124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1145 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1145  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  332  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  90.36 
 
 		 166 aa  305  3e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  87.95 
 
 		 166 aa  280  6.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  35.81 
 
 		 169 aa  85.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  31.45 
 
 		 154 aa  82  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  34.9 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  42.05 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  42.05 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  42.05 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  43.18 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  41.49 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  39.29 
 
 		 270 aa  72  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  42.68 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  42.68 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  31.72 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0712  RDD domain-containing protein  30.61 
 
 		 634 aa  66.6  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  33.99 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  36.84 
 
 		 406 aa  65.1  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  33.1 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  29.56 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  36.36 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11690  RDD domain-containing membrane protein  41.33 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.270076  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0678  RDD domain-containing protein  30.2 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.416032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0744  hypothetical protein  32.69 
 
 		 166 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  37.65 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 165 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.58 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  36.47 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1054  RDD  36.71 
 
 		 138 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2772  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.091609  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  37.5 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  31.37 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  28.28 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  29.33 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03632  hypothetical protein  31.37 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0491  RDD family protein  27.59 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.628984  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3079  RDD  33 
 
 		 137 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.714918  normal  0.0142272 
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  30.43 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  30.14 
 
 		 170 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2080  hypothetical protein  30.97 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000185398  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  30.97 
 
 		 202 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002431  hypothetical protein  32.68 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0643141  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1260  RDD protein  29.93 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2381  RDD domain-containing protein  39.56 
 
 		 414 aa  51.2  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  30 
 
 		 258 aa  51.2  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0539  RDD domain containing protein  33.33 
 
 		 163 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0129887  normal  0.865312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0529  membrane protein  28.57 
 
 		 158 aa  51.2  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000865076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1995  putative transmembrane protein  36.59 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0098  RDD domain containing protein  29.14 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1375  SecF protein  30.2 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.905726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  27.1 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  32.71 
 
 		 261 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0161  RDD  22.64 
 
 		 328 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1181  RDD domain-containing protein  29.88 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.800713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1722  RDD domain-containing protein  39.76 
 
 		 403 aa  49.7  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166004 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  29.41 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2232  RDD domain containing protein  32.26 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.309406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  31.03 
 
 		 150 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1509  hypothetical protein  40.48 
 
 		 375 aa  48.9  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2675  RDD domain-containing protein  29.14 
 
 		 306 aa  48.5  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  34.94 
 
 		 274 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  30.07 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0726  RDD domain containing protein  29.05 
 
 		 156 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  25.87 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  26.71 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04050  RDD family protein  28.12 
 
 		 424 aa  48.5  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2102  hypothetical protein  27.63 
 
 		 147 aa  48.1  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.987971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2514  RDD domain-containing protein  40.51 
 
 		 453 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2823  RDD domain-containing protein  28.66 
 
 		 169 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.794501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2856  RDD domain-containing protein  37.5 
 
 		 375 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000762039 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  33.85 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1371  hypothetical protein  28.05 
 
 		 169 aa  47.4  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1061  RDD domain containing protein  30.72 
 
 		 211 aa  47.8  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2906  RDD domain-containing protein  28.05 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.110625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3003  RDD domain-containing protein  28.05 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0105822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2662  RDD domain-containing protein  38.75 
 
 		 412 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2369  RDD domain-containing protein  39.74 
 
 		 398 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2684  RDD domain-containing protein  38.75 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0059123  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1683  RDD domain-containing protein  36.36 
 
 		 424 aa  47  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0350832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2763  RDD domain-containing protein  38.75 
 
 		 412 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.136751  hitchhiker  0.000413792 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1079  RDD domain-containing protein  26.95 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0504563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1700  RDD domain containing protein  38.75 
 
 		 415 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.6304  hitchhiker  0.00000345448 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0425  RDD protein  26.35 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0398  RDD domain-containing protein  28.67 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.173398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1909  RDD domain containing protein  31.45 
 
 		 146 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  27.15 
 
 		 185 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1501  RDD domain-containing protein  38.75 
 
 		 444 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.561992  hitchhiker  0.000145013 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1568  RDD domain-containing protein  38.75 
 
 		 448 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.957894  normal  0.02442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1562  RDD domain-containing protein  38.75 
 
 		 449 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0211691 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0431  RDD domain-containing protein  30.41 
 
 		 151 aa  45.8  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3418  RDD domain-containing protein  34.15 
 
 		 393 aa  45.4  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2081  hypothetical protein  30.58 
 
 		 176 aa  45.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.820428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0542  RDD family protein  31.4 
 
 		 216 aa  45.1  0.0005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4558  RDD domain-containing protein  41.38 
 
 		 272 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3106  RDD domain-containing protein  26.83 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0613937  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3769  RDD domain containing protein  36.67 
 
 		 258 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.469918 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3116  RDD domain-containing protein  26.83 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.181309  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0474  hypothetical protein  24.49 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.647005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3259  RDD domain-containing protein  26.83 
 
 		 169 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00807306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3579  RDD domain containing protein  34.62 
 
 		 265 aa  45.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000310569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>