280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4186 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 963 aa  1884    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.9 
 
 		 911 aa  418  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  32.6 
 
 		 1056 aa  360  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  32.54 
 
 		 785 aa  356  1e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  35.14 
 
 		 934 aa  352  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  34.46 
 
 		 859 aa  340  5e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  33.44 
 
 		 900 aa  339  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.39 
 
 		 829 aa  332  2e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  34.52 
 
 		 897 aa  325  3e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6918  putative ATP/GTP-binding protein  33.02 
 
 		 845 aa  322  1.9999999999999998e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  33.61 
 
 		 992 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  32.34 
 
 		 1068 aa  321  3.9999999999999996e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7957  Tetratricopeptide TPR_4  30.11 
 
 		 1324 aa  310  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0918027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  29.94 
 
 		 1309 aa  293  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5728  tetratricopeptide TPR_4  30.48 
 
 		 849 aa  287  8e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  29.17 
 
 		 1039 aa  287  9e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0515  putative ATP/GTP-binding protein  30.45 
 
 		 1314 aa  274  5.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.388399 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  33.25 
 
 		 1000 aa  271  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1603  NB-ARC domain protein  30.96 
 
 		 843 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0482408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6956  NB-ARC domain-containing protein  28.78 
 
 		 1500 aa  263  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.270488 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1600  hypothetical protein  28.89 
 
 		 1383 aa  263  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.726146  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  30.01 
 
 		 1050 aa  262  2e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  32.07 
 
 		 1105 aa  257  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 		 899 aa  256  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  29.27 
 
 		 1288 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  29.53 
 
 		 1262 aa  253  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4762  putative ATP/GTP binding protein  33.18 
 
 		 675 aa  252  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2553  putative ATP/GTP-binding protein  29.67 
 
 		 838 aa  247  6.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000100802  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  28.55 
 
 		 1185 aa  246  1.9999999999999999e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  31.82 
 
 		 801 aa  243  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  29.05 
 
 		 1131 aa  242  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  28.7 
 
 		 1128 aa  230  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 924 aa  227  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  28.59 
 
 		 1125 aa  217  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2650  tetratricopeptide TPR_4  27.47 
 
 		 1311 aa  213  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0589865  normal  0.0118034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0403  hypothetical protein  27.85 
 
 		 1523 aa  208  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0434  putative ATP/GTP binding protein  32.55 
 
 		 713 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342423 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  40.06 
 
 		 454 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1010 aa  201  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  25.72 
 
 		 1146 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.57 
 
 		 1186 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4516  NB-ARC domain protein  27.74 
 
 		 1509 aa  197  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.247222 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.89 
 
 		 767 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  38.59 
 
 		 1488 aa  192  2e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  36.47 
 
 		 385 aa  188  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1088 aa  185  4.0000000000000006e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 1283 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  37.54 
 
 		 1328 aa  181  4.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  41.45 
 
 		 837 aa  180  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 953 aa  180  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.23 
 
 		 1424 aa  178  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.39 
 
 		 991 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  35.67 
 
 		 568 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.67 
 
 		 568 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  28.35 
 
 		 1136 aa  175  5e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  36.89 
 
 		 1215 aa  169  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  33.56 
 
 		 828 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  27.83 
 
 		 672 aa  162  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  43.03 
 
 		 284 aa  159  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 857 aa  157  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4606  NB-ARC domain protein  26.08 
 
 		 1261 aa  156  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.350947  normal  0.437049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  37.13 
 
 		 444 aa  154  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  30.13 
 
 		 814 aa  150  7e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.16 
 
 		 771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4641  hypothetical protein  33.68 
 
 		 457 aa  145  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1796  putative ATP/GTP binding protein  28.04 
 
 		 847 aa  145  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0346132  normal  0.567176 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.42 
 
 		 787 aa  145  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 751 aa  143  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  31.43 
 
 		 1040 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 949 aa  140  8.999999999999999e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  32.61 
 
 		 825 aa  140  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  35.07 
 
 		 919 aa  140  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 843 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.17 
 
 		 885 aa  138  4e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  32.26 
 
 		 1507 aa  136  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  29.88 
 
 		 776 aa  135  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1550 aa  135  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  26.59 
 
 		 680 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  47.4 
 
 		 358 aa  128  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  40.94 
 
 		 850 aa  127  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6844  Tetratricopeptide TPR_4  26.26 
 
 		 1468 aa  125  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0351351  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  24.62 
 
 		 577 aa  124  9e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  33.22 
 
 		 362 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  24.53 
 
 		 793 aa  123  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  22.59 
 
 		 1212 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  26.62 
 
 		 2145 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  20.29 
 
 		 1404 aa  123  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  42.57 
 
 		 304 aa  122  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2454  tetratricopeptide TPR_4  28.68 
 
 		 686 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.928825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  50 
 
 		 540 aa  121  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  31.17 
 
 		 725 aa  120  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1513  tetratricopeptide TPR_4  26.67 
 
 		 1326 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  29.82 
 
 		 373 aa  119  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  44.79 
 
 		 705 aa  118  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  31.49 
 
 		 1290 aa  118  6.9999999999999995e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 640 aa  114  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  29.07 
 
 		 822 aa  114  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  25.03 
 
 		 1228 aa  113  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  25.68 
 
 		 977 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  32.2 
 
 		 311 aa  112  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>