143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1481 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1481  restriction endonuclease S subunits-like protein  100 
 
 		 443 aa  918    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3940  restriction modification system DNA specificity domain protein  59.11 
 
 		 453 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0076  type I restriction-modification system subunit S  32.49 
 
 		 464 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3989  restriction modification system DNA specificity domain protein  34.97 
 
 		 456 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0737122 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0233  restriction modification system DNA specificity subunit  33.69 
 
 		 461 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0967889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1153  restriction modification system DNA specificity subunit  33.99 
 
 		 429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.487263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0414  restriction modification system DNA specificity subunit  32.37 
 
 		 439 aa  210  5e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.405933  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0416  type I restriction-modification system S subunit  33.9 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0531711 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0599  type I restriction-modification system, S subunit  33.77 
 
 		 458 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2869  type I restriction-modification system, S subunit  31.52 
 
 		 448 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0947716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2607  restriction modification system DNA specificity subunit  33.97 
 
 		 462 aa  194  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2688  restriction endonuclease S subunits-like  33.2 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.165356  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1064  type I restriction-modification  32.1 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000898872  normal  0.027841 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4252  restriction modification system DNA specificity domain protein  30.67 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1015  hypothetical protein  32.9 
 
 		 477 aa  182  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0487  restriction modification system DNA specificity subunit  32.08 
 
 		 438 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.700794  normal  0.0187002 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1858  restriction modification system DNA specificity subunit  29.87 
 
 		 456 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1327  restriction modification system DNA specificity subunit  38.93 
 
 		 431 aa  168  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.280518 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2939  type I restriction-modification system  30.3 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0304782 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0750  putative type I restriction-modification system  29.87 
 
 		 436 aa  156  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.769779  normal  0.272821 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0796  restriction modification system DNA specificity domain  28.76 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2606  restriction modification system DNA specificity subunit  30.4 
 
 		 429 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1860  type I restriction enzyme, S subunit  27.03 
 
 		 474 aa  150  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0504746  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6260  restriction modification system DNA specificity domain protein  29.23 
 
 		 441 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4761  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  32.71 
 
 		 428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4472  restriction modification system DNA specificity subunit  29.46 
 
 		 415 aa  145  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.270866  normal  0.0902542 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0277  restriction modification system DNA specificity subunit  29.18 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1366  hypothetical protein  27.31 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3075  restriction modification system DNA specificity domain protein  35.29 
 
 		 388 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.40504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1783  restriction modification system DNA specificity subunit  28.28 
 
 		 448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.311566 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3443  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.87 
 
 		 445 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003235  type I restriction-modification system specificity subunit S  29.53 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2200  type I restriction-modification system specificity subunit  24.89 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.844306  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19070  hypothetical protein  26.41 
 
 		 425 aa  127  5e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0871344 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0640  restriction modification system DNA specificity subunit  27.27 
 
 		 447 aa  126  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0777  type I restriction modification DNA specificity domain-containing protein  25.95 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00318537  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0277  hypothetical protein  26.13 
 
 		 474 aa  124  5e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2682  putative restriction endonuclease S subunit  28.47 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.845062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3571  hypothetical protein  27.73 
 
 		 458 aa  123  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2226  restriction modification system DNA specificity subunit  26.45 
 
 		 451 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3358  restriction modification system DNA specificity subunit  25.29 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0521612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1221  restriction modification system DNA specificity subunit  26.27 
 
 		 463 aa  117  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0264  restriction modification system DNA specificity subunit  23.8 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1791  restriction modification system DNA specificity subunit  30.55 
 
 		 419 aa  111  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.365715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1516  restriction modification system DNA specificity subunit  25.17 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.205219 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3673  restriction modification system DNA specificity subunit  27.03 
 
 		 410 aa  110  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1496  restriction modification system DNA specificity domain protein  26.37 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.136919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2698  restriction modification system DNA specificity subunit  29.57 
 
 		 267 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0854775  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0193  type I restriction-modification system specificity determinant  23.29 
 
