More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0661 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  100 
 
 		 362 aa  720    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  77.81 
 
 		 362 aa  553  1e-156  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  71.82 
 
 		 344 aa  482  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  67.76 
 
 		 351 aa  457  1e-127  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  43.95 
 
 		 374 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  39.9 
 
 		 387 aa  233  3e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  41.2 
 
 		 400 aa  230  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  40.53 
 
 		 348 aa  227  3e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  42.68 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  40.53 
 
 		 414 aa  222  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  39.79 
 
 		 349 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  40.05 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  38.99 
 
 		 381 aa  210  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  40.49 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  40.76 
 
 		 355 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  37.32 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  36.89 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  36.55 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  39.84 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  35.92 
 
 		 355 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2014  porin  35.71 
 
 		 454 aa  160  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3680  porin  35.95 
 
 		 366 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.218397  normal  0.0162344 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  35.42 
 
 		 355 aa  159  9e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  35.64 
 
 		 375 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  34.25 
 
 		 335 aa  153  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2423  porin  35.9 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0610665 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0713  porin  34.56 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.788227 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  34.66 
 
 		 359 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  33.69 
 
 		 370 aa  139  4.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  36.73 
 
 		 344 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5627  porin  33.76 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0464814  normal  0.0831491 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  31.35 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  34.44 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32.51 
 
 		 376 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32.51 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  35.43 
 
 		 359 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.6 
 
 		 354 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.4 
 
 		 354 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  33 
 
 		 376 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1374  porin  29.97 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  32.66 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  35.67 
 
 		 335 aa  124  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  33.15 
 
 		 340 aa  123  5e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  32.66 
 
 		 350 aa  122  9e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  33.77 
 
 		 342 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.73 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.73 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  31.73 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  32.1 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  31.73 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  32.27 
 
 		 352 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  30.89 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0181  outer membrane protein (porin)  32.92 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  31.73 
 
 		 363 aa  120  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.82 
 
 		 369 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.47 
 
 		 449 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.19 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  33.75 
 
 		 372 aa  119  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.73 
 
 		 357 aa  119  9e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  30.96 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.75 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  32.75 
 
 		 385 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  34.55 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  30.19 
 
 		 356 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  30.41 
 
 		 382 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  31.75 
 
 		 327 aa  116  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  29.89 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.99 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  31.46 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.73 
 
 		 367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  30.92 
 
 		 327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  31.44 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.44 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  30.83 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  33.87 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  33.87 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  30.43 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.79 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  30.43 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  31.13 
 
 		 373 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  28.57 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  32.15 
 
 		 370 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  33.07 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  31.93 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  31.02 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  30.05 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.62 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  31.02 
 
 		 379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  33.33 
 
 		 329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  30.37 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  31.54 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.75 
 
 		 383 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  32.59 
 
 		 384 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  30.89 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  31.6 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  31.19 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.74 
 
 		 392 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  30.69 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  30.69 
 
 		 386 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.43 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>