151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1168 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1168  Flp pilus assembly protein CpaB  100 
 
 		 295 aa  599  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000250468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1492  SAF domain-containing protein  40.67 
 
 		 292 aa  202  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1113  SAF domain-containing protein  42.37 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.376133  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2742  Flp pilus assembly protein CpaB  41.06 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2359  putative pilus assembly protein CpaB  37.29 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.934464  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2548  Flp pilus assembly CpaB  34.9 
 
 		 284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.185177  normal  0.0976482 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0592  Flp pilus assembly protein CpaB  38.52 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.579977  normal  0.0629925 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5320  Flp pilus assembly protein CpaB  35.34 
 
 		 282 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.201965  hitchhiker  0.00316438 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7202  Flp pilus assembly CpaB  34.87 
 
 		 279 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190401  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6373  Flp pilus assembly protein CpaB  34.71 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0863874  normal  0.913106 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5499  Flp pilus assembly CpaB  34.71 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0386531  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6785  Flp pilus assembly CpaB  34.71 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900902  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0656  pilus assembly transmembrane protein  34.22 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.360259 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0792  Flp pilus assembly CpaB  32.94 
 
 		 286 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0325336  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2704  SAF domain-containing protein  32.04 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2643  Flp pilus assembly CpaB  36.44 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.729326  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2361  Flp pilus assembly CpaB  33.48 
 
 		 261 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0549  Flp pilus assembly protein CpaB  38.57 
 
 		 283 aa  126  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6291  Flp pilus assembly CpaB  33.19 
 
 		 281 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0737796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1746  Flp pilus assembly protein CpaB  32.47 
 
 		 272 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2267  pilus assembly protein  38.66 
 
 		 279 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1058  Flp pilus assembly protein CpaB  30.46 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4613  Flp pilus assembly protein CpaB  35.04 
 
 		 269 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.310892 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1311  pilus assembly transmembrane protein  39.58 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3084  putative pilus assembly protein CpaB  39.58 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.208838  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2959  putative pilus assembly protein CpaB  39.58 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5995  Flp pilus assembly protein CpaB  32.77 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0325272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1837  Flp pilus assembly protein CpaB  33.62 
 
 		 289 aa  123  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3203  Flp pilus assembly protein CpaB  30.77 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.200873 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1518  Flp pilus assembly protein CpaB  38.42 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0648  Flp pilus assembly CpaB  39.15 
 
 		 281 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.130635  normal  0.420596 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0800  pilus assembly protein CpaB  32.33 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2828  Flp pilus assembly CpaB  31.76 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2916  Flp pilus assembly protein CpaB  32.16 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3969  SAF domain-containing protein  31.64 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.174798  normal  0.640767 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0799  Flp pilus assembly protein CpaB  32.19 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.761688  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0660  pilus assembly protein CpaB  33.85 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.216985  normal  0.0982675 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002643  flp pilus assembly protein RcpC/CpaB  31.33 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2012  SAF domain-containing protein  30.22 
 
 		 272 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3006  Flp pilus assembly protein CpaB  31.69 
 
 		 309 aa  90.1  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1080  Flp pilus assembly CpaB  28.41 
 
 		 342 aa  89.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7030  putative pilus assembly protein, cpaB  33.85 
 
 		 249 aa  89.7  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.383931  normal  0.799048 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5682  putative pilus assembly protein cpaB  35.08 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1039  Flp pilus assembly protein CpaB  29.17 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.268471  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3519  Flp pilus assembly CpaB  33.33 
 
 		 266 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0392  Flp pilus assembly CpaB  30.48 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.373428  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3712  Flp pilus assembly CpaB  31.68 
 
 		 265 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.241083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2826  Flp pilus assembly protein CpaB  32.44 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5126  SAF domain-containing protein  30.3 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0670857 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0218  component of type IV pilus  32.82 
 
 		 269 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1785  Flp pilus assembly CpaB  32.2 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.634606  normal  0.33721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4187  Flp pilus assembly protein CpaB  30 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2114  SAF domain-containing protein  22.22 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0302  Flp pilus assembly CpaB  31.31 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0998  Flp pilus assembly CpaB  28.7 
 
 		 274 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0394807  normal  0.82555 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3351  SAF domain-containing protein  29.18 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2385  Flp pilus assembly protein CpaB  32.14 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2479  Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 261 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.801269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0609  putative CpaB2 pilus assembly protein  30.04 
 
 		 267 aa  75.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.620793  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2702  Flp pilus assembly protein CpaB  30.43 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.964618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2345  Flp pilus assembly CpaB  26.25 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.358123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0418  Flp pilus assembly CpaB  27.14 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2318  Flp pilus assembly protein CpaB  24.36 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2372  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  28.82 
 
 		 274 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267894  normal  0.976652 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4404  Flp pilus assembly protein CpaB  31.87 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4615  Flp pilus assembly protein CpaB  31.19 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.706062  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4475  Flp pilus assembly protein CpaB  30 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0722  SAF domain-containing protein  32.32 
 
 		 271 aa  73.2  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.268977  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1130  Flp pilus assembly CpaB  28.51 
 
 		 345 aa  72  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0287562  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1515  Flp pilus assembly CpaB  32.11 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.670297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2407  Flp pilus assembly protein CpaB  29.52 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0232  SAF domain-containing protein  26.52 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1130  SAF domain protein  28.29 
 
 		 280 aa  67.4  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4660  Flp pilus assembly CpaB  28.27 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000880779  hitchhiker  0.0033273 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3790  Flp pilus assembly protein CpaB  28.5 
 
 		 271 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.658434 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1728  Flp pilus assembly CpaB  24.4 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1402  CpaB family Flp pilus assembly protein  27.35 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.168447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1442  Flp pilus assembly protein CpaB  25.83 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.257298 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4869  SAF domain-containing protein  27.31 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.778513 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4444  Flp pilus assembly protein CpaB  25.62 
 
 		 331 aa  63.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4194  Flp pilus assembly protein CpaB  31.17 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1040  Flp pilus assembly CpaB  27 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000512138  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1520  Flp pilus assembly CpaB  27 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000592722  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1496  Flp pilus assembly protein CpaB  27 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000496809  hitchhiker  0.000000663837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2020  SAF domain-containing protein  26.44 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2566  Flp pilus assembly protein CpaB  29.95 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1652  Flp pilus assembly protein CpaB  27.59 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.695685  normal  0.658487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2163  Flp pilus assembly protein CpaB-like protein  27.42 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143104 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2692  Flp pilus assembly protein CpaB  24.51 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000594167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0069  SAF domain-containing protein  26.32 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723058 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1733  Flp pilus assembly protein CpaB  25.49 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0619975  hitchhiker  0.0000143429 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1910  putative Flp pilus assembly protein CpaB  26.75 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0558  putative Flp pilus assembly protein CpaB  26.75 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1643  Flp pilus assembly CpaB  25.57 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000168863  normal  0.463494 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1817  Flp pilus assembly protein CpaB  27.95 
 
 		 334 aa  60.1  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.745683  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3996  pilus assembly protein cpaB  32.21 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1657  Flp pilus assembly CpaB  28.17 
 
 		 342 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.255393  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2799  putative signal peptide protein, CpaB like  27.62 
 
 		 316 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.379155 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0245  SAF domain-containing protein  30.88 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5408  Flp pilus assembly CpaB  27.14 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>