More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0383 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  100 
 
 
168 aa  351  2.9999999999999997e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  49.35 
 
 
165 aa  125  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.77 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  78.87 
 
 
163 aa  115  3e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.01 
 
 
169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.59 
 
 
175 aa  107  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  47.52 
 
 
147 aa  107  5e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.24 
 
 
158 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  41.1 
 
 
155 aa  107  8.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.59 
 
 
170 aa  105  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.2 
 
 
151 aa  105  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.44 
 
 
163 aa  104  7e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  71.23 
 
 
165 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  55.45 
 
 
163 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.98 
 
 
155 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.95 
 
 
156 aa  102  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  49.6 
 
 
172 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  44.52 
 
 
156 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.14 
 
 
163 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.18 
 
 
154 aa  99.8  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  42.76 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.86 
 
 
151 aa  99.4  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.57 
 
 
169 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.87 
 
 
161 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  59.55 
 
 
171 aa  99  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.59 
 
 
167 aa  98.6  4e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  42.96 
 
 
136 aa  97.4  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.38 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  66.22 
 
 
79 aa  94  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.89 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.72 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  40.12 
 
 
168 aa  91.3  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.01 
 
 
167 aa  90.9  7e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  43.42 
 
 
164 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.33 
 
 
193 aa  88.6  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.38 
 
 
179 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.81 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.15 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  36.75 
 
 
174 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.67 
 
 
171 aa  87  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  61.43 
 
 
182 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  48.54 
 
 
158 aa  85.5  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  41.91 
 
 
172 aa  85.1  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  47.27 
 
 
171 aa  83.6  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  39.51 
 
 
155 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.67 
 
 
175 aa  81.3  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  66.1 
 
 
174 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.22 
 
 
167 aa  80.5  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.93 
 
 
172 aa  79.3  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  41.46 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  48.86 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  40.3 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  33.53 
 
 
174 aa  74.3  0.0000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  57.14 
 
 
169 aa  73.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  51.85 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  50.65 
 
 
165 aa  70.9  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  46.15 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  85 
 
 
48 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.33 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  50.67 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  50.67 
 
 
176 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  43.52 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  49.3 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  32.85 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  73.33 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  57.38 
 
 
634 aa  65.1  0.0000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  55.74 
 
 
567 aa  65.1  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.62 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  54.84 
 
 
527 aa  64.3  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  48 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  48 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  54.84 
 
 
548 aa  63.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  30.36 
 
 
141 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0345  general secretion pathway protein H  45.83 
 
 
176 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177644  normal  0.0749297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  38.37 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1300  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07011  hypothetical protein  43.06 
 
 
208 aa  61.2  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.212398  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0253  general secretion pathway protein G  45.33 
 
 
150 aa  61.2  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2997  type II secretion system protein G  42.11 
 
 
135 aa  61.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000413298 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  31.16 
 
 
152 aa  61.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02979  putative general secretion pathway GSPG related transmembrane protein  42.25 
 
 
129 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.811632  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2612  general secretion pathway protein G  46.38 
 
 
153 aa  61.2  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.688921 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  46.77 
 
 
160 aa  61.2  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1199  hypothetical protein  41.56 
 
 
221 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.789092  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0592  general secretion pathway protein G  35.42 
 
 
147 aa  60.8  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  43.59 
 
 
140 aa  60.5  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  31.76 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  37.33 
 
 
164 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2564  hypothetical protein  37.08 
 
 
177 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569226 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  46.15 
 
 
141 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02835  hypothetical type II secretion protein GspG  38.64 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000370073  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3409  general secretion pathway protein GspG  38.64 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0936  general secretion pathway protein  33.66 
 
 
155 aa  58.9  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02785  hypothetical protein  38.64 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000404727  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3179  general secretion pathway protein G  37.08 
 
 
152 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.223664  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3135  general secretion pathway protein G  38.64 
 
 
151 aa  58.9  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  38.3 
 
 
141 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0605  general secretion pathway protein G  34.38 
 
 
147 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000021872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>