More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3712 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  100 
 
 		 307 aa  641    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  75.74 
 
 		 308 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  71.34 
 
 		 305 aa  462  1e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  56.52 
 
 		 304 aa  362  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  54.9 
 
 		 308 aa  352  4e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  54.25 
 
 		 303 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  38.13 
 
 		 296 aa  204  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  32.44 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.8 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  38.1 
 
 		 149 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  35.62 
 
 		 149 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.44 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  33.1 
 
 		 147 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 147 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.39 
 
 		 147 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  33.79 
 
 		 148 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  25.74 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.47 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 160 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  28.18 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.57 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.4 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 151 aa  75.5  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  24.37 
 
 		 285 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  24.19 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  24.04 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  25.56 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  30.28 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  31.71 
 
 		 150 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  27.5 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.6 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.28 
 
 		 151 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  27.17 
 
 		 288 aa  70.1  0.00000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  24.3 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  25.72 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  26.32 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.86 
 
 		 274 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27.6 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  30.67 
 
 		 149 aa  67  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  33.55 
 
 		 138 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  30.49 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  25.45 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  28.57 
 
 		 151 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  32.64 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.68 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  31.47 
 
 		 145 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  25 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  33.12 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  28.57 
 
 		 148 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  25.08 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 		 138 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.3 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  30.72 
 
 		 151 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.52 
 
 		 314 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  30.82 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  28.66 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4076  UspA domain protein  26.57 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.686885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.7 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2050  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  26.92 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.450915  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  28.57 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  23.45 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  24.46 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  30.19 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  30.19 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  25 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  22.44 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  23.62 
 
 		 301 aa  58.9  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  25.99 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  25 
 
 		 157 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  24.05 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 161 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  26.86 
 
 		 297 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  26.38 
 
 		 156 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  28.71 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 148 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  25 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  25.32 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  30.46 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  31.03 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  23.95 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  29.75 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  22.33 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  26.98 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  28.57 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  24.81 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  26.58 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  27.81 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45150  universal stress protein  27.72 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 151 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  25.98 
 
 		 278 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2171  UspA domain-containing protein  29.27 
 
 		 145 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.198814  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 137 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  26.83 
 
 		 168 aa  54.7  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>