More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4240 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1064 aa  2157    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
687 aa  293  9e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  33.65 
 
 
998 aa  284  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  34.32 
 
 
792 aa  283  9e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
991 aa  283  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.14 
 
 
803 aa  281  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
798 aa  280  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  28.35 
 
 
1046 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
974 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
1271 aa  274  5.000000000000001e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
975 aa  271  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 
796 aa  270  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
970 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
823 aa  269  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  34.12 
 
 
910 aa  269  2.9999999999999995e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
1172 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
791 aa  264  4.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1362 aa  265  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  33.92 
 
 
1361 aa  265  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3558  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.9 
 
 
984 aa  264  6.999999999999999e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.299477 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 
858 aa  264  8e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.94 
 
 
933 aa  260  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  30.12 
 
 
1629 aa  259  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
977 aa  257  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 
917 aa  250  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
927 aa  244  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
755 aa  242  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1356 aa  239  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 
1022 aa  238  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
1352 aa  231  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.05 
 
 
1131 aa  226  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
944 aa  224  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1195 aa  222  3e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  30.04 
 
 
1161 aa  222  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
1141 aa  221  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
1155 aa  220  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
1038 aa  218  4e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 
1003 aa  218  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 
1767 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 
1767 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2080  sensor histidine kinase/response regulator fusion protein  26.92 
 
 
1158 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.264996 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5566  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
1203 aa  215  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0247633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
1142 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 
1767 aa  214  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
1021 aa  213  2e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2642  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1216 aa  213  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.974276  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 
1145 aa  212  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.73 
 
 
1237 aa  212  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.45 
 
 
1765 aa  211  9e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  28.18 
 
 
1200 aa  210  9e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 
1784 aa  210  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 
1201 aa  209  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  29.7 
 
 
1111 aa  209  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.45 
 
 
1763 aa  208  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
1771 aa  207  8e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.59 
 
 
1782 aa  207  8e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 
1326 aa  206  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 
1792 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
1786 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1960  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
1680 aa  206  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.0344276 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
1917 aa  204  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
1143 aa  204  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 
1137 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2712  sensor histidine kinase/response regulator  29.48 
 
 
1170 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340753  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.78 
 
 
1165 aa  203  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
1155 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.02 
 
 
1622 aa  202  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
1548 aa  202  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  28.6 
 
 
1137 aa  202  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
1267 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 
1002 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  27.44 
 
 
1196 aa  201  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
1155 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6441  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1937 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.61 
 
 
815 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3210  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
1936 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.596339  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  28.65 
 
 
1937 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
829 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 
1768 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
701 aa  198  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 
989 aa  198  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2587  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.83 
 
 
1158 aa  197  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  28.55 
 
 
1331 aa  197  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
1937 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.86 
 
 
2099 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1155 aa  195  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
1363 aa  196  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  28.8 
 
 
1695 aa  194  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
1149 aa  194  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
905 aa  194  9e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.21 
 
 
718 aa  193  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
1163 aa  193  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1977 aa  193  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.68 
 
 
937 aa  192  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  30.7 
 
 
977 aa  193  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
1165 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2445  response regulator receiver  28.7 
 
 
1172 aa  191  8e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00053345 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
2099 aa  191  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.56 
 
 
923 aa  190  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 
770 aa  190  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>