More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0508 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0508  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 421 aa  858    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000506303  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0828  extracellular solute-binding protein  69.67 
 
 		 424 aa  624  1e-178  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.142269  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4136  extracellular solute-binding protein  55.07 
 
 		 424 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.518326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0972  extracellular solute-binding protein family 1  50 
 
 		 421 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0736  extracellular solute-binding protein family 1  50.24 
 
 		 421 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0531  extracellular solute-binding protein family 1  45.35 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3590  extracellular solute-binding protein  39.04 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0917  extracellular solute-binding protein family 1  37.72 
 
 		 455 aa  279  8e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.728334  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  30.5 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  30.77 
 
 		 430 aa  179  8e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  30.71 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  28.61 
 
 		 442 aa  160  4e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 446 aa  143  7e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6524  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.514278  normal  0.451088 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6112  extracellular solute-binding protein family 1  28.85 
 
 		 424 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.521338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6584  ABC transporter sugar binding protein  27.15 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1064  extracellular solute-binding protein  28.79 
 
 		 480 aa  119  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.075314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0284  extracellular solute-binding protein family 1  26.87 
 
 		 410 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0514987  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2862  extracellular solute-binding protein family 1  24.01 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0921  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  29.09 
 
 		 458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3222  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 457 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.950328  normal  0.818094 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0922  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.06 
 
 		 447 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.755265  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2859  extracellular solute-binding protein  26.12 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.511665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04270  extracellular solute-binding protein family 1  25.98 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.12 
 
 		 453 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0923  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.9 
 
 		 450 aa  100  4e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.293658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1099  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 420 aa  99  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000491601  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0842  extracellular solute-binding protein family 1  27.03 
 
 		 432 aa  98.2  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.516605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4419  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 456 aa  96.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  25.37 
 
 		 434 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0130  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 462 aa  95.5  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0101  extracellular solute-binding protein family 1  25.58 
 
 		 438 aa  92.8  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.494877  normal  0.060225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3566  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0143758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1879  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 452 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11600  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.73 
 
 		 444 aa  91.3  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.558288  normal  0.039331 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2896  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 452 aa  90.1  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1454  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 445 aa  90.1  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  25.87 
 
 		 408 aa  89.7  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1614  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000159886  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1008  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  23.33 
 
 		 449 aa  86.3  9e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2845  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 424 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35811  normal  0.0339661 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1552  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  23.87 
 
 		 405 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  26.03 
 
 		 504 aa  82  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 445 aa  81.6  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1355  extracellular solute-binding protein  24.47 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.120515 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.39 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0411  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 449 aa  80.9  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.439626  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  25.45 
 
 		 424 aa  80.5  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19280  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.57 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.147667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.84 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0877495  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  24.37 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  24.37 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2644  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  28.16 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  27.74 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 424 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  23.03 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2574  extracellular solute-binding protein family 1  24.75 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.316894  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0781  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 395 aa  76.6  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000729506  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  24.15 
 
 		 403 aa  76.6  0.0000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25 
 
 		 444 aa  76.6  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03920  carbohydrate-binding protein  24.4 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7341  sugar ABC transporter sugar-binding protein  24.71 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.9 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0934  putative solute binding lipoprotein  25.98 
 
 		 432 aa  75.1  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.46058  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  23.43 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1506  extracellular solute-binding protein  29.78 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.629333  decreased coverage  0.000020483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  23.91 
 
 		 459 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  22.86 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 		 461 aa  73.6  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3964  extracellular solute-binding protein family 1  24.37 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.340566  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0364  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.47 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4241  extracellular solute-binding protein family 1  26.69 
 
 		 422 aa  72.8  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  22.8 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5330  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489769  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27400  periplasmic mannitol-binding protein of mannitol ABC transporter  22.64 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3304  extracellular solute-binding protein family 1  24.15 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0393  extracellular solute-binding protein  26.37 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0128577 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4325  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  22.68 
 
 		 416 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  22.68 
 
 		 416 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 429 aa  70.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.26 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 424 aa  70.1  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0027  extracellular solute-binding protein  22 
 
 		 413 aa  70.1  0.00000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000000908101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0596  extracellular solute-binding protein  24.35 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00439649  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  25.94 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2348  extracellular solute-binding protein  24.14 
 
 		 363 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.585172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1557  extracellular solute-binding protein  24.28 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.920193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0048  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4812  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0556  extracellular solute-binding protein family 1  24.21 
 
 		 430 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.71623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34420  putative binding protein component of ABC maltose/mannitol transporter  25.92 
 
 		 436 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000870468  normal  0.425479 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>