More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3746 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3746  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 513 aa  1056    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2178  extracellular solute-binding protein  41.55 
 
 		 529 aa  426  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.246301  normal  0.618007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0409  extracellular solute-binding protein  43.69 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4497  extracellular solute-binding protein family 5  40.39 
 
 		 529 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.122706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2183  extracellular solute-binding protein  40 
 
 		 529 aa  399  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.226598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4502  extracellular solute-binding protein family 5  40.7 
 
 		 526 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.146925  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6426  extracellular solute-binding protein family 5  40.19 
 
 		 529 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312111 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2781  extracellular solute-binding protein  40.43 
 
 		 525 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5072  extracellular solute-binding protein  40.74 
 
 		 519 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  0.758542 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6105  extracellular solute-binding protein family 5  38.42 
 
 		 518 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0000312198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3074  extracellular solute-binding protein  38.88 
 
 		 536 aa  368  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6591  extracellular solute-binding protein  39.22 
 
 		 540 aa  365  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.476219 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1495  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  38.01 
 
 		 538 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.045715  hitchhiker  0.00127227 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3816  twin-arginine translocation pathway signal  36.42 
 
 		 522 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.961587  normal  0.0948956 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6279  extracellular solute-binding protein family 5  38.91 
 
 		 512 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6090  extracellular solute-binding protein family 5  37.82 
 
 		 538 aa  356  6.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.194048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1820  twin-arginine translocation pathway signal  38.06 
 
 		 527 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.575663  normal  0.77509 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0058  extracellular solute-binding protein  37.82 
 
 		 539 aa  352  8e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.112335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5634  extracellular solute-binding protein family 5  38.48 
 
 		 540 aa  352  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6276  extracellular solute-binding protein family 5  39.52 
 
 		 496 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0695772 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0786  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  39.46 
 
 		 526 aa  349  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3525  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  38.89 
 
 		 535 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2187  extracellular solute-binding protein  37.3 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.843737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6274  extracellular solute-binding protein family 5  36.1 
 
 		 511 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0245039 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3169  extracellular solute-binding protein  38.89 
 
 		 535 aa  348  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.116403 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  37.69 
 
 		 545 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5666  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  36.91 
 
 		 537 aa  343  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5594  extracellular solute-binding protein  38.4 
 
 		 535 aa  342  8e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459863  normal  0.392289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0249  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  37.31 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2843  extracellular solute-binding protein  38.27 
 
 		 535 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1922  putative ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  37.11 
 
 		 535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.92103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5006  extracellular solute-binding protein family 5  36.91 
 
 		 536 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.264167 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3699  extracellular solute-binding protein  36.06 
 
 		 527 aa  330  6e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5304  extracellular solute-binding protein family 5  37.04 
 
 		 536 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.85757 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6354  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 		 527 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6057  extracellular solute-binding protein  37.17 
 
 		 527 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6444  twin-arginine translocation pathway signal  37.37 
 
 		 527 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6679  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component  37.37 
 
 		 527 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6277  extracellular solute-binding protein  37.37 
 
 		 527 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0281814  normal  0.114415 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3524  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  39.34 
 
 		 534 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.413747  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3168  extracellular solute-binding protein  39.34 
 
 		 534 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1543  extracellular solute-binding protein family 5  36.51 
 
 		 513 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.397228  normal  0.410252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2914  extracellular solute-binding protein family 5  34.96 
 
 		 537 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2844  extracellular solute-binding protein  37.26 
 
 		 534 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.922612  normal  0.415189 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2945  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 509 aa  307  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4961  extracellular solute-binding protein  34.18 
 
 		 537 aa  306  6e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0376726  normal  0.0265573 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  30.3 
 
 		 516 aa  226  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  30.56 
 
 		 538 aa  219  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0953  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 532 aa  206  6e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.509853  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.88 
 
 		 516 aa  205  1e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3559  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5589  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.333853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3635  extracellular solute-binding protein  26.11 
 
 		 515 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.014259  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  27.35 
 
 		 502 aa  176  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1086  extracellular solute-binding protein  26.93 
 
 		 523 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0576  extracellular solute-binding protein family 5  27.27 
 
 		 533 aa  174  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  27.91 
 
 		 538 aa  174  5e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3756  putative peptide ABC transporter, substrate- binding protein  25.89 
 
 		 514 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0279615  normal  0.332846 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 495 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  27.05 
 
 		 522 aa  164  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1039  extracellular solute-binding protein family 5  26.48 
 
 		 503 aa  163  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.78614  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5692  extracellular solute-binding protein family 5  25.42 
 
 		 555 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.142163 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  26.85 
 
 		 521 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6371  extracellular solute-binding protein family 5  30.19 
 
 		 504 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.37487 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2653  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 517 aa  160  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0051152  normal  0.33796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  27.84 
 
 		 519 aa  159  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6191  extracellular solute-binding protein family 5  29.98 
 
 		 504 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172417  normal  0.779113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1417  twin-arginine translocation pathway signal  26.57 
 
 		 555 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  0.153951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3332  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 517 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2073  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 517 aa  156  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.610417  normal  0.462432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2156  extracellular solute-binding protein  27.53 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.470572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 561 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  26.78 
 
 		 554 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3852  extracellular solute-binding protein  27.81 
 
 		 521 aa  150  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0773863  normal  0.697886 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  26.18 
 
 		 554 aa  150  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1360  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 		 543 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0151381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3973  extracellular solute-binding protein family 5  28.94 
 
 		 505 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617507  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  27.08 
 
 		 520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2078  extracellular solute-binding protein  25.19 
 
 		 550 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0155484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1961  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.82 
 
 		 513 aa  147  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.386989 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.84 
 
 		 531 aa  145  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.34 
 
 		 510 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2062  twin-arginine translocation pathway signal  26.98 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.511061  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3049  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 		 554 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  27.72 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2463  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 555 aa  141  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.31086  hitchhiker  0.000559828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  26.46 
 
 		 505 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0077  extracellular solute-binding protein family 5  25.84 
 
 		 501 aa  140  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0074  twin-arginine translocation pathway signal  26.7 
 
 		 514 aa  140  7.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0403886  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.04 
 
 		 516 aa  139  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0112  extracellular solute-binding protein family 5  23.5 
 
 		 524 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.214652  normal  0.175509 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3338  extracellular solute-binding protein  26.36 
 
 		 524 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2032  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 524 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.662418  normal  0.30348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0232  extracellular solute-binding protein  26.14 
 
 		 517 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.91 
 
 		 542 aa  136  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  28.71 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  26.21 
 
 		 514 aa  136  9.999999999999999e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3603  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 542 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1632  extracellular solute-binding protein family 5  27.36 
 
 		 517 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  25.05 
 
 		 503 aa  136  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>