More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3475 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1253  DNA ligase, NAD-dependent  47.35 
 
 		 669 aa  649    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3318  DNA ligase, NAD-dependent  55.04 
 
 		 670 aa  759    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.563923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5111  DNA ligase, NAD-dependent  50.29 
 
 		 695 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246917  normal  0.382765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2539  DNA ligase, NAD-dependent  47.98 
 
 		 696 aa  673    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173328 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09423  DNA ligase  69.73 
 
 		 664 aa  962    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.624424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1313  DNA ligase  53.63 
 
 		 670 aa  744    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.269353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3475  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 668 aa  1376    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.502596  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1559  DNA ligase, NAD-dependent  68.24 
 
 		 662 aa  953    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0638727  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1926  hypothetical protein  46.14 
 
 		 671 aa  611  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  45.62 
 
 		 678 aa  608  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  45.4 
 
 		 674 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  45.48 
 
 		 670 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.78 
 
 		 676 aa  570  1e-161  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  44.94 
 
 		 674 aa  568  1e-160  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  43.92 
 
 		 672 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  44.58 
 
 		 681 aa  560  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  43.57 
 
 		 673 aa  561  1e-158  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.96 
 
 		 669 aa  556  1e-157  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.79 
 
 		 670 aa  556  1e-157  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  43.11 
 
 		 665 aa  552  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.76 
 
 		 669 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2698  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.24 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000106098  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.56 
 
 		 671 aa  552  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  42.14 
 
 		 678 aa  554  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02311  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.09 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000571235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  42.24 
 
 		 671 aa  551  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  43.05 
 
 		 683 aa  548  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.09 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.76 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.61 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.61 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.61 
 
 		 669 aa  550  1e-155  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0757  DNA ligase, NAD-dependent  41.14 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  42.03 
 
 		 667 aa  551  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.61 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02272  hypothetical protein  42.09 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000450383  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0903  DNA ligase, NAD-dependent  41.14 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.226398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.09 
 
 		 671 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.61 
 
 		 669 aa  551  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1267  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.24 
 
 		 671 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000309607  decreased coverage  0.0000372126 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  43.85 
 
 		 670 aa  551  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.16 
 
 		 669 aa  548  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.31 
 
 		 669 aa  548  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  44.02 
 
 		 662 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  42.86 
 
 		 671 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.84 
 
 		 679 aa  545  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0427  DNA ligase, NAD-dependent  43.78 
 
 		 675 aa  545  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  43.03 
 
 		 668 aa  545  1e-154  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  41.65 
 
 		 711 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.64 
 
 		 670 aa  542  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0571  DNA ligase, NAD-dependent  41.25 
 
 		 680 aa  544  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135698  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2571  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.85 
 
 		 671 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000161057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1239  DNA ligase, NAD-dependent  41.1 
 
 		 672 aa  545  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00267622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2662  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.85 
 
 		 671 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0516763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2620  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.85 
 
 		 671 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.936148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  43.16 
 
 		 669 aa  545  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2316  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.21 
 
 		 774 aa  543  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.444372  normal  0.080689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  42.18 
 
 		 675 aa  544  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2792  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.85 
 
 		 671 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.755122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2686  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.85 
 
 		 671 aa  545  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.595672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  41.53 
 
 		 673 aa  545  1e-153  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0463  DNA ligase, NAD-dependent  42.58 
 
 		 684 aa  544  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  42.05 
 
 		 670 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3950  DNA ligase, NAD-dependent  42.11 
 
 		 684 aa  540  9.999999999999999e-153  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0987  DNA ligase  41.04 
 
 		 673 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0894  DNA ligase, NAD-dependent  42.18 
 
 		 700 aa  541  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0377  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.86 
 
 		 673 aa  541  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  39.91 
 
 		 673 aa  540  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0655  DNA ligase, NAD-dependent  41.53 
 
 		 670 aa  541  9.999999999999999e-153  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2744  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.75 
 
 		 670 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000148607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0475  DNA ligase, NAD-dependent  41.63 
 
 		 676 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2016  DNA ligase, NAD-dependent  42.73 
 
 		 673 aa  536  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1020  DNA ligase  40.96 
 
 		 673 aa  538  1e-151  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1321  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.75 
 
 		 670 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000153003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1432  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.75 
 
 		 670 aa  538  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000269504  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  42.28 
 
 		 668 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2939  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.83 
 
 		 671 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000192646  normal  0.0623801 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  41.17 
 
 		 667 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  41.17 
 
 		 667 aa  535  1e-151  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  42.45 
 
 		 663 aa  537  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004153  DNA ligase  41.13 
 
 		 690 aa  532  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0596  DNA ligase, NAD-dependent  41.46 
 
 		 677 aa  535  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18071  NAD-dependent DNA ligase LigA  42.01 
 
 		 697 aa  535  1e-150  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.113319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0676  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.59 
 
 		 738 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.759983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  41.77 
 
 		 671 aa  533  1e-150  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  41.39 
 
 		 690 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  41.22 
 
 		 690 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0492  NAD-dependent DNA ligase LigA  40.78 
 
 		 669 aa  535  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000242454  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  42.45 
 
 		 662 aa  531  1e-149  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0483  DNA ligase, NAD-dependent  42.03 
 
 		 674 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2353  NAD-dependent DNA ligase LigA  39.73 
 
 		 669 aa  530  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1878  DNA ligase, NAD-dependent  38.7 
 
 		 711 aa  530  1e-149  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_536  DNA ligase, NAD-dependent  41.12 
 
 		 680 aa  530  1e-149  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3444  NAD-dependent DNA ligase LigA  41.22 
 
 		 673 aa  530  1e-149  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000441921  hitchhiker  0.000209829 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  41.2 
 
 		 721 aa  529  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  41.17 
 
 		 671 aa  531  1e-149  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  42.43 
 
 		 672 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  41.21 
 
 		 659 aa  531  1e-149  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  42.11 
 
 		 677 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  41.28 
 
 		 691 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>