More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0770 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0770  DNA polymerase III, delta subunit  100 
 
 		 329 aa  663    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0755  DNA polymerase III, delta subunit  98.78 
 
 		 329 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00516911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3132  DNA polymerase III, delta subunit  66.67 
 
 		 331 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000219361  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2298  DNA polymerase III, delta subunit  58.36 
 
 		 334 aa  412  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0132973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2207  DNA polymerase III, delta subunit, putative  56.97 
 
 		 337 aa  404  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2110  DNA polymerase III, delta subunit  47.71 
 
 		 336 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1733  DNA polymerase III, delta subunit  47.71 
 
 		 338 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1415  DNA polymerase III, delta subunit  38.46 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.31648e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2086  DNA polymerase III, delta subunit  33.33 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.11707  normal  0.37357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0576  DNA polymerase III, delta subunit  34.29 
 
 		 330 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12890  DNA polymerase III, delta subunit  32.06 
 
 		 337 aa  162  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  6.02263e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1004  DNA polymerase III subunit delta  30.7 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2506  DNA polymerase III, delta subunit  32.29 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2328  DNA polymerase III, delta subunit  34.16 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101165  normal  0.188166 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2068  DNA polymerase III, delta subunit  32.05 
 
 		 335 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4174  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0277234  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2973  DNA polymerase III, delta subunit  32.39 
 
 		 324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000221359 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0794  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  146  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.307001  hitchhiker  0.0000000000929908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4442  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000347151  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3265  DNA polymerase III, delta subunit  28.41 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4456  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000585392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4404  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4070  DNA polymerase III subunit delta  29.73 
 
 		 336 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.091796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4222  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00283981  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4345  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000369985 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4548  DNA polymerase III subunit delta  29.79 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3050  DNA polymerase III subunit delta  29.18 
 
 		 336 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.132953  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4060  DNA polymerase III subunit delta  29.48 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1962  DNA polymerase III, delta subunit  30.98 
 
 		 325 aa  140  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1175  DNA polymerase III, delta subunit  31.71 
 
 		 334 aa  140  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.261121  hitchhiker  0.00030796 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3192  DNA polymerase III, delta subunit  30.19 
 
 		 354 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000207223  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2629  DNA polymerase III, delta subunit  27.36 
 
 		 350 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000921184  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3075  DNA polymerase III, delta subunit  29.97 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000036033  hitchhiker  0.00284668 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2091  DNA polymerase III, delta subunit  28.82 
 
 		 338 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000184511  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1537  hypothetical protein  27.36 
 
 		 344 aa  132  6e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.466776  normal  0.951584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6524  DNA polymerase III, delta subunit  29.29 
 
 		 331 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164301 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2918  DNA polymerase III, delta subunit  27.21 
 
 		 334 aa  128  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2447  DNA polymerase III subunit delta  26.56 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000860217  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0043  DNA polymerase III, delta subunit  25.55 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0736782  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4260  DNA polymerase III, delta subunit  31.53 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1251  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 341 aa  125  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1937  DNA polymerase III, delta subunit  28.94 
 
 		 344 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.156014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1040  DNA polymerase III, delta subunit  27.95 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000902231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1065  DNA polymerase III, delta subunit  29.26 
 
 		 339 aa  123  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.251286 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11278  hypothetical protein  29.19 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1954  DNA polymerase III, delta subunit  25.16 
 
 		 339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1577  DNA polymerase III, delta subunit  31.41 
 
 		 336 aa  116  6e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.475992  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0965  DNA polymerase III, delta subunit  28.61 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0901856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4316  DNA polymerase III, delta subunit  25.8 
 
 		 332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00186458  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1588  DNA polymerase III delta subunit-like protein  25.62 
 
 		 325 aa  114  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0554592  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1105  DNA polymerase III, delta subunit  23.49 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00460832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10260  DNA polymerase III, delta subunit  27.59 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00535946  hitchhiker  0.0000000366409 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0203  DNA polymerase III, delta subunit  25.23 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1518  DNA polymerase III, delta subunit  30.53 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.215  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0946  DNA polymerase III, delta subunit  27.66 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1644  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.240012  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1679  DNA polymerase III subunit delta  24.68 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00348184  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0803  DNA polymerase III, delta subunit  25.94 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.549808  normal  0.681105 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1447  hypothetical protein  22.43 
 
 		 341 aa  99.8  5e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1188  DNA polymerase III delta  32.99 
 
 		 481 aa  99.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0460  DNA polymerase III, delta subunit  23.05 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1587  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 333 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2201  DNA polymerase III, delta subunit  24.92 
 
 		 348 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.638698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1965  DNA polymerase III, delta subunit  26.91 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1655  DNA polymerase III, delta subunit  26.92 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.61853  hitchhiker  0.00217926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1154  DNA polymerase III subunit delta  22.64 
 
 		 324 aa  94  3e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.740114  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2356  DNA polymerase III, delta subunit  26.04 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2577  DNA polymerase III, delta subunit  27.22 
 
 		 346 aa  94  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12200  DNA polymerase III subunit delta  30.65 
 
 		 345 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.754313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2304  DNA polymerase III, delta subunit  25.38 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.477598  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2643  DNA polymerase III delta  30.9 
 
 		 465 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.640938  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1920  DNA polymerase III, delta subunit  22.6 
 
 		 335 aa  93.2  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07750  DNA polymerase III, delta subunit  26.81 
 
 		 330 aa  93.2  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.648586 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4959  DNA polymerase III subunit delta  30.15 
 
 		 345 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2547  DNA polymerase III delta  30.9 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0981779  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1313  DNA polymerase III, delta  30.9 
 
 		 465 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3591  DNA polymerase III, delta subunit  24.28 
 
 		 328 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.490351  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3379  DNA polymerase III, delta subunit  27.04 
 
 		 346 aa  90.5  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.126679  normal  0.707778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3459  DNA polymerase III subunit delta  25.97 
 
 		 324 aa  89.4  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12630  hypothetical protein  28.35 
 
 		 326 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.793346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4849  DNA polymerase III subunit delta  29.39 
 
 		 351 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1119  DNA polymerase III subunit delta  29.5 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.774232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2450  DNA polymerase III delta  28.57 
 
 		 458 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.163011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2150  DNA polymerase III, delta subunit  24.7 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.51372  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4671  DNA polymerase III subunit delta  29.01 
 
 		 345 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4796  DNA polymerase III subunit delta  29.01 
 
 		 345 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.306681 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1185  DNA polymerase III, delta subunit  22.56 
 
 		 337 aa  84.3  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0405  DNA polymerase III subunit delta  27.69 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4684  DNA polymerase III subunit delta  25.22 
 
 		 328 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4814  DNA polymerase III, delta subunit  29.35 
 
 		 345 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.664461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3467  DNA polymerase III, delta subunit  28.48 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.83441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3788  DNA polymerase III subunit delta  29.43 
 
 		 342 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.350473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0224  DNA polymerase III, delta subunit  22.96 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0646  DNA polymerase III, delta subunit  27.45 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000921148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4354  DNA polymerase III subunit delta  29.35 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0044  DNA polymerase III, delta subunit  25.15 
 
 		 342 aa  82.8  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000438472  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_47  DNA polymerase III, delta subunit  26.07 
 
 		 419 aa  82  0.00000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000202582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1551  DNA polymerase III, delta subunit  27.98 
 
 		 329 aa  82  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.166595  normal  0.216039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4181  DNA polymerase III subunit delta  24.02 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4220  DNA polymerase III subunit delta  24.02 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>