More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1934 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  46.97 
 
 		 804 aa  685    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  46.75 
 
 		 847 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  45.52 
 
 		 885 aa  673    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  50.26 
 
 		 816 aa  747    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  44.7 
 
 		 883 aa  651    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 813 aa  1651    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  47.57 
 
 		 842 aa  717    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  43.26 
 
 		 818 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  42.8 
 
 		 884 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  35.5 
 
 		 821 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  35.38 
 
 		 815 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  34.09 
 
 		 800 aa  378  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  33.54 
 
 		 811 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  32.79 
 
 		 858 aa  371  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  33.73 
 
 		 800 aa  372  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  34.21 
 
 		 795 aa  365  2e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  33 
 
 		 843 aa  365  3e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  33.25 
 
 		 784 aa  353  7e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 873 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  32.39 
 
 		 835 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  31.82 
 
 		 788 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  32.08 
 
 		 788 aa  338  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 793 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  32.63 
 
 		 795 aa  337  5.999999999999999e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 933 aa  335  2e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  31.29 
 
 		 793 aa  333  9e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  31.63 
 
 		 803 aa  331  4e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.13 
 
 		 799 aa  320  5e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 		 842 aa  317  5e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.59 
 
 		 832 aa  317  6e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 815 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 812 aa  310  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 812 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  30.98 
 
 		 812 aa  309  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  30.65 
 
 		 961 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  30.07 
 
 		 852 aa  305  2.0000000000000002e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  30.97 
 
 		 803 aa  304  5.000000000000001e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  30.58 
 
 		 840 aa  303  9e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 		 797 aa  300  7e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 797 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 		 797 aa  299  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  30.57 
 
 		 817 aa  299  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  30.99 
 
 		 797 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 849 aa  296  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  31.16 
 
 		 811 aa  294  5e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.23 
 
 		 811 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  29.56 
 
 		 853 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 795 aa  283  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  29.75 
 
 		 823 aa  276  1.0000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 850 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 800 aa  267  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  28.08 
 
 		 871 aa  267  5.999999999999999e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.08 
 
 		 833 aa  267  8e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  29.24 
 
 		 797 aa  265  2e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 918 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 847 aa  264  6e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  27.98 
 
 		 879 aa  263  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  30.35 
 
 		 848 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  28.73 
 
 		 947 aa  254  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  28.74 
 
 		 857 aa  248  3e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  29.12 
 
 		 851 aa  247  6e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  28.47 
 
 		 867 aa  247  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  28.86 
 
 		 858 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  27.04 
 
 		 868 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  27.03 
 
 		 924 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  29.16 
 
 		 861 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 867 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 867 aa  239  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  28.04 
 
 		 870 aa  238  4e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 872 aa  237  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 887 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 874 aa  236  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 987 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  26.68 
 
 		 864 aa  224  4e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  26.59 
 
 		 853 aa  219  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  26.38 
 
 		 870 aa  220  1e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 948 aa  219  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 		 924 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 869 aa  212  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 817 aa  208  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0837  TonB-dependent receptor  24.74 
 
 		 855 aa  155  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.111272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  24.7 
 
 		 847 aa  152  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  26.35 
 
 		 856 aa  144  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 843 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2298  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 874 aa  138  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.867047  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  36.23 
 
 		 877 aa  138  4e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  25.62 
 
 		 853 aa  134  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 904 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 853 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  32.2 
 
 		 1015 aa  130  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  24.26 
 
 		 904 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  24.72 
 
 		 817 aa  129  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  25.09 
 
 		 869 aa  129  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  23.61 
 
 		 904 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 904 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2045  TonB-dependent receptor plug  24.91 
 
 		 853 aa  125  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0699598  hitchhiker  0.00000000333969 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2302  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 853 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.780014  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2418  TonB-dependent receptor plug  24.79 
 
 		 853 aa  124  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0641681  hitchhiker  0.00118555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2355  TonB-dependent receptor  26.35 
 
 		 897 aa  122  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  24.76 
 
 		 838 aa  119  3e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>