  100 
 
 
1193 aa  2364    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  37.39 
 
 
1067 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  29.62 
 
 
1082 aa  242  2.9999999999999997e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  27.56 
 
 
1090 aa  222  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  27.02 
 
 
1097 aa  219  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  25.72 
 
 
1181 aa  201  5e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  26.5 
 
 
1183 aa  199  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  26.45 
 
 
1084 aa  196  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  29.76 
 
 
1069 aa  194  1e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.91 
 
 
1117 aa  189  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  27.54 
 
 
1104 aa  184  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  28.33 
 
 
1125 aa  184  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  26.09 
 
 
1092 aa  183  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.46 
 
 
1076 aa  178  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  29.84 
 
 
1059 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  27.72 
 
 
1016 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  25.76 
 
 
1094 aa  176  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  25.36 
 
 
1094 aa  174  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  27.35 
 
 
1167 aa  172  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  25.22 
 
 
1094 aa  171  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  25.22 
 
 
1094 aa  170  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  25.07 
 
 
1094 aa  167  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  24.89 
 
 
1094 aa  163  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  25.25 
 
 
1104 aa  162  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  24.6 
 
 
1094 aa  160  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  25.4 
 
 
1093 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  32.07 
 
 
1051 aa  158  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  29.89 
 
 
1089 aa  158  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  25.4 
 
 
1093 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  25.36 
 
 
1093 aa  157  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  26.09 
 
 
1084 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  24.64 
 
 
1097 aa  154  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  24.96 
 
 
1094 aa  153  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  32.41 
 
 
1186 aa  152  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  23.2 
 
 
1079 aa  148  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  28.07 
 
 
1065 aa  145  5e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  30.16 
 
 
1147 aa  140  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  27.03 
 
 
1107 aa  139  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  23.83 
 
 
1075 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  27.01 
 
 
1008 aa  125  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  25.79 
 
 
1354 aa  108  5e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  27.51 
 
 
1545 aa  103  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  27.51 
 
 
1545 aa  102  6e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  26.28 
 
 
428 aa  101  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  24.36 
 
 
410 aa  94  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.06 
 
 
425 aa  93.2  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  27.58 
 
 
418 aa  92.4  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  26.4 
 
 
401 aa  90.9  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  25.65 
 
 
427 aa  90.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  27.4 
 
 
379 aa  89  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  28.36 
 
 
415 aa  87  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  27.96 
 
 
440 aa  86.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  25.13 
 
 
465 aa  86.7  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  25.55 
 
 
432 aa  86.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  26.4 
 
 
389 aa  85.9  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.93 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  26.98 
 
 
457 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  28.5 
 
 
1067 aa  84  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  27.11 
 
 
1111 aa  83.2  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  24.28 
 
 
410 aa  82  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  29.13 
 
 
1042 aa  82  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  25.53 
 
 
1113 aa  81.6  0.00000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  25.52 
 
 
1069 aa  81.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  27.18 
 
 
1062 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  27.75 
 
 
1066 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  24.53 
 
 
446 aa  79  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  25.96 
 
 
1081 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  28.09 
 
 
377 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  28.61 
 
 
1042 aa  77.4  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  27.56 
 
 
434 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  27.36 
 
 
1484 aa  77.8  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  23.41 
 
 
423 aa  77  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  26.17 
 
 
398 aa  76.6  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  28.28 
 
 
383 aa  76.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  24.29 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1857  carboxyl-terminal protease  27.18 
 
 
429 aa  76.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000520735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  28.35 
 
 
1040 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  26.43 
 
 
1065 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  25.27 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  25.06 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3721  carboxyl-terminal protease  25.54 
 
 
478 aa  75.1  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.06 
 
 
483 aa  74.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  28.48 
 
 
407 aa  73.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1429  tol biopolymer transport system, periplasmic protein  32.37 
 
 
313 aa  73.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435538  normal  0.112486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  24.32 
 
 
1060 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3606  carboxyl-terminal protease  26.37 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000172646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  27.03 
 
 
476 aa  72.8  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  25.35 
 
 
710 aa  72  0.00000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  24.3 
 
 
482 aa  71.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  23.45 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  25.55 
 
 
394 aa  71.6  0.00000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  26.15 
 
 
434 aa  71.6  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.17 
 
 
426 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  25.67 
 
 
426 aa  70.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  25.06 
 
 
409 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  38.84 
 
 
567 aa  71.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  28.29 
 
 
402 aa  71.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  28.29 
 
 
402 aa  71.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  25.17 
 
 
470 aa  70.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  24.24 
 
 
469 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>