 		 416 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.311495 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2268  putative type I restriction enzyme, S subunit  25.67 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3953  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.87 
 
 		 413 aa  94.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2176  restriction modification system DNA specificity subunit  23.71 
 
 		 444 aa  94.4  3e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.962317  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3793  restriction modification system DNA specificity subunit  28.57 
 
 		 425 aa  94.4  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0347  type I restriction-modification system, S subunit  28.48 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000269296  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0959  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.43 
 
 		 442 aa  93.6  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0501  restriction modification system DNA specificity subunit  28.79 
 
 		 612 aa  93.6  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.435558 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0658  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.89 
 
 		 473 aa  92.4  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1366  putative type I site-specific restriction-modification system, S subunit  22.92 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0493853  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0895  N-6 DNA methylase  29.63 
 
 		 834 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0842  hypothetical protein  23.98 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.229597  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0382  type I restriction-modification system, S subunit  23.56 
 
 		 439 aa  87  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1635  restriction modification system DNA specificity domain protein  23.11 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0235263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3569  restriction modification system DNA specificity domain  22.6 
 
 		 395 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3272  type I restriction-modification system specificity subunit  25 
 
 		 492 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.425878  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0835  restriction modification system DNA specificity domain  28.92 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.835919  normal  0.945638 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0686  type I restriction-modification system, S subunit, putative  28.92 
 
 		 561 aa  83.2  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.840975  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1551  type I restriction enzyme  25.17 
 
 		 439 aa  82.4  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02063  type I restriction-modification system, S subunit  23.06 
 
 		 501 aa  81.6  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2028  restriction modification system DNA specificity subunit  27.66 
 
 		 391 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000400239 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4455  restriction modification system DNA specificity subunit  23.61 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.353509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0355  restriction modification system DNA specificity subunit  26.03 
 
 		 590 aa  77.4  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2364  restriction modification system DNA specificity subunit  25.8 
 
 		 413 aa  77  0.0000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.188022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2960  restriction modification system DNA specificity subunit  24.1 
 
 		 587 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3199  restriction modification system DNA specificity subunit  22.51 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0845  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.75 
 
 		 495 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.31571e-19 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04450  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.69 
 
 		 422 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2257  restriction endonuclease S subunits-like protein  21.94 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1357  restriction modification system DNA specificity domain  27.55 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0971497  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1032  restriction modification system DNA specificity subunit  22.55 
 
 		 457 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41908  normal  0.322454 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1061  putative type I restriction-modification system, S subunit  25.94 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3525  restriction modification system DNA specificity subunit  26.28 
 
 		 420 aa  64.3  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0727  restriction modification system DNA specificity domain protein  27.91 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0968972 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0102  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.19 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1674  restriction modification system DNA specificity domain protein  22.1 
 
 		 477 aa  63.5  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3471  restriction modification system DNA specificity domain protein  21.41 
 
 		 419 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4917  restriction modification system DNA specificity subunit  22.06 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.143388  normal  0.544675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2508  restriction modification system DNA specificity domain-containing protein  24.37 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39699  normal  0.700746 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1941  restriction endonuclease S subunits-like  23.08 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0182546  normal  0.0682578 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1071  restriction modification system DNA specificity subunit  21.53 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13680  hypothetical protein  21.62 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.247083  normal  0.424884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04178  hypothetical protein  25.14 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.695524  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0504  restriction modification system DNA specificity domain protein  24.3 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2214  restriction modification system DNA specificity domain protein  25.23 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05614  type I restriction-modification system S subunit  24.02 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0605  restriction modification system DNA specificity subunit  23.85 
 
 		 453 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1643  restriction modification system DNA specificity domain protein  31.08 
 
 		 428 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1132  restriction modification system DNA specificity subunit  25.26 
 
 		 556 aa  54.7  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.817215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7555  Restriction endonuclease S subunits-like protein  19.13 
 
 		 402 aa  54.3  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2904  restriction modification system DNA specificity subunit  22.29 
 
 		 425 aa  53.5  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0030  restriction modification system DNA specificity subunit  30.83 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.539395  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>