246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1186 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1186  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1197 aa  2425    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  30.02 
 
 		 799 aa  162  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.75 
 
 		 810 aa  139  4e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 878 aa  138  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 909 aa  137  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  27.48 
 
 		 816 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  26.63 
 
 		 1914 aa  125  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 847 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  23.99 
 
 		 1507 aa  115  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.98 
 
 		 725 aa  105  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.28 
 
 		 1022 aa  105  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  23.43 
 
 		 732 aa  104  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.5 
 
 		 681 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  25.69 
 
 		 685 aa  103  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  27.81 
 
 		 1044 aa  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.64 
 
 		 1056 aa  102  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.49 
 
 		 632 aa  98.2  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.86 
 
 		 795 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 3145 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 3172 aa  96.7  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.58 
 
 		 1056 aa  95.1  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1714 aa  94.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  19.82 
 
 		 1213 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  20.08 
 
 		 2145 aa  93.6  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  26.96 
 
 		 782 aa  92.4  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  23.98 
 
 		 1288 aa  90.5  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  18.71 
 
 		 1676 aa  89.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 750 aa  90.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  28.63 
 
 		 573 aa  88.6  7e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 739 aa  88.2  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  26.1 
 
 		 637 aa  88.2  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 612 aa  87.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.22 
 
 		 988 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  27.71 
 
 		 714 aa  87  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 714 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 1737 aa  81.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 448 aa  81.3  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.62 
 
 		 689 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 789 aa  80.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.8 
 
 		 645 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 1215 aa  78.2  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  23.12 
 
 		 865 aa  77.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  21.94 
 
 		 887 aa  77.4  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.05 
 
 		 647 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 911 aa  76.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  29.18 
 
 		 703 aa  75.5  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  26.53 
 
 		 1328 aa  75.1  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  24.23 
 
 		 362 aa  74.7  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  26.32 
 
 		 626 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0025  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 842 aa  74.3  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000698246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 614 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 444 aa  74.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 968 aa  73.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  21.63 
 
 		 733 aa  72.8  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 824 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.97 
 
 		 676 aa  72  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  25.96 
 
 		 614 aa  72  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  25.96 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 614 aa  72  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  25.96 
 
 		 614 aa  72  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  21.33 
 
 		 603 aa  71.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 767 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  22.85 
 
 		 808 aa  71.2  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.74 
 
 		 622 aa  71.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 		 423 aa  70.1  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  26.34 
 
 		 349 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  25.99 
 
 		 1596 aa  70.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 602 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  14.56 
 
 		 2059 aa  70.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.08 
 
 		 568 aa  69.3  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 700 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  22.73 
 
 		 395 aa  68.9  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 718 aa  68.9  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 614 aa  68.2  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.64 
 
 		 639 aa  67.4  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 1406 aa  67.4  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  20.39 
 
 		 837 aa  67  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.82 
 
 		 1486 aa  67  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 766 aa  67  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  26.08 
 
 		 1082 aa  66.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7095  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.95 
 
 		 354 aa  66.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.524118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  22.57 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  24.08 
 
 		 3301 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  21.43 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 583 aa  66.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0732  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 706 aa  65.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  22.37 
 
 		 643 aa  65.5  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0600  TPR repeat-containing protein  25.65 
 
 		 1112 aa  65.1  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.272318  normal  0.386774 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.69 
 
 		 764 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  25.3 
 
 		 780 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  27.34 
 
 		 646 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.51 
 
 		 883 aa  63.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  26.91 
 
 		 620 aa  63.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.04 
 
 		 818 aa  63.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  29.54 
 
 		 952 aa  62.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  24.19 
 
 		 875 aa  62.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.24 
 
 		 2240 aa  62.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.8 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 754 aa  62  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>